data: 精炼已有 avogadro/imagej/origin/ovito/pymol/vesta 任务的 metadata steps
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"steps": "1. 打开 Template Tool(快捷键 Ctrl+3 或点击工具栏图标)。\n2. 切换到 Centers 选项卡。\n3. 输入 'Co' 或从弹出菜单中选择钴元素。\n4. 点击三次 '+' 符号,将正电荷设置为 +3。\n5. 按键 '6' 或选择八面体几何形状。\n6. 点击空白区域,放置钴中心,六个氢原子会显示在配位位置。"
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"steps": "1. 按下键盘快捷键 Ctrl+3(或在顶部工具栏中单击 Template Tool 图标),激活模板工具。\n2. 在左侧(或右侧)的模板工具控制面板中,单击选中 Centers 选项卡。\n3. 在键盘上依次输入字母 C 和 o,以选择 Cobalt (钴) 元素作为金属中心。\n4. 在键盘上连续按下三次 + 键,将中心离子的形式电荷设置为 +3。\n5. 在键盘上按下数字键 6,设定配位几何形状为 Octahedral (八面体)。\n6. 将鼠标移动到主界面的 3D 视图空白区域,单击鼠标左键,放置带有六个配位氢原子的钴中心结构。\n7. 在模板工具控制面板中,单击选中 Ligands 选项卡(或按下键盘的右方向键)。\n8. 在键盘上按下字母键 n,在配体库中选择 ammine (NH3) 配体。\n9. 在 3D 视图中,将鼠标悬停并单击钴原子上的第 1 个氢原子,将其替换为氨配体。\n10. 在 3D 视图中,单击钴原子上的第 2 个氢原子,将其替换为氨配体。\n11. 在 3D 视图中,单击钴原子上的第 3 个氢原子,将其替换为氨配体。\n12. 在 3D 视图中,单击钴原子上的第 4 个氢原子,将其替换为氨配体。\n13. 在 3D 视图中,单击钴原子上的第 5 个氢原子,将其替换为氨配体。\n14. 在 3D 视图中,单击钴原子上的第 6 个氢原子,将其替换为氨配体,完成 [Co(NH3)6]3+ 化合物的构建。",
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"steps_original": "1. 打开 Template Tool(快捷键 Ctrl+3 或点击工具栏图标)。\n2. 切换到 Centers 选项卡。\n3. 输入 'Co' 或从弹出菜单中选择钴元素。\n4. 点击三次 '+' 符号,将正电荷设置为 +3。\n5. 按键 '6' 或选择八面体几何形状。\n6. 点击空白区域,放置钴中心,六个氢原子会显示在配位位置。"
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"steps": "1. 打开 Template Tool。\n2. 切换到 Centers 选项卡。\n3. 输入 'Ni' 或从弹出菜单中选择镍元素。\n4. 点击两次 '+' 符号,将正电荷设置为 +2。\n5. 按键 '44' 或选择平面四方几何形状。\n6. 点击空白区域,放置镍中心,四个氢原子会显示在配位位置。"
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"steps": "1. 在顶部工具栏中,单击 'Template Tool' 图标按钮(或在键盘上按 Ctrl+3 快捷键)以激活模板工具面板。\n2. 在弹出的模板工具面板中,单击顶部名为 'Centers' 的选项卡。\n3. 在键盘上依次输入字母键 'N' 和 'i',或单击元素下拉菜单并选择 'Nickel',以选中镍元素。\n4. 在键盘上连续按两次 '+' 键,将中心离子的形式电荷设置为 '+2'。\n5. 在键盘上连续按两次数字键 '4',或单击几何形状下拉菜单并选择 'Square Planar',以设置平面四方配位几何构型。\n6. 将鼠标移动到 3D 模型视图的空白区域,单击鼠标左键以放置带有四个占位氢原子的镍中心。\n7. 在模板工具面板中,单击顶部名为 'Ligands' 的选项卡切换到配体模式。\n8. 在键盘上依次输入字母键 'e' 和 'n',以在配体库中选中 'ethylenediamine' (乙二胺) 配体。\n9. 在 3D 视图中,单击选中中心镍原子周围的任意一个氢原子。\n10. 在 3D 视图中,单击与上一步选中的氢原子相邻(顺式位置)的另一个氢原子,完成双齿配体的桥接结合。\n11. 在键盘上输入字母键 'n',以在配体库中切换选中 'ammine' (氨) 配体。\n12. 在 3D 视图中,单击剩余的第三个占位氢原子将其替换为氨配体。\n13. 在 3D 视图中,单击最后一个剩余的氢原子,将其替换为第二个氨配体,完成目标化合物构建。",
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"steps_original": "1. 打开 Template Tool。\n2. 切换到 Centers 选项卡。\n3. 输入 'Ni' 或从弹出菜单中选择镍元素。\n4. 点击两次 '+' 符号,将正电荷设置为 +2。\n5. 按键 '44' 或选择平面四方几何形状。\n6. 点击空白区域,放置镍中心,四个氢原子会显示在配位位置。"
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"steps": "1. 打开 Template Tool,点击 Centers 选项卡。\n2. 输入 'Zr' 或选择锆元素。\n3. 点击四次 '+',将正电荷设置为 +4。\n4. 按键 '4',选择四面体几何形状。\n5. 在空白区域放置锆中心。\n6. 切换到 Ligands 选项卡,输入 'cp' 或选择环戊二烯基。\n7. 点击一个氢原子,添加第一个 Cp 配体。\n8. 点击相邻氢,添加第二个 Cp 配体。\n9. 切换到 Draw Tool(快捷键 Ctrl+2)。\n10. 选择 Cl 元素。\n11. 点击两个剩余氢原子,每次点击替换为氯配体。"
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"steps": "1. 在键盘上按下快捷键 Ctrl+3,或在工具栏中单击 \"Template Tool\" 图标按钮以激活模板工具。\n2. 在左侧界面的 Template Tool 设置面板中,单击选中 \"Centers\" 选项卡。\n3. 在键盘上依次按下字母键 'Z' 和 'r',将中心元素选定为锆 (Zirconium)。\n4. 在键盘上连续按下 '+' 键 4 次,将中心原子的形式电荷 (formal charge) 设置为 +4。\n5. 在键盘上按下数字键 '4',选择四面体 (tetrahedral) 作为配位几何构型。\n6. 将鼠标指针移动到中间的主绘图视口的空白区域,单击鼠标左键,放置一个带有四个氢原子的锆中心骨架。\n7. 在左侧界面的 Template Tool 设置面板中,单击选中 \"Ligands\" 选项卡。\n8. 在键盘上依次按下字母键 'c' 和 'p',选定环戊二烯基 (η5-cyclopentadienyl) 作为配体。\n9. 将鼠标指针移动到主绘图视口中锆中心上的任意一个氢原子球体上,单击鼠标左键,将其替换为第一个 Cp 配体环。\n10. 将鼠标指针移动到与刚才位置相邻的另一个氢原子球体上,单击鼠标左键,将其替换为第二个 Cp 配体环。\n11. 在键盘上按下快捷键 Ctrl+2,或在工具栏中单击 \"Draw Tool\" 图标按钮以切换到绘制工具。\n12. 在左侧界面的 Draw Tool 设置面板中,单击 \"Element\" 右侧的下拉菜单选框。\n13. 在展开的元素列表中,单击选择 \"Chlorine (17)\"(或直接在键盘输入 'Cl' 选择氯元素)。\n14. 将鼠标指针移动到主绘图视口中剩余的第一个氢原子球体上,单击鼠标左键,将其替换为氯配体。\n15. 将鼠标指针移动到主绘图视口中最后一个氢原子球体上,单击鼠标左键,将其替换为第二个氯配体。",
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"steps_original": "1. 打开 Template Tool,点击 Centers 选项卡。\n2. 输入 'Zr' 或选择锆元素。\n3. 点击四次 '+',将正电荷设置为 +4。\n4. 按键 '4',选择四面体几何形状。\n5. 在空白区域放置锆中心。\n6. 切换到 Ligands 选项卡,输入 'cp' 或选择环戊二烯基。\n7. 点击一个氢原子,添加第一个 Cp 配体。\n8. 点击相邻氢,添加第二个 Cp 配体。\n9. 切换到 Draw Tool(快捷键 Ctrl+2)。\n10. 选择 Cl 元素。\n11. 点击两个剩余氢原子,每次点击替换为氯配体。"
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"steps": "1. 点击菜单栏 Build(构建) → Insert(插入) → Molecule(分子…),打开\"插入片段\"对话框。\n2. 在\"筛选\"输入框中输入 benzene(注意:需要先切换到英文输入法再输入)。\n3. 筛选结果会显示一个 aromatics 文件夹(树形结构),需要双击或点击展开该文件夹。\n4. 展开后选中列表中的 benzene.cjson 文件。\n5. 点击\"插入\"按钮将苯环插入到工作区。\n6. 关闭\"插入片段\"对话框,确认苯环已显示在主工作界面中。"
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"steps": "1. 点击菜单栏 Build(构建) → Insert(插入) → Molecule(分子…),打开\"插入片段\"对话框。\n2. 在\"筛选\"输入框中输入 benzene。\n3. 筛选结果会显示一个 aromatics 文件夹(树形结构),需要双击或点击展开该文件夹。\n4. 展开后选中列表中的 benzene.cjson 文件。\n5. 点击\"插入\"按钮将苯环插入到工作区。\n6. 点击关闭按钮关闭\"插入片段\"对话框,确认苯环已显示在主工作界面中。",
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"steps_original": "1. 点击 Build → Insert → Molecule。\n2. 搜索 'benzene' 并确定插入该分子。\n3. 确保苯环显示在工作界面中。"
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"steps": "1. 按 'N' 键选择硝基。\n2. 点击甲基对位(苯环上的一个氢原子),将其替换为 -NO2。\n3. 确保分子结构正确。"
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"steps": "1. 在键盘上输入大写字母 \"N\"(可使用 Shift + n 组合键),在当前的模板工具中选择硝基(Nitro group)。\n2. 在主界面的 3D 分子视图区中,定位到甲苯分子上与甲基基团直接相对的对位(para position)氢原子。\n3. 单击该对位氢原子,将其替换为硝基(-NO2),以生成 4-硝基甲苯分子。\n4. 按下键盘组合键 \"Ctrl+Alt+O\",运行几何优化(Geometry Optimization),以清理并确保最终分子结构的正确性。",
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"steps_original": "1. 按 'N' 键选择硝基。\n2. 点击甲基对位(苯环上的一个氢原子),将其替换为 -NO2。\n3. 确保分子结构正确。"
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"steps": "1. 按 Ctrl+Alt+O 或点击 Auto Optimize 工具执行几何优化。\n2. 检查分子是否获得合乎逻辑的几何结构。"
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"steps": "1. 在当前激活的 Avogadro 2 主窗口中,按下键盘上的 Ctrl+Alt+O 组合键触发几何优化。\n2. 在主界面的 3D 渲染视图中,观察甲苯分子的空间结构变化。\n3. 等待分子的原子位置停止移动,确认其几何构型已优化至合理的化学结构。",
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"steps_original": "1. 按 Ctrl+Alt+O 或点击 Auto Optimize 工具执行几何优化。\n2. 检查分子是否获得合乎逻辑的几何结构。"
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"steps": "1. 使用 Draw Tool 在界面中绘制一个单碳。\n2. 激活 Template Tool,通过按 Ctrl+3 或点击工具栏上的图标进入 Groups。\n3. 按 'C' 或 'co' 选择羧基。\n4. 点击单碳结构上的一个氢原子,将其替换为羧基。"
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"steps": "1. 在软件主工具栏中,单击选中 \"Draw Tool\" 工具图标。\n2. 在主视窗的空白3D显示区域中,单击鼠标左键,绘制生成一个单碳结构(甲烷,包含一个碳和四个氢)。\n3. 按下键盘快捷键 Ctrl+3(或单击主工具栏上的 Template Tool 图标),激活 \"Template Tool\"。\n4. 在 Template Tool 的面板中,单击选中 \"Groups\" 选项卡(或按键盘右方向键两次切换到该选项卡)。\n5. 在键盘上输入大写字母 C(或输入 co2),以选择羧基(carboxylate)模板。\n6. 将鼠标光标移动到主视窗中刚绘制的单碳结构上,对准其中任意一个氢原子(白色球体)。\n7. 单击鼠标左键,将该氢原子替换为羧基(-COOH),完成结构的添加。",
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"steps_original": "1. 使用 Draw Tool 在界面中绘制一个单碳。\n2. 激活 Template Tool,通过按 Ctrl+3 或点击工具栏上的图标进入 Groups。\n3. 按 'C' 或 'co' 选择羧基。\n4. 点击单碳结构上的一个氢原子,将其替换为羧基。"
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"steps": "1. 插入苯环。\n2. 按 'C' 键选择羧基,并添加到苯环的第 1 个位置。\n3. 按 'N' 键选择硝基,并添加到苯环的第 3 个位置。\n4. 按 'om' 键选择甲氧基,并添加到苯环的第 4 个位置。\n5. 使用优化工具进行几何优化并检查分子是否正确。"
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"steps": "1. 单击顶部菜单栏的 \"Build\"。\n2. 在弹出的下拉菜单中,将鼠标悬停在 \"Insert\" 上以展开子菜单。\n3. 单击子菜单中的 \"Molecule...\",打开分子插入对话框。\n4. 将鼠标光标定位到对话框的搜索输入框中,输入文本 \"benzene\"。\n5. 在下方显示的搜索结果列表中,单击选中 \"benzene\" 项。\n6. 单击对话框上的 \"Insert\" (或对应的确认) 按钮,将苯环插入到主绘图区。\n7. 按下键盘快捷键 `Ctrl+3`,激活 \"Template Tool\"(模板工具)。\n8. 在界面左侧(或右侧)的工具选项面板中,单击选中 \"Groups\" 标签页(或按两次键盘右方向键 `->` 进行切换)。\n9. 在键盘上直接输入大写字母 `C`,以设定当前要添加的官能团为羧基 (Carboxyl)。\n10. 在主绘图区中,单击苯环上的任意一个白色氢原子球(计为位置1),将其替换为羧基。\n11. 在键盘上直接输入大写字母 `N`,以设定当前要添加的官能团为硝基 (Nitro)。\n12. 在主绘图区中,单击苯环上与羧基相隔一个碳原子的白色氢原子球(间位,即位置3),将其替换为硝基。\n13. 在键盘上直接输入小写字母 `om`,以设定当前要添加的官能团为甲氧基 (Methoxy)。\n14. 在主绘图区中,单击苯环上与羧基处于正对面的白色氢原子球(对位,即位置4),将其替换为甲氧基。\n15. 按下键盘快捷键 `Ctrl+Alt+O`,调用优化功能清理并自动调整分子的几何空间构型。",
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"steps_original": "1. 插入苯环。\n2. 按 'C' 键选择羧基,并添加到苯环的第 1 个位置。\n3. 按 'N' 键选择硝基,并添加到苯环的第 3 个位置。\n4. 按 'om' 键选择甲氧基,并添加到苯环的第 4 个位置。\n5. 使用优化工具进行几何优化并检查分子是否正确。"
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"steps": "1. 打开 Avogadro 软件。\n2. 点击菜单栏中的 Analysis。\n3. 从下拉菜单选择 Properties。\n4. 点击 Molecular...。\n5. 在弹出的 'Molecular Properties' 窗口中查看分子的名字和相关信息,例如分子质量、化学式、原子数和键数。"
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"steps": "1. 打开 Avogadro 软件。\n2. 在软件顶部菜单栏中,单击 \"Analysis\" 菜单。\n3. 在弹出的下拉菜单中,单击 \"Properties\" 菜单项以展开下一级子菜单。\n4. 在弹出的子菜单中,单击 \"Molecular...\" 菜单项。\n5. 等待名为 \"Molecular Properties\" 的对话框窗口弹出。\n6. 在 \"Molecular Properties\" 窗口中,查看 \"Molecule Name\" 标签右侧显示的文本,获取分子的 IUPAC 名称。\n7. 在同一个窗口中,继续查看 \"Molecular Mass (g/mol)\"、\"Chemical Formula\"、\"Number of Atoms\" 和 \"Number of Bonds\" 标签右侧对应的属性数值。\n8. 查看完毕后,单击窗口右下角的蓝色 \"OK\" 按钮以关闭该对话框。",
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"steps_original": "1. 打开 Avogadro 软件。\n2. 点击菜单栏中的 Analysis。\n3. 从下拉菜单选择 Properties。\n4. 点击 Molecular...。\n5. 在弹出的 'Molecular Properties' 窗口中查看分子的名字和相关信息,例如分子质量、化学式、原子数和键数。"
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"input_files": [],
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"steps": "1. 打开 Avogadro 软件并加载目标分子的模型。\n2. 通过菜单栏选择 Analyze → Create Surfaces。\n3. 在弹出的 Create Surfaces 对话框中,将 Surface 设置为 'Van der Waals'。\n4. 将 Color By 设置为 'Electrostatic Potential'。\n5. 选择一个电荷模型(例如 'EEM')。\n6. 选择色阶为 'Balance'。\n7. 点击 'Calculate' 按钮开始计算表面。\n8. 等待软件完成计算,点击 'Close' 关闭对话框。"
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"steps": "1. 单击顶部菜单栏的 \"Analyze\" 菜单项。\n2. 在展开的下拉菜单中,单击选中 \"Create Surfaces...\" 选项。\n3. 在弹出的 \"Create Surfaces\" 对话框中,单击 \"Surface:\" 标签右侧的下拉菜单。\n4. 在展开的下拉列表中,单击选中 \"Van der Waals\" 选项。\n5. 单击 \"Color by:\" 标签右侧的第一个下拉菜单。\n6. 在展开的下拉列表中,单击选中 \"Electrostatic Potential\" 选项。\n7. 单击 \"Color by:\" 行右侧的第二个下拉菜单(位于 Electrostatic Potential 右侧)。\n8. 在展开的下拉列表中,单击选中 \"EEM\" 选项。\n9. 单击 \"Colormap:\" 标签右侧的下拉菜单。\n10. 在展开的下拉列表中,单击选中 \"Balance\" 选项。\n11. 单击对话框左下角的 \"Calculate\" 按钮。\n12. 等待计算完成后,单击对话框右下角的 \"Close\" 按钮关闭该对话框。",
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"steps_original": "1. 打开 Avogadro 软件并加载目标分子的模型。\n2. 通过菜单栏选择 Analyze → Create Surfaces。\n3. 在弹出的 Create Surfaces 对话框中,将 Surface 设置为 'Van der Waals'。\n4. 将 Color By 设置为 'Electrostatic Potential'。\n5. 选择一个电荷模型(例如 'EEM')。\n6. 选择色阶为 'Balance'。\n7. 点击 'Calculate' 按钮开始计算表面。\n8. 等待软件完成计算,点击 'Close' 关闭对话框。"
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"metadata": {
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"metadata": {
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"input_files": [],
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"steps": "1. 在菜单栏点击 File → New → Image。\n2. 在弹出的对话框中输入名称 'Text Image'。\n3. 从 Type 下拉菜单中选择 '8-bit'。\n4. 从 Fill With 下拉菜单中选择 'White'。\n5. 在宽度(Width)框中输入 40。\n6. 在高度(Height)框中输入 40。\n7. 点击 OK 按钮完成操作。"
