data: 精炼已有 avogadro/imagej/origin/ovito/pymol/vesta 任务的 metadata steps
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"possibility_of_env_change": "low",
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"metadata": {
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"input_files": [],
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"steps": "1. 在 PyMOL 命令行中输入 `fetch 1nmr` 来加载 NMR ensemble。\n2. 输入 `mplay` 命令开始播放动画。\n3. 如果需要停止播放动画，输入 `mstop` 。"
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"steps": "1. 单击界面上的 PyMOL 命令行输入框，将光标定位到该输入框。\n2. 在命令行输入框中输入文本 fetch 1nmr。\n3. 按下键盘上的回车键 (Enter) 执行命令，加载 NMR ensemble。\n4. 再次单击界面上的 PyMOL 命令行输入框。\n5. 在命令行输入框中输入文本 mplay。\n6. 按下键盘上的回车键 (Enter) 执行命令，开始播放动画。\n7. 再次单击界面上的 PyMOL 命令行输入框。\n8. 在命令行输入框中输入文本 mstop。\n9. 按下键盘上的回车键 (Enter) 执行命令，停止播放动画。",
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"steps_original": "1. 在 PyMOL 命令行中输入 `fetch 1nmr` 来加载 NMR ensemble。\n2. 输入 `mplay` 命令开始播放动画。\n3. 如果需要停止播放动画，输入 `mstop` 。"
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"possibility_of_env_change": "low",
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"metadata": {
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"input_files": [],
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"steps": "1. 从菜单中选择适当选项，用于创建场景绕 Y 轴旋转的动画。\n2. 按下“Pressplay”开始播放动画。"
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"steps": "1. 在顶部菜单栏中，单击“Movie”菜单以展开下拉列表。\n2. 在展开的下拉菜单中，将鼠标悬停在“Program”选项上以展开子菜单。\n3. 在展开的子菜单中，将鼠标悬停在“Camera Loop”选项上以展开下一级菜单。\n4. 在下一级菜单中，将鼠标悬停在“Y-Roll”选项上（对应教程中的 Y-axis roll）以展开动画时长选项菜单。\n5. 在展开的时长列表中，单击所需的动画时长选项（例如“8 seconds”）以生成绕 Y 轴 360 度旋转的场景动画。\n6. 在 PyMOL 主界面底部或右下角的动画控制面板中，单击“Play”按钮（对应教程中的 Press play）以开始播放动画。",
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"steps_original": "1. 从菜单中选择适当选项，用于创建场景绕 Y 轴旋转的动画。\n2. 按下“Pressplay”开始播放动画。"
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"possibility_of_env_change": "low",
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"metadata": {
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"input_files": [],
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"steps": "1. 从菜单中选择用于设置场景摇摆动画的选项。\n2. 选择摇摆角度（例如 30、60、90、120 或 180 度）。\n3. 按下“Pressplay”启动动画。"
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"steps": "1. 单击顶部菜单栏的 \"Movie\" 菜单项。\n2. 在展开的下拉菜单中，将鼠标悬停并单击 \"Program\" 选项以展开子菜单。\n3. 在弹出的级联菜单中，将鼠标悬停并单击 \"Camera Loop\" 选项以展开下一级菜单。\n4. 在弹出的级联菜单中，将鼠标悬停并单击 \"X-Rock\" 或 \"Y-Rock\"（摇摆轴向）子菜单。\n5. 在弹出的角度选项列表中，单击选中所需的摇摆角度（例如包含 \"30 deg.\", \"60 deg.\", \"90 deg.\", \"120 deg.\" 或 \"180 deg.\" 的选项）。\n6. 单击主界面右下方控制面板中的 \"Play\"（播放）按钮启动动画。",
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"steps_original": "1. 从菜单中选择用于设置场景摇摆动画的选项。\n2. 选择摇摆角度（例如 30、60、90、120 或 180 度）。\n3. 按下“Pressplay”启动动画。"
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"possibility_of_env_change": "low",
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"metadata": {