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"steps": "1. 在顶部菜单栏中,单击展开 \"File\" 菜单。\n2. 在展开的菜单中,单击展开 \"New\" 子菜单。\n3. 在 \"New\" 子菜单中,单击选择 \"Image...\" 选项,打开 \"New Image...\" 对话框。\n4. 在 \"New Image...\" 对话框中,单击 \"Name:\" 右侧的文本输入框以定位光标。\n5. 清空该输入框的已有内容,输入文本 \"Text Image\"。\n6. 单击 \"Type:\" 右侧的下拉菜单以展开选项列表。\n7. 在展开的选项列表中,单击选择 \"8-bit\"。\n8. 单击 \"Fill With:\" 右侧的下拉菜单以展开选项列表。\n9. 在展开的选项列表中,单击选择 \"White\"。\n10. 单击 \"Width:\" 右侧的文本输入框以定位光标。\n11. 清空该输入框的已有内容,输入数字 \"40\"。\n12. 单击 \"Height:\" 右侧的文本输入框以定位光标。\n13. 清空该输入框的已有内容,输入数字 \"40\"。\n14. 单击对话框底部的 \"OK\" 按钮完成创建。",
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"steps_original": "1. 在菜单栏点击 File → New → Image。\n2. 在弹出的对话框中输入名称 'Text Image'。\n3. 从 Type 下拉菜单中选择 '8-bit'。\n4. 从 Fill With 下拉菜单中选择 'White'。\n5. 在宽度(Width)框中输入 40。\n6. 在高度(Height)框中输入 40。\n7. 点击 OK 按钮完成操作。"
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}
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}
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}
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}
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@@ -39,6 +39,7 @@
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"input_files": [],
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"steps": "1. 在菜单栏点击 Edit → Selection → Restore Selection。\n2. 在图像上确保选区可见。\n3. 查看并确认选区正确恢复。"
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"steps": "1. 单击软件顶部菜单栏的 \"Edit\" 菜单。\n2. 在弹出的下拉菜单中,单击(或将鼠标悬停在) \"Selection\" 选项以展开子菜单。\n3. 在弹出的子菜单中,单击 \"Restore Selection\" 选项(或直接按下快捷键 \"E\")来恢复图像上的选区。",
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"steps_original": "1. 在菜单栏点击 Edit → Selection → Restore Selection。\n2. 在图像上确保选区可见。\n3. 查看并确认选区正确恢复。"
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}
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}
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"input_files": [
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"input_files": [
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"blobs.gif"
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"blobs.gif"
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],
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],
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"steps": "1. 打开 blobs.gif 文件。\n2. 在菜单栏点击 Process → Find Maxima。\n3. 在弹出的对话框中,将 Noise Tolerance 设置为 50。\n4. 从 Output Type 下拉菜单中选择 'Single Points'。\n5. 点击 OK 按钮完成操作。"
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"steps": "1. 点击主界面菜单栏的 \"File\" 菜单。\n2. 在展开的下拉菜单中,单击选择 \"Open...\" 选项。\n3. 在弹出的文件选择对话框中,浏览并单击选中 \"blobs.gif\" 文件。\n4. 单击对话框底部的 \"打开\"(或 \"Open\")按钮以加载该图像。\n5. 点击主界面菜单栏的 \"Process\" 菜单。\n6. 在展开的下拉菜单中,单击选择 \"Find Maxima...\" 选项。\n7. 在弹出的 \"Find Maxima...\" 对话框中,单击将光标定位到 \"Noise Tolerance:\" 右侧的文本输入框。\n8. 清空该输入框中的现有内容。\n9. 在该输入框中输入数值 \"50\"。\n10. 单击 \"Output type:\" 右侧的下拉菜单控件以展开选项列表。\n11. 在展开的下拉列表中,单击选中 \"Single Points\" 选项。\n12. 单击对话框底部的 \"OK\" 按钮以执行操作并关闭对话框。",
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"steps_original": "1. 打开 blobs.gif 文件。\n2. 在菜单栏点击 Process → Find Maxima。\n3. 在弹出的对话框中,将 Noise Tolerance 设置为 50。\n4. 从 Output Type 下拉菜单中选择 'Single Points'。\n5. 点击 OK 按钮完成操作。"
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}
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}
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}
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}
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@@ -39,6 +39,7 @@
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"possibility_of_env_change": "low",
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"possibility_of_env_change": "low",
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"metadata": {
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"metadata": {
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"input_files": [],
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"input_files": [],
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"steps": "1. 在菜单栏点击 Plugins → Utilities → Find Commands。\n2. 在弹出的 Command Finder 窗口中输入 'threshold'。\n3. 勾选 'Show full information'。\n4. 在列表中选择 'Adaptive3DThreshold' 并双击运行命令。"
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"steps": "1. 在顶部菜单栏中,单击 \"Plugins\" 菜单。\n2. 在展开的下拉菜单中,单击 \"Utilities\" 子菜单以展开次级菜单。\n3. 在次级菜单中,单击 \"Find Commands...\" 选项以打开 Command Finder 窗口。\n4. 在弹出的 \"Command Finder\" 窗口中,单击 \"Type part of a command:\" 标签右侧的文本输入框以定位光标。\n5. 在该文本输入框中,输入文字 \"threshold\"。\n6. 在窗口的选项区域中,单击勾选 \"Show full information\" 复选框。\n7. 在中间的搜索结果列表中,双击名为 \"Adaptive3DThreshold\" 的列表项以运行该命令。",
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"steps_original": "1. 在菜单栏点击 Plugins → Utilities → Find Commands。\n2. 在弹出的 Command Finder 窗口中输入 'threshold'。\n3. 勾选 'Show full information'。\n4. 在列表中选择 'Adaptive3DThreshold' 并双击运行命令。"
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}
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}
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}
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}
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@@ -39,6 +39,7 @@
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"possibility_of_env_change": "low",
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"possibility_of_env_change": "low",
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"metadata": {
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"metadata": {
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"input_files": [],
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"input_files": [],
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"steps": "1. 在菜单栏点击 Image → Adjust → Threshold。\n2. 在弹出的对话框中,从 Method 下拉菜单选择 'Default'。\n3. 确保 Display 模式设置为 'Over/Under'。\n4. 点击 Apply 按钮完成操作。"
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"steps": "1. 在主界面顶部菜单栏中,单击 \"Image\" 菜单项\n2. 在弹出的下拉菜单中,将鼠标移动并单击 \"Adjust\" 子菜单项\n3. 在弹出的级联菜单中,单击 \"Threshold...\" 选项,打开 \"Threshold\" 对话框\n4. 在弹出的 \"Threshold\" 对话框中,单击左侧中间的自动阈值方法下拉菜单(位于 \"Dark background\" 复选框上方)\n5. 在展开的下拉列表中,单击选中 \"Default\" 选项\n6. 在 \"Threshold\" 对话框中,单击右侧中间的显示模式下拉菜单(位于自动阈值方法下拉菜单的右侧)\n7. 在展开的下拉列表中,单击选中 \"Over/Under\" 选项\n8. 在 \"Threshold\" 对话框底部的按钮区,单击 \"Apply\" 按钮完成阈值分割操作",
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"steps_original": "1. 在菜单栏点击 Image → Adjust → Threshold。\n2. 在弹出的对话框中,从 Method 下拉菜单选择 'Default'。\n3. 确保 Display 模式设置为 'Over/Under'。\n4. 点击 Apply 按钮完成操作。"
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}
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}
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}
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}
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@@ -39,6 +39,7 @@
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"possibility_of_env_change": "low",
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"possibility_of_env_change": "low",
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"metadata": {
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"metadata": {
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"input_files": [],
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"input_files": [],
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"steps": "1. 在菜单栏点击 Analyze → Tools → Curve Fitting。\n2. 在弹出的对话框中,从 Function 下拉菜单选择 '2nd Degree Polynomial'。\n3. 点击 Fit 按钮。\n4. 在 Simplex Fitting Options 中,将 Maximum number of iterations 设置为 100。\n5. 点击 OK 按钮完成拟合。"
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"steps": "1. 在顶部菜单栏中,单击 \"Analyze\" 菜单。\n2. 在展开的下拉菜单中,鼠标悬停或单击 \"Tools\" 子菜单以将其展开。\n3. 在 \"Tools\" 子菜单列表中,单击选择 \"Curve Fitting...\" 选项。\n4. 在弹出的 \"Curve Fitter\" 对话框中,单击左上角的函数类型下拉菜单(默认可能显示为 \"Straight Line\" 或其他选项)。\n5. 在展开的下拉列表中,单击选择 \"2nd Degree Polynomial\" 选项。\n6. 在 \"Curve Fitter\" 对话框的上方,单击勾选 \"Show settings\" 复选框(此为弹出高级设置的前提条件)。\n7. 单击对话框上方的 \"Fit\" 按钮。\n8. 在随之弹出的 \"Simplex Fitting Options\" 对话框中,找到 \"Maximum iterations:\" 标签右侧的数值输入框。\n9. 单击该输入框,将光标定位到输入框内部。\n10. 清空输入框中已有的默认数值(例如 4500)。\n11. 在输入框中通过键盘输入数值 \"100\"。\n12. 单击 \"Simplex Fitting Options\" 对话框底部的 \"OK\" 按钮以应用设置并完成拟合。",
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||||||
|
"steps_original": "1. 在菜单栏点击 Analyze → Tools → Curve Fitting。\n2. 在弹出的对话框中,从 Function 下拉菜单选择 '2nd Degree Polynomial'。\n3. 点击 Fit 按钮。\n4. 在 Simplex Fitting Options 中,将 Maximum number of iterations 设置为 100。\n5. 点击 OK 按钮完成拟合。"
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}
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}
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}
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}
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@@ -52,6 +52,7 @@
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"input_files": [
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"input_files": [
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"mri-stack.tif"
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"mri-stack.tif"
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],
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],
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"steps": "1. 打开 mri-stack.tif 文件。\n2. 在菜单栏点击 Image → Transform → Rotate 90 Degrees Right。\n3. 确保图像正确旋转后保存或查看结果。"
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"steps": "1. 在顶部菜单栏中,单击 \"File\" 菜单项。\n2. 在展开的下拉菜单中,单击 \"Open...\" 选项。\n3. 在弹出的文件选择对话框中,找到并单击选中名为 \"mri-stack.tif\" 的文件。\n4. 单击文件选择对话框右下角的 \"打开\" 按钮加载图像。\n5. 确保新打开的 \"mri-stack.tif\" 图像窗口处于前台激活状态。\n6. 在顶部菜单栏中,单击 \"Image\" 菜单项。\n7. 在展开的下拉菜单中,将鼠标指针移动并悬停在 \"Transform\" 选项上,以展开级联子菜单。\n8. 在弹出的级联子菜单中,单击 \"Rotate 90 Degrees Right\" 选项。\n9. 观察处于激活状态的图像窗口,确认图像内容已顺时针旋转 90 度。\n10. 在顶部菜单栏中,单击 \"File\" 菜单项。\n11. 在展开的下拉菜单中,单击 \"Save\" 选项将旋转结果保存到原文件。",
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|
"steps_original": "1. 打开 mri-stack.tif 文件。\n2. 在菜单栏点击 Image → Transform → Rotate 90 Degrees Right。\n3. 确保图像正确旋转后保存或查看结果。"
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}
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}
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}
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}
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@@ -39,6 +39,7 @@
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"possibility_of_env_change": "low",
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"possibility_of_env_change": "low",
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"metadata": {
|
"metadata": {
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"input_files": [],
|
"input_files": [],
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"steps": "1. 在菜单栏点击 Process → Binary → Options。\n2. 在弹出的对话框中勾选 'Black Background'。\n3. 点击 Preview 查看效果。\n4. 点击 OK 按钮保存选项。"
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"steps": "1. 在顶部菜单栏中,单击 \"Process\" 菜单项。\n2. 在弹出的下拉菜单中,将鼠标悬停或单击 \"Binary\" 子菜单项以将其展开。\n3. 在展开的 \"Binary\" 子菜单中,单击 \"Options...\" 菜单项,打开选项对话框。\n4. 在弹出的选项对话框中,单击勾选 \"Black background\" 复选框。\n5. 在同一个对话框中,单击勾选 \"Preview\" 复选框以预览效果。\n6. 单击对话框底部的 \"OK\" 按钮以保存设置并关闭对话框。",
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||||||
|
"steps_original": "1. 在菜单栏点击 Process → Binary → Options。\n2. 在弹出的对话框中勾选 'Black Background'。\n3. 点击 Preview 查看效果。\n4. 点击 OK 按钮保存选项。"
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}
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}
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}
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}
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@@ -39,6 +39,7 @@
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"possibility_of_env_change": "low",
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"possibility_of_env_change": "low",
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"metadata": {
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"metadata": {
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"input_files": [],
|
"input_files": [],
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"steps": "1. 在菜单栏点击 File → Save As → PNG。\n2. 在弹出的对话框中,将透明索引设置为 255。\n3. 输入文件名并指定保存路径。\n4. 点击 OK 按钮完成保存。"
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"steps": "1. 在顶部菜单栏中,单击 \"Edit\" 菜单项。\n2. 在弹出的下拉菜单中,将鼠标悬停或单击 \"Options\" 选项以展开子菜单。\n3. 在子菜单中,单击 \"Input/Output...\" 选项,打开 Input/Output Options 设置对话框。\n4. 在弹出的对话框中,单击定位到用于设置透明索引(Transparent index)的文本输入框。\n5. 清空该输入框中的原有数值。\n6. 在输入框中输入数字 \"255\"。\n7. 单击对话框底部的 \"OK\" 按钮以保存设置并关闭对话框。\n8. 在顶部菜单栏中,单击 \"File\" 菜单项。\n9. 在弹出的下拉菜单中,将鼠标悬停或单击 \"Save As\" 选项以展开子菜单。\n10. 在子菜单中,单击 \"PNG...\" 选项,打开系统的文件保存对话框。\n11. 在弹出的文件保存对话框中,单击定位到用于输入文件名的文本输入框。\n12. 在输入框中输入目标文件名。\n13. 在对话框的目录树或路径地址栏中,浏览并单击选中指定的保存路径。\n14. 单击对话框右下角的 \"Save\"(或 \"保存\")按钮以确认并完成文件保存。",
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||||||
|
"steps_original": "1. 在菜单栏点击 File → Save As → PNG。\n2. 在弹出的对话框中,将透明索引设置为 255。\n3. 输入文件名并指定保存路径。\n4. 点击 OK 按钮完成保存。"
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}
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}
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}
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}
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@@ -39,6 +39,7 @@
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"possibility_of_env_change": "low",
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"possibility_of_env_change": "low",
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"metadata": {
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"metadata": {
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"input_files": [],
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"input_files": [],
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||||||
"steps": "1. 创建或选择一个区域选区。\n2. 在菜单栏点击 Analyze → Measure。\n3. 在弹出的 Results 窗口中查看面积和灰度值等测量结果。"
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"steps": "1. 在 ImageJ 主界面的工具栏中,单击选中一种区域选区工具图标(例如左侧第一个的“矩形选区工具” Rectangular Selection Tool)\n2. 在当前活跃的图像窗口中,将鼠标光标定位到待测量区域的起始点\n3. 按下并按住鼠标左键,拖动鼠标以在图像上绘制出一个覆盖目标区域的选区框\n4. 松开鼠标左键,完成选区的创建\n5. 在 ImageJ 顶部的主菜单栏中,单击“Analyze”菜单以展开下拉列表\n6. 在展开的“Analyze”下拉菜单中,单击选择“Measure”选项(或按下快捷键 'm')\n7. 在系统自动弹出的名为“Results”的表格窗口中,定位到表格最后新增的一行测量数据\n8. 在该行数据中,分别读取“Area”列对应的数值(面积)以及“Mean”列对应的数值(平均灰度值)",
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"steps_original": "1. 创建或选择一个区域选区。\n2. 在菜单栏点击 Analyze → Measure。\n3. 在弹出的 Results 窗口中查看面积和灰度值等测量结果。"
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}
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}
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}
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}
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@@ -52,6 +52,7 @@
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"input_files": [
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"input_files": [
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"example.xlsx"
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"example.xlsx"
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],
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],
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||||||
"steps": "1. 在 Origin 的主菜单中选择 Data → Connect to File。\n2. 点击 Connect to File 菜单中的按钮。\n3. 选择文件 example.xlsx 并点击 Open。\n4. 数据将被加载到当前的工作表中。"
|
"steps": "1. 单击顶部主菜单栏中的 \"Data\" 菜单。\n2. 在展开的下拉菜单中,将鼠标悬停或单击 \"Connect to File\" 菜单项以展开子菜单。\n3. 在展开的子菜单中,单击选中 \"Excel...\" 选项。\n4. 在弹出的文件选择对话框中,单击选中文件名输入框将光标定位至此。\n5. 在文件名输入框中,输入文字 \"example.xlsx\"。\n6. 单击对话框右下角的 \"Open\"(或\"打开\")按钮。",
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||||||
|
"steps_original": "1. 在 Origin 的主菜单中选择 Data → Connect to File。\n2. 点击 Connect to File 菜单中的按钮。\n3. 选择文件 example.xlsx 并点击 Open。\n4. 数据将被加载到当前的工作表中。"
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}
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}
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}
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}
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@@ -39,6 +39,7 @@
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"possibility_of_env_change": "low",
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"possibility_of_env_change": "low",
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"metadata": {
|
"metadata": {
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"input_files": [],
|
"input_files": [],
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"steps": "1. 打开一个现有图表并右键点击图表元素。\n2. 选择 Graph → Adding Error Bars。\n3. 选择误差数据列并点击 OK 应用。\n4. 查看图表是否正确添加了误差条。"
|
"steps": "1. 在工作区中,单击目标图表窗口的任意位置以将其激活。\n2. 将鼠标指针移动到图表内需要添加误差条的数据曲线或数据点上。\n3. 在该数据曲线上单击鼠标右键,打开右键上下文菜单。\n4. 在弹出的右键菜单中,将鼠标悬停或单击“Graph”选项,展开级联子菜单。\n5. 在展开的子菜单中,单击选中“Adding Error Bars”菜单项,打开误差条设置对话框。\n6. 在弹出的对话框中,单击误差数据来源对应的下拉菜单控件以展开列表。\n7. 在展开的下拉列表中,单击选中包含误差值的目标数据列。\n8. 单击对话框底部的“OK”按钮,应用设置并关闭对话框。\n9. 观察图表窗口,确认选中的数据曲线上已正确渲染出误差条标记。",
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||||||
|
"steps_original": "1. 打开一个现有图表并右键点击图表元素。\n2. 选择 Graph → Adding Error Bars。\n3. 选择误差数据列并点击 OK 应用。\n4. 查看图表是否正确添加了误差条。"
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}
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}
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}
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}
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@@ -39,6 +39,7 @@
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"possibility_of_env_change": "low",
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"possibility_of_env_change": "low",
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"metadata": {
|
"metadata": {
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"input_files": [],
|
"input_files": [],
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"steps": "1. 打开一个包含数据点的图表。\n2. 在主菜单中选择 Tools → Pick Data Points。\n3. 使用交叉标记在图中选择数据点。\n4. 点击 Done 按钮以保存选择的数据点到新的工作表。"
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"steps": "1. 单击包含数据点的图表窗口的任意位置或标题栏,将其激活为当前操作窗口。\n2. 在软件顶部的主菜单栏中,单击 \"Data\"(或根据版本对应 \"Tools\")菜单以展开下拉列表。\n3. 在展开的下拉菜单中,单击选择 \"Pick Data Points\" 菜单项,系统将弹出 \"Pick Points\" 对话框,且鼠标光标自动变为方形交叉准星。\n4. 在图表区域内移动鼠标,将方形交叉准星悬停定位在需要拾取的第一个目标数据点上。\n5. 在该数据点上双击鼠标左键,观察并确认准星光标变为圆形,此时该点的坐标已记录在对话框中。\n6. 若需拾取多个点,重复执行将光标移动到目标点并双击鼠标左键的操作,逐个完成数据点选择。\n7. 所有目标数据点拾取完毕后,将鼠标移至悬浮的 \"Pick Points\" 对话框,单击其底部的 \"Done\" 按钮,结束拾取并将结果输出至新建的工作表中。",
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"steps_original": "1. 打开一个包含数据点的图表。\n2. 在主菜单中选择 Tools → Pick Data Points。\n3. 使用交叉标记在图中选择数据点。\n4. 点击 Done 按钮以保存选择的数据点到新的工作表。"
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}
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}
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}
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}
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@@ -39,6 +39,7 @@
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"possibility_of_env_change": "low",
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"possibility_of_env_change": "low",
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"metadata": {
|
"metadata": {
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"input_files": [],
|
"input_files": [],
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"steps": "1. 在主菜单中选择 View → Formula Bar。\n2. 在出现的公式栏中,点击当前单元格内并输入 =stdev(B1:B10)。\n3. 按 Enter 键以应用公式并计算结果。\n4. 检查公式栏输出的结果是否正确。"
|
"steps": "1. 单击顶部主菜单栏中的 \"View\" 菜单。\n2. 在展开的下拉菜单中,单击选中 \"Formula Bar\" 菜单项以在界面中显示公式栏。\n3. 在界面上方出现的公式栏中,单击 \"fx\" 图标右侧的文本输入框(Expression/Text 框)使其获得光标焦点。\n4. 在该文本输入框中输入文字 =stdev(B1:B10) 。\n5. 按下键盘上的 Enter 键,或者单击文本输入框左侧带有绿色对勾图标的 \"OK\" 按钮以提交并应用该公式。\n6. 观察当前工作表中被选中的单元格,确认其是否正确显示出该公式的计算结果。",
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"steps_original": "1. 在主菜单中选择 View → Formula Bar。\n2. 在出现的公式栏中,点击当前单元格内并输入 =stdev(B1:B10)。\n3. 按 Enter 键以应用公式并计算结果。\n4. 检查公式栏输出的结果是否正确。"
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}
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}
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}
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}
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@@ -39,6 +39,7 @@
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"possibility_of_env_change": "low",
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"possibility_of_env_change": "low",
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"metadata": {
|
"metadata": {
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"input_files": [],
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"input_files": [],
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"steps": "1. 在图层的 X 轴区域右键点击并选择 Axis Dialog。\n2. 在左侧选择 Scale 标签。\n3. 将 From 值修改为 20,将 To 值修改为 180。\n4. 点击 Apply To 按钮以应用更改,然后点击 OK 完成。"
|
"steps": "1. 在图表窗口的 X 轴(横坐标轴)区域上,右键单击鼠标。\n2. 在弹出的右键快捷菜单中,单击选择“Axis Dialog”菜单项。\n3. 在弹出的“X Axis”对话框中,单击左侧面板中的“Horizontal”图标。\n4. 单击对话框顶部的“Scale”选项卡。\n5. 在“Scale”面板中,单击选中“From”右侧的文本输入框。\n6. 清空该输入框中的现有内容,输入数值 20。\n7. 单击选中“To”右侧的文本输入框。\n8. 清空该输入框中的现有内容,输入数值 180。\n9. 单击对话框底部的“Apply To...”按钮。\n10. 单击对话框底部的“OK”按钮以完成设置并关闭对话框。",
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"steps_original": "1. 在图层的 X 轴区域右键点击并选择 Axis Dialog。\n2. 在左侧选择 Scale 标签。\n3. 将 From 值修改为 20,将 To 值修改为 180。\n4. 点击 Apply To 按钮以应用更改,然后点击 OK 完成。"
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}
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}
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}