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"input_files": [],
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"steps": "1. 从菜单中选择制作摇摆动画的选项。\n2. 设置摇摆效果参数。\n3. 按下“Pressplay”启动摇摆动画。"
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"steps": "1. 单击顶部菜单栏中的 \"Movie\" 菜单项。\n2. 在弹出的下拉菜单中，将鼠标光标悬停在 \"Program\" 菜单项上以展开子菜单。\n3. 在展开的子菜单中，将鼠标光标悬停在 \"Camera Loop\" 菜单项上以展开下一级菜单。\n4. 在下一级菜单中，将鼠标光标悬停在 \"Nutate\" 菜单项上以展开参数预设列表。\n5. 在展开的参数预设列表中，单击选中需要的摇摆角度和时长选项（例如默认的预设时长选项）以应用摇摆效果。\n6. 在软件界面底部或右下角的动画控制面板中，单击带有向右三角形图标的 \"Play\" 按钮启动动画。",
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"steps_original": "1. 从菜单中选择制作摇摆动画的选项。\n2. 设置摇摆效果参数。\n3. 按下“Pressplay”启动摇摆动画。"
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"possibility_of_env_change": "low",
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"metadata": {
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"input_files": [],
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"steps": "1. 创建一个场景并设置为缩放到特定原子。\n2. 保存该场景。\n3. 使用 PyMOL 中的 Scene Loop 功能连接多个保存的场景。\n4. 播放动画以观察缩放效果。"
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"steps": "1. 单击 PyMOL 界面上方的命令行输入框，将光标定位到该输入框。\n2. 通过键盘在输入框中输入命令：load $TUT/1hpv.pdb。\n3. 按下键盘上的 Enter 键执行加载模型操作。\n4. 单击界面顶部菜单栏中的 \"Scene\" 菜单项。\n5. 在弹出的下拉菜单中，将鼠标光标悬停在 \"Store\" 选项上以展开侧边子菜单。\n6. 在展开的侧边子菜单中，单击 \"F1\" 选项，将初始全局视图保存为场景一。\n7. 将鼠标移动到 3D 渲染视图区域，左键单击分子模型上的某一个具体原子，使其高亮选中。\n8. 在界面右侧的对象列表控制面板中，找到自动生成的 \"(sele)\" 对象所在行，单击该行右侧的 \"A\"（Action）按钮。\n9. 在弹出的下拉动作菜单中，单击 \"zoom\" 选项，使摄像机视角缩放并聚焦到刚选中的原子上。\n10. 再次单击界面顶部菜单栏中的 \"Scene\" 菜单项。\n11. 在弹出的下拉菜单中，将鼠标光标悬停在 \"Store\" 选项上以展开侧边子菜单。\n12. 在展开的侧边子菜单中，单击 \"F2\" 选项，将当前的局部缩放视图保存为场景二。\n13. 在界面右侧的对象列表控制面板中，找到 \"1hpv\" 对象所在行，单击该行右侧的 \"A\"（Action）按钮。\n14. 在弹出的下拉动作菜单中，单击 \"zoom\" 选项，使摄像机视角缩小并退回到展示整个分子的全局视图。\n15. 第三次单击界面顶部菜单栏中的 \"Scene\" 菜单项。\n16. 在弹出的下拉菜单中，将鼠标光标悬停在 \"Store\" 选项上以展开侧边子菜单。\n17. 在展开的侧边子菜单中，单击 \"F3\" 选项，将恢复后的全局视图保存为场景三。\n18. 单击界面顶部菜单栏中的 \"Movie\" 菜单项。\n19. 在弹出的下拉菜单中，将鼠标光标悬停在 \"Program\" 选项上以展开侧边子菜单。\n20. 在展开的侧边子菜单中，将鼠标光标悬停在 \"Scene Loop\" 选项上展开下一级选项列表。\n21. 在下一级选项列表中，单击 \"Steady\" 选项，命令程序自动为已保存的场景序列生成平滑补间动画帧。\n22. 单击主界面底部播放控制区域右下角的 \"Play\"（向右三角形图标）按钮，播放生成的动画以观察镜头的缩放与返回效果。",
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"steps_original": "1. 创建一个场景并设置为缩放到特定原子。\n2. 保存该场景。\n3. 使用 PyMOL 中的 Scene Loop 功能连接多个保存的场景。\n4. 播放动画以观察缩放效果。"
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"possibility_of_env_change": "low",
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"metadata": {
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"input_files": [],
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"steps": "1. 点击菜单栏中的 Movie。\n2. 从下拉菜单中选择 Append。\n3. 在 Append 子菜单中选择 2 seconds。"
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"steps": "1. 在主界面的顶部菜单栏中，单击 \"Movie\" 菜单项。\n2. 在展开的下拉菜单中，将鼠标悬停在 \"Append\" 选项上以展开其子菜单。\n3. 在弹出的 \"Append\" 子菜单中，单击 \"2 seconds\" 选项。",