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}
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@@ -39,6 +39,7 @@
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"possibility_of_env_change": "low",
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"possibility_of_env_change": "low",
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"metadata": {
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"metadata": {
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"input_files": [],
|
"input_files": [],
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"steps": "1. 打开一个包含数据的图表。\n2. 在主菜单选择 Graph → Rescale to Show All。\n3. 图表比例重设以显示所有数据点。"
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"steps": "1. 确保当前工作区中有一个已打开且包含数据的图表窗口处于激活(选中)状态。\n2. 将鼠标光标移动到软件顶部的主菜单栏。\n3. 单击主菜单栏中的 \"Graph\" 菜单项,展开下拉菜单。\n4. 在展开的 \"Graph\" 下拉菜单中,将鼠标移动并单击选中 \"Rescale to Show All\" 菜单项。\n5. 观察图表窗口,确认图表的坐标轴比例已自动重设,并完整显示出所有的数据点。",
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"steps_original": "1. 打开一个包含数据的图表。\n2. 在主菜单选择 Graph → Rescale to Show All。\n3. 图表比例重设以显示所有数据点。"
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}
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}
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}
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}
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@@ -39,6 +39,7 @@
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"possibility_of_env_change": "low",
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"possibility_of_env_change": "low",
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"metadata": {
|
"metadata": {
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"input_files": [],
|
"input_files": [],
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"steps": "1. 在主菜单中选择 Tools → Data Slicer。\n2. 数据切片器面板将被激活。\n3. 在切片器的条件中选择 X=50 并应用切片。\n4. 图表中将显示切片后的数据点。"
|
"steps": "1. 单击主菜单栏中的 'Tools' 菜单以展开工具菜单项。\n2. 在 'Tools' 下拉菜单中,单击 'Data Slicer' 选项。\n3. 在弹出的 'Data Slicer' 窗口中,将鼠标移动到切片器条件的下拉或输入控件区域。\n4. 在切片器条件的控制项中,输入或选择 'X=50' 作为切片过滤条件。\n5. 在条件设置区域或窗口底部,单击 'Apply' 按钮或相关的应用控件以使切片条件生效。\n6. 观察图表,确认显示的已是根据条件 'X=50' 切片后的数据点。",
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||||||
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"steps_original": "1. 在主菜单中选择 Tools → Data Slicer。\n2. 数据切片器面板将被激活。\n3. 在切片器的条件中选择 X=50 并应用切片。\n4. 图表中将显示切片后的数据点。"
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}
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}
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}
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}
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@@ -39,6 +39,7 @@
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"possibility_of_env_change": "low",
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"possibility_of_env_change": "low",
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"metadata": {
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"metadata": {
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"input_files": [],
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"input_files": [],
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||||||
"steps": "1. 打开一个包含数据的活动表格。\n2. 在主菜单中选择 Worksheet → Convert to Matrix。\n3. 根据对话框选择矩阵转换选项(例如 X Across Columns)。\n4. 点击 OK 完成转换,生成矩阵数据。"
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"steps": "1. 单击选中包含目标数据的 Worksheet 工作簿窗口的标题栏,使其成为当前活动窗口。\n2. 在软件顶部的系统主菜单栏中,单击“Worksheet”菜单以展开下拉列表。\n3. 在展开的下拉菜单中,单击选中“Convert to Matrix”菜单项(如弹出级联子菜单,则单击选择“Direct...”或其他对应选项),打开转换配置对话框。\n4. 在弹出的对话框中,找到用于指定转换方法的下拉菜单控件(通常标记为“Method”或“Data Format”),单击该下拉菜单将其展开。\n5. 在展开的选项列表中,单击选中所需的矩阵转换选项(例如“X across columns”)。\n6. 单击对话框底部的“OK”按钮确认配置并执行转换操作,等待系统生成包含矩阵数据的新窗口。",
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||||||
|
"steps_original": "1. 打开一个包含数据的活动表格。\n2. 在主菜单中选择 Worksheet → Convert to Matrix。\n3. 根据对话框选择矩阵转换选项(例如 X Across Columns)。\n4. 点击 OK 完成转换,生成矩阵数据。"
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}
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}
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}
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}
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@@ -39,6 +39,7 @@
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"possibility_of_env_change": "low",
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"possibility_of_env_change": "low",
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"metadata": {
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"metadata": {
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"input_files": [],
|
"input_files": [],
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||||||
"steps": "1. 使用鼠标选择需要对齐的对象。\n2. 打开 Object Edit Toolbar。\n3. 点击对齐按钮,例如 Align Left 或 Align Center。\n4. 所选对象将以统一对齐样式排列。"
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"steps": "1. 按下并保持键盘上的 \"Shift\" 键。\n2. 在图表窗口中,单击选中第一个图表对象(该对象将作为后续对齐操作的位置基准)。\n3. 保持 \"Shift\" 键按下状态,单击选中其他需要对齐的图表对象。\n4. 松开键盘上的 \"Shift\" 键,完成多个图表对象的选择。\n5. 在界面上找到并定位到 \"Object Edit\" 工具栏。\n6. 单击 \"Object Edit\" 工具栏上所需的对齐图标按钮(例如单击 \"Left\" 左对齐按钮或 \"Center\" 居中对齐按钮),执行对齐操作。",
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||||||
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"steps_original": "1. 使用鼠标选择需要对齐的对象。\n2. 打开 Object Edit Toolbar。\n3. 点击对齐按钮,例如 Align Left 或 Align Center。\n4. 所选对象将以统一对齐样式排列。"
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}
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}
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}
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}
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@@ -39,6 +39,7 @@
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"possibility_of_env_change": "low",
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"possibility_of_env_change": "low",
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"metadata": {
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"metadata": {
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"input_files": [],
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"input_files": [],
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||||||
"steps": "1. 在 OVITO 的顶部菜单栏中选择 'Animation settings'。\n2. 在弹出的 'Animation settings' 窗口中,找到 'Frames per second' 输入框。\n3. 将帧速率设置为 10。\n4. 点击 'OK' 以保存更改。"
|
"steps": "1. 在 OVITO 的顶部菜单栏中,单击包含动画选项的菜单以将其展开。\n2. 在展开的下拉菜单中,单击选择 'Animation settings' 选项,打开 'Animation Settings' 对话框。\n3. 在弹出的 'Animation Settings' 对话框中,定位到顶部的 'Animation' 分组区域。\n4. 单击 'Frames per second:' 标签右侧的数值输入框,将光标定位在输入框内(若为下拉菜单则单击展开)。\n5. 删除并清空该输入框中原有的数值内容。\n6. 使用键盘在输入框中输入数字 '10'(或在下拉选项中单击选中 '10')。\n7. 定位到对话框右下角,单击 'OK' 按钮以保存设置并关闭对话框。",
|
||||||
|
"steps_original": "1. 在 OVITO 的顶部菜单栏中选择 'Animation settings'。\n2. 在弹出的 'Animation settings' 窗口中,找到 'Frames per second' 输入框。\n3. 将帧速率设置为 10。\n4. 点击 'OK' 以保存更改。"
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}
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}
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}
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}
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@@ -39,6 +39,7 @@
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"possibility_of_env_change": "low",
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"possibility_of_env_change": "low",
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"metadata": {
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"metadata": {
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"input_files": [],
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"input_files": [],
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"steps": "1. 打开 OVITO 软件。\n2. 选择 File → New 或打开一个现有的粒子数据文件。\n3. 在 'Pipeline' 界面选择 'Particles' 可视化元素。\n4. 转到 'Particle types' 面板,将粒子形状调整为 Sphere(球形)。\n5. 确认并应用更改,确保形状为球形并更新可视化。"
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"steps": "1. 将光标移动到主界面左上角的菜单栏,单击 \"File\"(文件)菜单。\n2. 在弹出的下拉菜单中,单击 \"Load File\"(加载文件)选项。\n3. 在弹出的文件浏览对话框中,单击选中目标粒子数据文件。\n4. 单击对话框右下角的 \"Open\"(打开)按钮将文件加载入场景。\n5. 将光标移动到界面右侧的 \"Pipeline\"(管线)面板。\n6. 在管线界面的树形列表中,单击选中名为 \"Particles\" 的可视化元素节点。\n7. 将光标向下移动到 \"Pipeline\" 面板下方的属性参数区域,滚动鼠标滚轮找到 \"Particle types\" 面板。\n8. 单击 \"Particle types\" 面板左侧的展开图标(如箭头或加号)将其展开。\n9. 在展开的粒子类型列表中,找到目标粒子类型所在行,单击该行对应的 \"Shape\"(形状)下拉菜单框。\n10. 在弹出的形状选项下拉列表中,单击选中 \"Sphere\"(球形)选项。\n11. 将光标移至中间的主三维视口区域,单击鼠标左键以确认操作,并观察粒子形状是否已更新为球形。",
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"steps_original": "1. 打开 OVITO 软件。\n2. 选择 File → New 或打开一个现有的粒子数据文件。\n3. 在 'Pipeline' 界面选择 'Particles' 可视化元素。\n4. 转到 'Particle types' 面板,将粒子形状调整为 Sphere(球形)。\n5. 确认并应用更改,确保形状为球形并更新可视化。"
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}
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}
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}
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}
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@@ -39,6 +39,7 @@
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"possibility_of_env_change": "low",
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"possibility_of_env_change": "low",
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"metadata": {
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"metadata": {
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"input_files": [],
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"input_files": [],
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"steps": "1. 在 OVITO 的主工具栏中找到 'Pipelines' 下拉菜单。\n2. 点击下拉菜单并选择 'Clone current pipeline...'。\n3. 在打开的 'Clone pipeline' 对话框中,选择克隆模式(如 Copy 或 Share)。\n4. 点击 'OK' 按钮完成克隆操作。\n5. 确认在可视化场景中同时显示原始通道和克隆通道的输出。"
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"steps": "1. 在 OVITO 主界面顶部工具栏中,单击 \"Pipelines:\" 标签右侧的下拉菜单控件以展开列表。\n2. 在展开的下拉菜单中,单击底部的 \"Clone current pipeline...\" 菜单项。\n3. 在弹出的 \"Clone pipeline\" 对话框中,定位到右上方的 \"Cloning mode:\" 区域。\n4. 在 \"Cloning mode:\" 区域内,根据克隆需求,单击相应数据源或修改器所在行右侧的 \"Copy\" 或 \"Share\" 按钮。\n5. 在 \"Clone pipeline\" 对话框的右下角,单击 \"OK\" 按钮以确认操作并关闭对话框。\n6. 观察主界面的 3D 可视化视口,确认场景中并排显示了原始流水线和克隆流水线的输出对象。",
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|
"steps_original": "1. 在 OVITO 的主工具栏中找到 'Pipelines' 下拉菜单。\n2. 点击下拉菜单并选择 'Clone current pipeline...'。\n3. 在打开的 'Clone pipeline' 对话框中,选择克隆模式(如 Copy 或 Share)。\n4. 点击 'OK' 按钮完成克隆操作。\n5. 确认在可视化场景中同时显示原始通道和克隆通道的输出。"
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}
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}
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}
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}
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@@ -39,6 +39,7 @@
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"possibility_of_env_change": "low",
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"possibility_of_env_change": "low",
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"metadata": {
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"metadata": {
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"input_files": [],
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"input_files": [],
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"steps": "1. 启动 OVITO 软件。\n2. 点击顶部菜单栏中的 File。\n3. 在下拉菜单中选择 Generate Python Script。\n4. 确保代码生成器窗口正常打开(可见 Python 代码编辑界面)。"
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"steps": "1. 在操作系统桌面或任务栏上,双击 OVITO 应用程序的快捷方式图标以启动软件。\n2. 等待 OVITO 软件主界面完全加载并显示。\n3. 将鼠标光标定位到软件主窗口最顶部区域的水平菜单栏。\n4. 单击菜单栏中的“File”文本标签,展开文件操作的下拉菜单。\n5. 在弹出的“File”下拉菜单列表中,向下移动鼠标光标并悬停在“Generate Python Script”选项上。\n6. 单击选中“Generate Python Script”菜单项。\n7. 等待界面响应,观察并确认屏幕上成功弹出一个包含 Python 代码文本框的独立代码生成器窗口(窗口顶部可能包含如“Visualization code”等复选框控件)。",
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"steps_original": "1. 启动 OVITO 软件。\n2. 点击顶部菜单栏中的 File。\n3. 在下拉菜单中选择 Generate Python Script。\n4. 确保代码生成器窗口正常打开(可见 Python 代码编辑界面)。"
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}
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}
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}
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}
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@@ -39,6 +39,7 @@
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"possibility_of_env_change": "low",
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"possibility_of_env_change": "low",
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"metadata": {
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"metadata": {
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"input_files": [],
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"input_files": [],
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"steps": "1. 打开 OVITO。\n2. 点击菜单栏中的 File → Save Session State As。\n3. 在弹出的文件保存对话框中,将文件命名为 defaults.ovito。\n4. 确保会话为空(即不包含数据集和管道)。\n5. 点击保存按钮。"
|
"steps": "1. 启动 OVITO 桌面应用程序,并等待主界面完全加载。\n2. 单击顶部主菜单栏中的 \"File\" 菜单项,展开下拉菜单。\n3. 在展开的下拉菜单中,单击 \"New Session\"(或 \"Clear Session\")选项,以确保当前会话被完全清空(不包含任何数据集和管道)。\n4. 再次单击顶部主菜单栏中的 \"File\" 菜单项,展开下拉菜单。\n5. 在下拉菜单中,单击选中 \"Save Session State As...\" 选项,等待系统弹出文件保存对话框。\n6. 在弹出的文件保存对话框中,将鼠标光标单击定位到“文件名”(File name) 文本输入框。\n7. 选中并清空“文件名”输入框中原有的默认内容。\n8. 在“文件名”输入框中,使用键盘输入文本 \"defaults.ovito\"。\n9. 单击对话框右下角的“保存”(Save) 按钮,关闭对话框并保存该空会话状态文件。",
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||||||
|
"steps_original": "1. 打开 OVITO。\n2. 点击菜单栏中的 File → Save Session State As。\n3. 在弹出的文件保存对话框中,将文件命名为 defaults.ovito。\n4. 确保会话为空(即不包含数据集和管道)。\n5. 点击保存按钮。"
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}
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}
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}
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}
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@@ -39,6 +39,7 @@
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"possibility_of_env_change": "low",
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"possibility_of_env_change": "low",
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"metadata": {
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"metadata": {
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"input_files": [],
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"input_files": [],
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"steps": "1. 打开 OVITO 软件。\n2. 导入一个包含粒子属性的模拟文件(如 .xyz 格式)。\n3. 点击顶部工具栏中的 Data Inspector 按钮。\n4. 在 Data Inspector 面板查看粒子属性表,包括 Position 和 Potential Energy 列。"
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"steps": "1. 双击桌面上的 OVITO 快捷方式图标启动软件。\n2. 单击主界面顶部菜单栏中的 \"File\" 菜单。\n3. 在弹出的下拉菜单中,单击 \"Load File\" 选项。\n4. 在打开的文件选择对话框中,浏览并单击选中包含粒子属性的目标模拟文件(例如 .xyz 格式)。\n5. 单击文件选择对话框右下角的 \"Open\" 按钮以加载文件。\n6. 在主界面顶部工具栏中,找到并单击 \"Data Inspector\" 按钮(通常为表格或放大镜图标)以打开数据检查器面板。\n7. 在 Data Inspector 面板的顶部,单击选中 \"Particles\" 选项卡。\n8. 在面板下方显示的数据表格中,水平滚动或直接查看,找到表头名为 \"Position\" 的列并查看其数值。\n9. 在同一个数据表格中,找到表头名为 \"Potential Energy\" 的列并查看其数值。",
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||||||
|
"steps_original": "1. 打开 OVITO 软件。\n2. 导入一个包含粒子属性的模拟文件(如 .xyz 格式)。\n3. 点击顶部工具栏中的 Data Inspector 按钮。\n4. 在 Data Inspector 面板查看粒子属性表,包括 Position 和 Potential Energy 列。"
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}
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}
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}
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}
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@@ -39,6 +39,7 @@
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"possibility_of_env_change": "low",
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"possibility_of_env_change": "low",
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"metadata": {
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"metadata": {
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"input_files": [],
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"input_files": [],
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"steps": "1. 在菜单栏中,点击 File → Export File。\n2. 在弹出的对话框中,选择导出格式为 'Table of Particles'.\n3. 指定文件名为 particle_data.csv,并选择保存位置。\n4. 点击 'Save' 按钮以完成导出。"
|
"steps": "1. 单击顶部菜单栏的 \"File\" 菜单项。\n2. 在展开的下拉菜单中,单击 \"Export File\" 选项。\n3. 在弹出的导出文件对话框中,单击 \"保存类型\" (或 Format) 下拉菜单。\n4. 在展开的下拉列表中,单击选中 \"Table of Particles\" 选项。\n5. 单击 \"文件名\" (或 File name) 输入框,将光标定位到该输入框中。\n6. 清空输入框中的原有内容,输入文本 \"particle_data.csv\"。\n7. 单击对话框右下角的 \"Save\" (或 保存) 按钮以确认导出。",
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||||||
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"steps_original": "1. 在菜单栏中,点击 File → Export File。\n2. 在弹出的对话框中,选择导出格式为 'Table of Particles'.\n3. 指定文件名为 particle_data.csv,并选择保存位置。\n4. 点击 'Save' 按钮以完成导出。"
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}
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}
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}
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}
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@@ -39,6 +39,7 @@
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"possibility_of_env_change": "low",
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"possibility_of_env_change": "low",
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"metadata": {
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"metadata": {
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"input_files": [],
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"input_files": [],
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"steps": "1. 在 OVITO 界面上,点击 Animation Settings 按钮(小钟图标)。\n2. 在 Animation Settings 窗口中,找到 'Frames per second'(帧率)选项。\n3. 将 Frames per second 的值设置为 15。\n4. 点击 'OK' 确认设置。"
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"steps": "1. 在软件主界面的动画工具栏中,单击带有小钟图标的 'Animation settings' 按钮\n2. 在弹出的 'Animation Settings' 窗口中,定位到 'Animation' 分组下的 'Frames per second' 组合输入框,并单击将其选中\n3. 清空该输入框中的已有内容\n4. 在该输入框中输入数字 '15'\n5. 单击对话框底部的 'OK' 按钮保存设置并关闭窗口",
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"steps_original": "1. 在 OVITO 界面上,点击 Animation Settings 按钮(小钟图标)。\n2. 在 Animation Settings 窗口中,找到 'Frames per second'(帧率)选项。\n3. 将 Frames per second 的值设置为 15。\n4. 点击 'OK' 确认设置。"
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}
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}
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}
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}
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@@ -39,6 +39,7 @@
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"possibility_of_env_change": "low",
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"possibility_of_env_change": "low",
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"metadata": {
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"metadata": {
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"input_files": [],
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"input_files": [],
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"steps": "1. 点击菜单栏中的 File。\n2. 选择 Save Session State。\n3. 在弹出的保存对话框中选择目标路径并输入文件名 'session.ovitostate'。\n4. 点击 Save 保存文件。"
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"steps": "1. 点击软件顶部菜单栏中的 \"File\" 菜单。\n2. 在展开的下拉菜单中,单击选择 \"Save Session State\" 选项。\n3. 在弹出的文件保存对话框中,将光标定位到文件名输入框,清空已有内容,输入文本 \"session.ovitostate\"。\n4. 单击对话框底部的 \"Save\"(或保存)按钮。",
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||||||
|
"steps_original": "1. 点击菜单栏中的 File。\n2. 选择 Save Session State。\n3. 在弹出的保存对话框中选择目标路径并输入文件名 'session.ovitostate'。\n4. 点击 Save 保存文件。"
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}
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}
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}
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}
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@@ -39,6 +39,7 @@
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"possibility_of_env_change": "low",
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"possibility_of_env_change": "low",
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"metadata": {
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"metadata": {
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"input_files": [],
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"input_files": [],
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"steps": "1. 打开 OVITO Pro 软件。\n2. 点击顶部菜单栏中的 Edit 菜单。\n3. 从下拉菜单中选择 Python Extensions。\n4. 查看扩展目录窗口,确认已打开。"
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"steps": "1. 在操作系统桌面或任务栏中,双击 OVITO Pro 程序的快捷方式图标以启动软件。\n2. 等待 OVITO Pro 软件主界面完全加载显示。\n3. 在软件主界面顶部的菜单栏中,单击 \"Edit\" 菜单项,展开其下拉菜单列表。\n4. 在展开的下拉菜单列表中,单击选中 \"Python Extensions\" 菜单项。\n5. 等待屏幕上弹出一个标题为 \"Python Extensions\" 的对话框窗口,确认扩展目录已成功打开。",
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||||||
|
"steps_original": "1. 打开 OVITO Pro 软件。\n2. 点击顶部菜单栏中的 Edit 菜单。\n3. 从下拉菜单中选择 Python Extensions。\n4. 查看扩展目录窗口,确认已打开。"
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}
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}
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}
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}
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@@ -39,6 +39,7 @@
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"possibility_of_env_change": "low",