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"steps_original": "1. 点击菜单栏中的 Movie。\n2. 从下拉菜单中选择 Append。\n3. 在 Append 子菜单中选择 2 seconds。"
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"possibility_of_env_change": "low",
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"metadata": {
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"input_files": [],
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"steps": "1. 在 PyMOL 的底部工具栏上点击 All。\n2. 从下拉菜单中选择 ALA。\n3. 在 ALA 菜单中选择 Motions。\n4. 浏览显示的运动/位置选项。"
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"steps": "1. 在 PyMOL 界面右上方的对象控制面板中，定位到名为 \"ala\" 的对象所在行。\n2. 在 \"ala\" 对象所在行，单击最右侧的字母 \"M\" 按钮（代表 Motions）。\n3. 观察并浏览弹出的 \"Object 'ala' Motion:\" 下拉菜单，查看其中的 \"store\"、\"clear\"、\"smooth\" 等运动和位置选项。",
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"steps_original": "1. 在 PyMOL 的底部工具栏上点击 All。\n2. 从下拉菜单中选择 ALA。\n3. 在 ALA 菜单中选择 Motions。\n4. 浏览显示的运动/位置选项。"
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"metadata": {
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"input_files": [],
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"steps": "1. 点击菜单栏中的 Movie。\n2. 从下拉菜单中选择 Frame Rate。\n3. 在 Frame Rate 子菜单中选择 15 FPS。"
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"steps": "1. 点击界面顶部菜单栏中的 \"Movie\" 菜单。\n2. 在展开的下拉菜单中，将鼠标悬停在 \"Frame Rate\" 菜单项上以展开子菜单。\n3. 在 \"Frame Rate\" 的子菜单中，点击选择 \"15 FPS\"。",
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"steps_original": "1. 点击菜单栏中的 Movie。\n2. 从下拉菜单中选择 Frame Rate。\n3. 在 Frame Rate 子菜单中选择 15 FPS。"
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"possibility_of_env_change": "low",
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"metadata": {
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"input_files": [],
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"steps": "1. 点击菜单栏中的 Scene。\n2. 从下拉菜单中选择 Store。\n3. 在弹出的窗口中输入 'my_scene' 作为场景名称。\n4. 点击确认按钮存储场景。"
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"steps": "1. 在顶部菜单栏中，单击 \"Scene\" 菜单项。\n2. 在弹出的下拉菜单中，单击 \"Store\" 选项。\n3. 在弹出的场景名称输入窗口中，单击以将光标定位到文本输入框。\n4. 在该输入框中，清空原有内容并输入文字 \"my_scene\"。\n5. 单击窗口中的确认（或 \"OK\"）按钮以完成场景存储。",
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"steps_original": "1. 点击菜单栏中的 Scene。\n2. 从下拉菜单中选择 Store。\n3. 在弹出的窗口中输入 'my_scene' 作为场景名称。\n4. 点击确认按钮存储场景。"
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"possibility_of_env_change": "low",
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"metadata": {
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"input_files": [],
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"steps": "1. 点击菜单栏中的 Scene。\n2. 从下拉菜单中选择 Clear。\n3. 在确认对话框中点击是以清除所有场景。"
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"steps": "1. 在软件界面顶部的菜单栏中，单击 \"Scene\" 菜单项。\n2. 在弹出的下拉菜单中，单击 \"Clear\" 选项。\n3. 在弹出的确认对话框中，单击 \"是\"（或 \"Yes\"）按钮以确认清除所有场景。",
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"steps_original": "1. 点击菜单栏中的 Scene。\n2. 从下拉菜单中选择 Clear。\n3. 在确认对话框中点击是以清除所有场景。"