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"possibility_of_env_change": "low",
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"metadata": {
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"metadata": {
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"input_files": [],
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"input_files": [],
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"steps": "1. 打开 OVITO 软件。\n2. 点击菜单 File → Load Remote File。\n3. 在弹出的对话框中填写 Remote URL 字段,例如:sftp://user@hostname/path/file。\n4. 在 File type 下选择 Auto-detect file format。\n5. 在 SSH connection method 下选择 Integrated client (default)。\n6. 点击 Open 完成连接并加载文件。"
|
"steps": "1. 启动 OVITO 软件并等待进入主界面。\n2. 单击主界面顶部菜单栏中的 \"File\" 菜单将其展开。\n3. 在展开的下拉菜单中,单击选择 \"Load Remote File\" 菜单项,此时会弹出 \"Load Remote File\" 对话框。\n4. 在 \"Load Remote File\" 对话框中,单击 \"Remote URL:\" 标签下方的组合输入框将光标定位至此。\n5. 在该输入框中,清空原有内容,并输入远程文件地址:sftp://user@hostname/path/file。\n6. 单击 \"File type:\" 标签下方的下拉菜单控件将其展开。\n7. 在展开的下拉列表中,单击选择 \"<Auto-detect file format>\" 选项。\n8. 在 \"SSH connection method:\" 区域,单击 \"Integrated client (default)\" 左侧的单选按钮以选中该选项。\n9. 单击对话框右下角蓝色的 \"Open\" 按钮以建立连接并加载文件。",
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||||||
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"steps_original": "1. 打开 OVITO 软件。\n2. 点击菜单 File → Load Remote File。\n3. 在弹出的对话框中填写 Remote URL 字段,例如:sftp://user@hostname/path/file。\n4. 在 File type 下选择 Auto-detect file format。\n5. 在 SSH connection method 下选择 Integrated client (default)。\n6. 点击 Open 完成连接并加载文件。"
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}
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}
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}
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}
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@@ -39,6 +39,7 @@
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"possibility_of_env_change": "low",
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"possibility_of_env_change": "low",
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"metadata": {
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"metadata": {
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"input_files": [],
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"input_files": [],
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"steps": "1. 打开 OVITO Pro 软件。\n2. 点击顶部菜单中的 Utilities 标签。\n3. 选择 Render On Remote Computer 工具。\n4. 在弹出的对话框中,点击 'Choose' 按钮为 Bundle Export Directory 设置一个本地导出目录。\n5. 在 CPU cores per task 选项框中输入渲染任务所需的 CPU 核心数量(可为空,默认使用所有核心)。"
|
"steps": "1. 在操作系统中双击打开 OVITO Pro 软件。\n2. 在软件界面右侧的命令面板顶部,单击带有“扳手和螺丝刀”图标的“Utilities”标签页。\n3. 在 Utilities 面板顶部的下拉菜单控件上,单击以展开工具列表。\n4. 在展开的下拉列表中,单击选中“Render On Remote Computer”选项。\n5. 在下方出现的设置面板中,找到“Bundle export directory:”标签,单击其右侧的“Choose...”按钮。\n6. 在弹出的文件浏览对话框中,浏览并单击选中一个用作导出的本地目标文件夹。\n7. 单击文件浏览对话框底部的“选择文件夹”(或“确认”)按钮,完成路径的设置并关闭对话框。\n8. 找到面板下方的“CPU cores per task:”输入框,单击将光标定位到该输入框内。\n9. 选中并清空输入框内的已有内容,通过键盘输入所需的 CPU 核心数量数字(如果需要默认使用所有可用核心,则清空后不输入任何内容)。",
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||||||
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"steps_original": "1. 打开 OVITO Pro 软件。\n2. 点击顶部菜单中的 Utilities 标签。\n3. 选择 Render On Remote Computer 工具。\n4. 在弹出的对话框中,点击 'Choose' 按钮为 Bundle Export Directory 设置一个本地导出目录。\n5. 在 CPU cores per task 选项框中输入渲染任务所需的 CPU 核心数量(可为空,默认使用所有核心)。"
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}
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}
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}
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}
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@@ -39,6 +39,7 @@
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"possibility_of_env_change": "low",
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"possibility_of_env_change": "low",
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"metadata": {
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"metadata": {
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"input_files": [],
|
"input_files": [],
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"steps": "1. 打开 OVITO 软件。\n2. 确保观察窗口激活(黄色边框)。\n3. 点击右侧命令面板上的 Render 图标。\n4. 在弹出的 Render Settings 面板中,选择 'Single frame'。\n5. 设置输出图像大小为 Width: 1024 和 Height: 768。\n6. 选择背景为 'Transparent'。\n7. 点击 'Render active viewport' 按钮完成渲染。"
|
"steps": "1. 双击桌面或系统菜单中的 OVITO 软件快捷方式打开软件。\n2. 在软件主界面的观察窗口区域,单击鼠标左键以激活目标视口(确保视口边缘出现黄色边框)。\n3. 在界面右侧命令面板顶部的工具栏中,单击带有照相机形状的 \"Render\" 图标选项卡,打开 \"Render settings\" 面板。\n4. 在 \"Render settings\" 面板的 \"Rendering range\" 区域,单击选中 \"Single frame\" 单选按钮。\n5. 在 \"Output image size\" 区域,将光标定位到 \"Width:\" 对应的数值输入框中,清空原有内容,输入 \"1024\"。\n6. 在 \"Output image size\" 区域,将光标定位到 \"Height:\" 对应的数值输入框中,清空原有内容,输入 \"768\"。\n7. 在 \"Background\" 区域,单击选中 \"Transparent\" 单选按钮。\n8. 在 \"Render settings\" 面板的底部,单击带有照相机图标的 \"Render active viewport\" 按钮开始渲染。",
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||||||
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"steps_original": "1. 打开 OVITO 软件。\n2. 确保观察窗口激活(黄色边框)。\n3. 点击右侧命令面板上的 Render 图标。\n4. 在弹出的 Render Settings 面板中,选择 'Single frame'。\n5. 设置输出图像大小为 Width: 1024 和 Height: 768。\n6. 选择背景为 'Transparent'。\n7. 点击 'Render active viewport' 按钮完成渲染。"
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}
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}
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}
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}
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@@ -39,6 +39,7 @@
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"possibility_of_env_change": "low",
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"possibility_of_env_change": "low",
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"metadata": {
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"metadata": {
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"input_files": [],
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"input_files": [],
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"steps": "1. 打开软件并加载需要的粒子数据。\n2. 插入 Compute 属性修正器到数据管道。\n3. 在 Compute 属性修正器中找到 Transparency 属性。\n4. 在表达式字段中输入透明度值 0.5。\n5. 应用设置,确保 Transparency 属性被分配给所有粒子。"
|
"steps": "1. 双击桌面快捷方式打开软件。\n2. 单击主界面顶部菜单栏的 \"File\" 菜单。\n3. 在弹出的下拉菜单中,单击 \"Load File\" 选项。\n4. 在弹出的文件选择对话框中,双击所需的粒子数据文件进行加载。\n5. 在界面右侧的修改器控制面板中,单击 \"Add modification...\" 下拉按钮以展开修改器列表。\n6. 在下拉列表中,单击选中 \"Compute property\" 选项,将其插入到数据管道中。\n7. 在界面下方的 Compute property 修改器参数面板中,单击 \"Output property\" 属性下拉列表。\n8. 在展开的属性选项中,单击选中 \"Transparency\"。\n9. 在参数面板中,单击将鼠标光标定位到 \"Expression\" 文本输入框中。\n10. 删除或清空该输入框内的所有已有字符。\n11. 在输入框内输入数值 \"0.5\"。\n12. 检查下方的 \"Compute only for selected particles\" 复选框,若已勾选,则单击该复选框取消勾选,以确保应用到全部粒子。\n13. 按下键盘上的回车键(Enter)或单击界面空白区域,确认输入并应用修改。",
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"steps_original": "1. 打开软件并加载需要的粒子数据。\n2. 插入 Compute 属性修正器到数据管道。\n3. 在 Compute 属性修正器中找到 Transparency 属性。\n4. 在表达式字段中输入透明度值 0.5。\n5. 应用设置,确保 Transparency 属性被分配给所有粒子。"
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}
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}
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}
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}
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@@ -39,6 +39,7 @@
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"possibility_of_env_change": "low",
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"possibility_of_env_change": "low",
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"metadata": {
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"metadata": {
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"input_files": [],
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"input_files": [],
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"steps": "1. 在 PyMOL 命令行中输入 `fetch 1nmr` 来加载 NMR ensemble。\n2. 输入 `mplay` 命令开始播放动画。\n3. 如果需要停止播放动画,输入 `mstop` 。"
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"steps": "1. 单击界面上的 PyMOL 命令行输入框,将光标定位到该输入框。\n2. 在命令行输入框中输入文本 fetch 1nmr。\n3. 按下键盘上的回车键 (Enter) 执行命令,加载 NMR ensemble。\n4. 再次单击界面上的 PyMOL 命令行输入框。\n5. 在命令行输入框中输入文本 mplay。\n6. 按下键盘上的回车键 (Enter) 执行命令,开始播放动画。\n7. 再次单击界面上的 PyMOL 命令行输入框。\n8. 在命令行输入框中输入文本 mstop。\n9. 按下键盘上的回车键 (Enter) 执行命令,停止播放动画。",
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||||||
|
"steps_original": "1. 在 PyMOL 命令行中输入 `fetch 1nmr` 来加载 NMR ensemble。\n2. 输入 `mplay` 命令开始播放动画。\n3. 如果需要停止播放动画,输入 `mstop` 。"
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}
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}
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}
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@@ -39,6 +39,7 @@
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"possibility_of_env_change": "low",
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"possibility_of_env_change": "low",
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"metadata": {
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"metadata": {
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"input_files": [],
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"input_files": [],
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"steps": "1. 从菜单中选择适当选项,用于创建场景绕 Y 轴旋转的动画。\n2. 按下“Pressplay”开始播放动画。"
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"steps": "1. 在顶部菜单栏中,单击“Movie”菜单以展开下拉列表。\n2. 在展开的下拉菜单中,将鼠标悬停在“Program”选项上以展开子菜单。\n3. 在展开的子菜单中,将鼠标悬停在“Camera Loop”选项上以展开下一级菜单。\n4. 在下一级菜单中,将鼠标悬停在“Y-Roll”选项上(对应教程中的 Y-axis roll)以展开动画时长选项菜单。\n5. 在展开的时长列表中,单击所需的动画时长选项(例如“8 seconds”)以生成绕 Y 轴 360 度旋转的场景动画。\n6. 在 PyMOL 主界面底部或右下角的动画控制面板中,单击“Play”按钮(对应教程中的 Press play)以开始播放动画。",
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"steps_original": "1. 从菜单中选择适当选项,用于创建场景绕 Y 轴旋转的动画。\n2. 按下“Pressplay”开始播放动画。"
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}
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}
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}
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@@ -39,6 +39,7 @@
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"possibility_of_env_change": "low",
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"possibility_of_env_change": "low",
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"metadata": {
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"metadata": {
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"input_files": [],
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"input_files": [],
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"steps": "1. 从菜单中选择用于设置场景摇摆动画的选项。\n2. 选择摇摆角度(例如 30、60、90、120 或 180 度)。\n3. 按下“Pressplay”启动动画。"
|
"steps": "1. 单击顶部菜单栏的 \"Movie\" 菜单项。\n2. 在展开的下拉菜单中,将鼠标悬停并单击 \"Program\" 选项以展开子菜单。\n3. 在弹出的级联菜单中,将鼠标悬停并单击 \"Camera Loop\" 选项以展开下一级菜单。\n4. 在弹出的级联菜单中,将鼠标悬停并单击 \"X-Rock\" 或 \"Y-Rock\"(摇摆轴向)子菜单。\n5. 在弹出的角度选项列表中,单击选中所需的摇摆角度(例如包含 \"30 deg.\", \"60 deg.\", \"90 deg.\", \"120 deg.\" 或 \"180 deg.\" 的选项)。\n6. 单击主界面右下方控制面板中的 \"Play\"(播放)按钮启动动画。",
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|
"steps_original": "1. 从菜单中选择用于设置场景摇摆动画的选项。\n2. 选择摇摆角度(例如 30、60、90、120 或 180 度)。\n3. 按下“Pressplay”启动动画。"
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}
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}
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}
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}
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@@ -39,6 +39,7 @@
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"possibility_of_env_change": "low",
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"possibility_of_env_change": "low",
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"metadata": {
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"metadata": {
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"input_files": [],
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"input_files": [],
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||||||
"steps": "1. 从菜单中选择制作摇摆动画的选项。\n2. 设置摇摆效果参数。\n3. 按下“Pressplay”启动摇摆动画。"
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"steps": "1. 单击顶部菜单栏中的 \"Movie\" 菜单项。\n2. 在弹出的下拉菜单中,将鼠标光标悬停在 \"Program\" 菜单项上以展开子菜单。\n3. 在展开的子菜单中,将鼠标光标悬停在 \"Camera Loop\" 菜单项上以展开下一级菜单。\n4. 在下一级菜单中,将鼠标光标悬停在 \"Nutate\" 菜单项上以展开参数预设列表。\n5. 在展开的参数预设列表中,单击选中需要的摇摆角度和时长选项(例如默认的预设时长选项)以应用摇摆效果。\n6. 在软件界面底部或右下角的动画控制面板中,单击带有向右三角形图标的 \"Play\" 按钮启动动画。",
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||||||
|
"steps_original": "1. 从菜单中选择制作摇摆动画的选项。\n2. 设置摇摆效果参数。\n3. 按下“Pressplay”启动摇摆动画。"
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}
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}
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}
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}
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@@ -39,6 +39,7 @@
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"possibility_of_env_change": "low",
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"possibility_of_env_change": "low",
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"metadata": {
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"metadata": {
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"input_files": [],
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"input_files": [],
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"steps": "1. 创建一个场景并设置为缩放到特定原子。\n2. 保存该场景。\n3. 使用 PyMOL 中的 Scene Loop 功能连接多个保存的场景。\n4. 播放动画以观察缩放效果。"
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"steps": "1. 单击 PyMOL 界面上方的命令行输入框,将光标定位到该输入框。\n2. 通过键盘在输入框中输入命令:load $TUT/1hpv.pdb。\n3. 按下键盘上的 Enter 键执行加载模型操作。\n4. 单击界面顶部菜单栏中的 \"Scene\" 菜单项。\n5. 在弹出的下拉菜单中,将鼠标光标悬停在 \"Store\" 选项上以展开侧边子菜单。\n6. 在展开的侧边子菜单中,单击 \"F1\" 选项,将初始全局视图保存为场景一。\n7. 将鼠标移动到 3D 渲染视图区域,左键单击分子模型上的某一个具体原子,使其高亮选中。\n8. 在界面右侧的对象列表控制面板中,找到自动生成的 \"(sele)\" 对象所在行,单击该行右侧的 \"A\"(Action)按钮。\n9. 在弹出的下拉动作菜单中,单击 \"zoom\" 选项,使摄像机视角缩放并聚焦到刚选中的原子上。\n10. 再次单击界面顶部菜单栏中的 \"Scene\" 菜单项。\n11. 在弹出的下拉菜单中,将鼠标光标悬停在 \"Store\" 选项上以展开侧边子菜单。\n12. 在展开的侧边子菜单中,单击 \"F2\" 选项,将当前的局部缩放视图保存为场景二。\n13. 在界面右侧的对象列表控制面板中,找到 \"1hpv\" 对象所在行,单击该行右侧的 \"A\"(Action)按钮。\n14. 在弹出的下拉动作菜单中,单击 \"zoom\" 选项,使摄像机视角缩小并退回到展示整个分子的全局视图。\n15. 第三次单击界面顶部菜单栏中的 \"Scene\" 菜单项。\n16. 在弹出的下拉菜单中,将鼠标光标悬停在 \"Store\" 选项上以展开侧边子菜单。\n17. 在展开的侧边子菜单中,单击 \"F3\" 选项,将恢复后的全局视图保存为场景三。\n18. 单击界面顶部菜单栏中的 \"Movie\" 菜单项。\n19. 在弹出的下拉菜单中,将鼠标光标悬停在 \"Program\" 选项上以展开侧边子菜单。\n20. 在展开的侧边子菜单中,将鼠标光标悬停在 \"Scene Loop\" 选项上展开下一级选项列表。\n21. 在下一级选项列表中,单击 \"Steady\" 选项,命令程序自动为已保存的场景序列生成平滑补间动画帧。\n22. 单击主界面底部播放控制区域右下角的 \"Play\"(向右三角形图标)按钮,播放生成的动画以观察镜头的缩放与返回效果。",
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||||||
|
"steps_original": "1. 创建一个场景并设置为缩放到特定原子。\n2. 保存该场景。\n3. 使用 PyMOL 中的 Scene Loop 功能连接多个保存的场景。\n4. 播放动画以观察缩放效果。"
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}
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}
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}
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}
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@@ -39,6 +39,7 @@
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"possibility_of_env_change": "low",
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"possibility_of_env_change": "low",
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"metadata": {
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"metadata": {
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"input_files": [],
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"input_files": [],
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||||||
"steps": "1. 点击菜单栏中的 Movie。\n2. 从下拉菜单中选择 Append。\n3. 在 Append 子菜单中选择 2 seconds。"
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"steps": "1. 在主界面的顶部菜单栏中,单击 \"Movie\" 菜单项。\n2. 在展开的下拉菜单中,将鼠标悬停在 \"Append\" 选项上以展开其子菜单。\n3. 在弹出的 \"Append\" 子菜单中,单击 \"2 seconds\" 选项。",
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||||||
|
"steps_original": "1. 点击菜单栏中的 Movie。\n2. 从下拉菜单中选择 Append。\n3. 在 Append 子菜单中选择 2 seconds。"
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}
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}
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}
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}
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@@ -39,6 +39,7 @@
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"possibility_of_env_change": "low",
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"possibility_of_env_change": "low",
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"metadata": {
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"metadata": {
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"input_files": [],
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"input_files": [],
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"steps": "1. 在 PyMOL 的底部工具栏上点击 All。\n2. 从下拉菜单中选择 ALA。\n3. 在 ALA 菜单中选择 Motions。\n4. 浏览显示的运动/位置选项。"
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"steps": "1. 在 PyMOL 界面右上方的对象控制面板中,定位到名为 \"ala\" 的对象所在行。\n2. 在 \"ala\" 对象所在行,单击最右侧的字母 \"M\" 按钮(代表 Motions)。\n3. 观察并浏览弹出的 \"Object 'ala' Motion:\" 下拉菜单,查看其中的 \"store\"、\"clear\"、\"smooth\" 等运动和位置选项。",
|
||||||
|
"steps_original": "1. 在 PyMOL 的底部工具栏上点击 All。\n2. 从下拉菜单中选择 ALA。\n3. 在 ALA 菜单中选择 Motions。\n4. 浏览显示的运动/位置选项。"
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}
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}
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}
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}
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@@ -39,6 +39,7 @@
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"possibility_of_env_change": "low",
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"possibility_of_env_change": "low",
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"metadata": {
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"metadata": {
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"input_files": [],
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"input_files": [],
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||||||
"steps": "1. 点击菜单栏中的 Movie。\n2. 从下拉菜单中选择 Frame Rate。\n3. 在 Frame Rate 子菜单中选择 15 FPS。"
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"steps": "1. 点击界面顶部菜单栏中的 \"Movie\" 菜单。\n2. 在展开的下拉菜单中,将鼠标悬停在 \"Frame Rate\" 菜单项上以展开子菜单。\n3. 在 \"Frame Rate\" 的子菜单中,点击选择 \"15 FPS\"。",
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||||||
|
"steps_original": "1. 点击菜单栏中的 Movie。\n2. 从下拉菜单中选择 Frame Rate。\n3. 在 Frame Rate 子菜单中选择 15 FPS。"
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}
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}
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}
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}
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@@ -39,6 +39,7 @@
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"possibility_of_env_change": "low",
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"possibility_of_env_change": "low",
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"metadata": {
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"metadata": {
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"input_files": [],
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"input_files": [],
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"steps": "1. 点击菜单栏中的 Scene。\n2. 从下拉菜单中选择 Store。\n3. 在弹出的窗口中输入 'my_scene' 作为场景名称。\n4. 点击确认按钮存储场景。"
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"steps": "1. 在顶部菜单栏中,单击 \"Scene\" 菜单项。\n2. 在弹出的下拉菜单中,单击 \"Store\" 选项。\n3. 在弹出的场景名称输入窗口中,单击以将光标定位到文本输入框。\n4. 在该输入框中,清空原有内容并输入文字 \"my_scene\"。\n5. 单击窗口中的确认(或 \"OK\")按钮以完成场景存储。",
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||||||
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"steps_original": "1. 点击菜单栏中的 Scene。\n2. 从下拉菜单中选择 Store。\n3. 在弹出的窗口中输入 'my_scene' 作为场景名称。\n4. 点击确认按钮存储场景。"
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}
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}
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}
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}
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@@ -39,6 +39,7 @@
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"possibility_of_env_change": "low",
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"possibility_of_env_change": "low",
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"metadata": {
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"metadata": {
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"input_files": [],
|
"input_files": [],
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||||||
"steps": "1. 点击菜单栏中的 Scene。\n2. 从下拉菜单中选择 Clear。\n3. 在确认对话框中点击是以清除所有场景。"
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"steps": "1. 在软件界面顶部的菜单栏中,单击 \"Scene\" 菜单项。\n2. 在弹出的下拉菜单中,单击 \"Clear\" 选项。\n3. 在弹出的确认对话框中,单击 \"是\"(或 \"Yes\")按钮以确认清除所有场景。",
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"steps_original": "1. 点击菜单栏中的 Scene。\n2. 从下拉菜单中选择 Clear。\n3. 在确认对话框中点击是以清除所有场景。"
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}
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}
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}
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}
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@@ -39,6 +39,7 @@
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|||||||