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"metadata": {
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"steps": "1. 点击菜单栏中的 Mouse。\n2. 从下拉菜单中选择 Edit。\n3. 在 Edit 菜单中选择 Motions。\n4. 在弹出的子菜单中选择 3 Button Motions。"
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"steps": "1. 在软件顶部的菜单栏中，单击 \"Mouse\" 菜单以展开下拉列表。\n2. 在展开的下拉菜单中，单击选中 \"3 Button Motions\" 选项。",
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"steps_original": "1. 点击菜单栏中的 Mouse。\n2. 从下拉菜单中选择 Edit。\n3. 在 Edit 菜单中选择 Motions。\n4. 在弹出的子菜单中选择 3 Button Motions。"
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"possibility_of_env_change": "low",
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"metadata": {
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"input_files": [],
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"steps": "1. 打开 PyMOL 软件并加载任意结构。\n2. 通过 Wizard → Mutagenesis 打开 Mutagenesis 工具。\n3. 查看 Mutagenesis 工具中指定区域的颜色提示。\n4. 确认颜色解释：绿色表示轻微重叠，红色表示显著重叠。\n5. 使用颜色信息选择适当的操作来优化结构。"
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"steps": "1. 在顶部菜单栏中，单击 \"File\" 菜单\n2. 在下拉菜单中，单击 \"Open...\" 选项\n3. 在弹出的文件选择对话框中，选中任意一个 PDB 格式的结构文件，单击 \"Open\" 按钮加载结构\n4. 在顶部菜单栏中，单击 \"Wizard\" 菜单\n5. 在下拉菜单中，单击 \"Mutagenesis\" 选项，打开屏幕右下角的 Mutagenesis 向导面板\n6. 在中间的 PyMOL 三维视图窗口中，单击鼠标左键选中需要分析的氨基酸残基\n7. 在右下角的 Mutagenesis 向导面板中，单击 \"No Mutation\" 按钮\n8. 在弹出的下拉菜单中，单击选择一个目标的突变氨基酸类型\n9. 在三维视图窗口中，观察突变体周围出现的范德华半径重叠提示（彩色线条和圆盘）\n10. 在屏幕右下角的动画控制区域，单击 \"后退\" (向左箭头) 或 \"前进\" (向右箭头) 按钮，以切换当前残基的不同旋转异构体 (rotamers)\n11. 在切换过程中观察视图窗口，定位到显示短绿线或小绿色圆盘（表示轻微重叠/良好接触）最多，且没有大红色圆盘（表示显著碰撞/范德华重叠）的构象帧\n12. 在右下角的 Mutagenesis 向导面板中，单击 \"Apply\" 按钮应用选定的、无显著重叠的构象\n13. 在右下角的 Mutagenesis 向导面板中，单击 \"Done\" 按钮关闭突变工具",
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"steps_original": "1. 打开 PyMOL 软件并加载任意结构。\n2. 通过 Wizard → Mutagenesis 打开 Mutagenesis 工具。\n3. 查看 Mutagenesis 工具中指定区域的颜色提示。\n4. 确认颜色解释：绿色表示轻微重叠，红色表示显著重叠。\n5. 使用颜色信息选择适当的操作来优化结构。"
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"possibility_of_env_change": "low",
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"metadata": {
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"input_files": [],
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"steps": "1. 确保所有需要的对象和场景已设置好。\n2. 点击菜单栏 File → Save Session。\n3. 在弹出的窗口中命名文件并保存为 .pse 格式。\n4. 确认会话被成功保存。"
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"steps": "1. 单击桌面软件顶部菜单栏上的 \"File\" 菜单项\n2. 在展开的下拉菜单中，单击选中 \"Save Session...\" 或 \"Save Session As...\" 选项\n3. 在弹出的系统文件保存对话框中，单击 \"文件名\" (或 File name) 输入框以定位光标\n4. 清空已有内容，在输入框中输入所需保存的文件名称（建议带上 .pse 后缀，例如 current_session.pse）\n5. 单击对话框底部的 \"保存\" (或 Save) 按钮完成文件保存",
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"steps_original": "1. 确保所有需要的对象和场景已设置好。\n2. 点击菜单栏 File → Save Session。\n3. 在弹出的窗口中命名文件并保存为 .pse 格式。\n4. 确认会话被成功保存。"
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