"possibility_of_env_change": "low",
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"possibility_of_env_change": "low",
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"metadata": {
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"metadata": {
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"input_files": [],
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"input_files": [],
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||||||
"steps": "1. 点击菜单栏中的 Mouse。\n2. 从下拉菜单中选择 Edit。\n3. 在 Edit 菜单中选择 Motions。\n4. 在弹出的子菜单中选择 3 Button Motions。"
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"steps": "1. 在软件顶部的菜单栏中,单击 \"Mouse\" 菜单以展开下拉列表。\n2. 在展开的下拉菜单中,单击选中 \"3 Button Motions\" 选项。",
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||||||
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"steps_original": "1. 点击菜单栏中的 Mouse。\n2. 从下拉菜单中选择 Edit。\n3. 在 Edit 菜单中选择 Motions。\n4. 在弹出的子菜单中选择 3 Button Motions。"
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}
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}
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}
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}
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@@ -39,6 +39,7 @@
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"possibility_of_env_change": "low",
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"possibility_of_env_change": "low",
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"metadata": {
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"metadata": {
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"input_files": [],
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"input_files": [],
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||||||
"steps": "1. 打开 PyMOL 软件并加载任意结构。\n2. 通过 Wizard → Mutagenesis 打开 Mutagenesis 工具。\n3. 查看 Mutagenesis 工具中指定区域的颜色提示。\n4. 确认颜色解释:绿色表示轻微重叠,红色表示显著重叠。\n5. 使用颜色信息选择适当的操作来优化结构。"
|
"steps": "1. 在顶部菜单栏中,单击 \"File\" 菜单\n2. 在下拉菜单中,单击 \"Open...\" 选项\n3. 在弹出的文件选择对话框中,选中任意一个 PDB 格式的结构文件,单击 \"Open\" 按钮加载结构\n4. 在顶部菜单栏中,单击 \"Wizard\" 菜单\n5. 在下拉菜单中,单击 \"Mutagenesis\" 选项,打开屏幕右下角的 Mutagenesis 向导面板\n6. 在中间的 PyMOL 三维视图窗口中,单击鼠标左键选中需要分析的氨基酸残基\n7. 在右下角的 Mutagenesis 向导面板中,单击 \"No Mutation\" 按钮\n8. 在弹出的下拉菜单中,单击选择一个目标的突变氨基酸类型\n9. 在三维视图窗口中,观察突变体周围出现的范德华半径重叠提示(彩色线条和圆盘)\n10. 在屏幕右下角的动画控制区域,单击 \"后退\" (向左箭头) 或 \"前进\" (向右箭头) 按钮,以切换当前残基的不同旋转异构体 (rotamers)\n11. 在切换过程中观察视图窗口,定位到显示短绿线或小绿色圆盘(表示轻微重叠/良好接触)最多,且没有大红色圆盘(表示显著碰撞/范德华重叠)的构象帧\n12. 在右下角的 Mutagenesis 向导面板中,单击 \"Apply\" 按钮应用选定的、无显著重叠的构象\n13. 在右下角的 Mutagenesis 向导面板中,单击 \"Done\" 按钮关闭突变工具",
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||||||
|
"steps_original": "1. 打开 PyMOL 软件并加载任意结构。\n2. 通过 Wizard → Mutagenesis 打开 Mutagenesis 工具。\n3. 查看 Mutagenesis 工具中指定区域的颜色提示。\n4. 确认颜色解释:绿色表示轻微重叠,红色表示显著重叠。\n5. 使用颜色信息选择适当的操作来优化结构。"
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}
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}
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}
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}
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@@ -39,6 +39,7 @@
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"possibility_of_env_change": "low",
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"possibility_of_env_change": "low",
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"metadata": {
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"metadata": {
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"input_files": [],
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"input_files": [],
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||||||
"steps": "1. 确保所有需要的对象和场景已设置好。\n2. 点击菜单栏 File → Save Session。\n3. 在弹出的窗口中命名文件并保存为 .pse 格式。\n4. 确认会话被成功保存。"
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"steps": "1. 单击桌面软件顶部菜单栏上的 \"File\" 菜单项\n2. 在展开的下拉菜单中,单击选中 \"Save Session...\" 或 \"Save Session As...\" 选项\n3. 在弹出的系统文件保存对话框中,单击 \"文件名\" (或 File name) 输入框以定位光标\n4. 清空已有内容,在输入框中输入所需保存的文件名称(建议带上 .pse 后缀,例如 current_session.pse)\n5. 单击对话框底部的 \"保存\" (或 Save) 按钮完成文件保存",
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||||||
|
"steps_original": "1. 确保所有需要的对象和场景已设置好。\n2. 点击菜单栏 File → Save Session。\n3. 在弹出的窗口中命名文件并保存为 .pse 格式。\n4. 确认会话被成功保存。"
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}
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}
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}
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}
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@@ -52,6 +52,7 @@
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"input_files": [
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"input_files": [
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"example_structure.cif"
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"example_structure.cif"
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],
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],
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"steps": "1. 启动 VESTA 软件。\n2. 点击 File → Open。\n3. 在文件浏览窗口中选择 example_structure.cif 文件。\n4. 点击 Open 按钮加载文件。\n5. 确认结构已显示在视图窗口中。"
|
"steps": "1. 双击桌面上的 VESTA 快捷方式图标启动软件\n2. 单击软件主界面顶部菜单栏中的 \"File\" 菜单\n3. 在展开的下拉菜单中,单击 \"Open...\" 选项\n4. 在弹出的文件浏览对话框中,单击底部的 \"文件名\" (File name) 输入框\n5. 在输入框中输入 \"example_structure.cif\"\n6. 单击文件浏览对话框右下角的 \"Open\" (或 \"打开\") 按钮以加载文件",
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||||||
|
"steps_original": "1. 启动 VESTA 软件。\n2. 点击 File → Open。\n3. 在文件浏览窗口中选择 example_structure.cif 文件。\n4. 点击 Open 按钮加载文件。\n5. 确认结构已显示在视图窗口中。"
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}
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}
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}
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}
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@@ -52,6 +52,7 @@
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"input_files": [
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"input_files": [
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"sample.cif"
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"sample.cif"
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],
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],
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"steps": "1. 启动 VESTA 软件。\n2. 点击 File → Open,打开文件浏览器。\n3. 选择 sample.cif 文件并点击 Open。\n4. 加载文件后,点击 Edit → Data。\n5. 选择 Unit Cell 标签。\n6. 查看 Symmetry 选项卡中显示的对称性信息。"
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"steps": "1. 双击桌面或开始菜单中的 VESTA 软件快捷方式图标以启动程序。\n2. 单击 VESTA 主窗口顶部菜单栏中的“File”菜单。\n3. 单击展开的“File”下拉菜单中的“Open...”选项。\n4. 在弹出的文件浏览对话框中,导航至目标文件所在文件夹,单击选中名为“sample.cif”的文件。\n5. 单击文件浏览对话框右下角的“Open”按钮以加载晶体结构文件。\n6. 待主窗口图形区显示晶体结构后,单击顶部菜单栏中的“Edit”菜单。\n7. 单击展开的“Edit”下拉菜单中的“Edit Data...”选项。\n8. 在弹出的“Edit Data”对话框中,单击界面顶部选项卡行中的“Unit cell”标签。\n9. 在切换后的“Unit cell”页面中,观察左侧“Symmetry”区域,查看“System”和“Space Group”列表内当前高亮选中的对称性参数信息。\n10. 查看完毕后,单击对话框右下角的“Cancel”或“OK”按钮以关闭窗口。",
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||||||
|
"steps_original": "1. 启动 VESTA 软件。\n2. 点击 File → Open,打开文件浏览器。\n3. 选择 sample.cif 文件并点击 Open。\n4. 加载文件后,点击 Edit → Data。\n5. 选择 Unit Cell 标签。\n6. 查看 Symmetry 选项卡中显示的对称性信息。"
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}
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}
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}
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}
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@@ -52,6 +52,7 @@
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"input_files": [
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"input_files": [
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"example_structure.cif"
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"example_structure.cif"
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],
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],
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"steps": "1. 打开 VESTA 软件并加载 example_structure.vesta 文件。\n2. 点击 Edit → Properties。\n3. 在 Properties 对话框中选择 Polyhedra 标签。\n4. 勾选 Enable Polyhedra 绘图。\n5. 调整 Transparency 滑块到所需透明度值,例如 50%。\n6. 点击 OK 按钮保存设置。\n7. 验证主视图窗口中 Polyhedra 的更新显示。"
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"steps": "1. 点击左上角的 'File' 菜单。\n2. 在下拉菜单中选择 'Open...'\n3. 在弹出的文件选择对话框中,浏览并选中 'example_structure.vesta' 文件,然后点击 'Open' 按钮。\n4. 点击菜单栏的 'Edit' 菜单。\n5. 在下拉菜单中选择 'Properties...'。\n6. 在弹出的 'Properties' 对话框中,点击包含 'Polyhedra' 文字的标签页以切换到该选项卡。\n7. 在 'Polyhedra' 页面中,找到并勾选 'Enable Polyhedra' 复选框(如果它还未被勾选的话)。\n8. 找到 'Opacity' 滑块(代表透明度,值越高越不透明,因此50%透明度对应于Opacity 50% 或 0.5)。\n9. 将光标放在 'Opacity' 滑块上,点击并拖动,或者在旁边的输入框中清空当前值并输入 '50'(取决于界面的具体实现,这里假设直接拖动或输入)。\n10. 点击 'Properties' 对话框右下角的 'OK' 按钮。\n11. 观察主视图窗口,确认多面体(Polyhedra)是否已经显示,并且具有预期的透明效果。",
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||||||
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"steps_original": "1. 打开 VESTA 软件并加载 example_structure.vesta 文件。\n2. 点击 Edit → Properties。\n3. 在 Properties 对话框中选择 Polyhedra 标签。\n4. 勾选 Enable Polyhedra 绘图。\n5. 调整 Transparency 滑块到所需透明度值,例如 50%。\n6. 点击 OK 按钮保存设置。\n7. 验证主视图窗口中 Polyhedra 的更新显示。"
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}
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}
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}
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}
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@@ -52,6 +52,7 @@
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"input_files": [
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"input_files": [
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"example_structure.cif"
|
"example_structure.cif"
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],
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],
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"steps": "1. 打开 VESTA 软件并加载文件 loaded_structure.vesta。\n2. 在顶部菜单中选择 View → Display Style。\n3. 在弹出的对话框中选择 Ball-and-Stick 模式。\n4. 点击 OK 按钮应用设置。\n5. 查看主视图窗口以确认显示模式已改变。"
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"steps": "1. 双击桌面上的 \"VESTA\" 快捷方式图标启动软件。\n2. 单击主界面顶部菜单栏中的 \"File\" 菜单项。\n3. 在展开的下拉菜单中,单击 \"Open...\" 菜单项。\n4. 在弹出的文件选择对话框中,单击文件名输入框以获取焦点。\n5. 在文件名输入框中,输入 \"example_structure.cif\"。\n6. 单击文件选择对话框底部的 \"Open\" 按钮加载文件。\n7. 单击主界面顶部菜单栏中的 \"View\" 菜单项。\n8. 在展开的下拉菜单中,单击 \"Display Style\" 菜单项。\n9. 在弹出的对话框中,单击标签为 \"Ball-and-Stick\" 的单选按钮将其选中。\n10. 单击对话框底部的 \"OK\" 按钮应用更改并关闭对话框。",
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||||||
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"steps_original": "1. 打开 VESTA 软件并加载文件 loaded_structure.vesta。\n2. 在顶部菜单中选择 View → Display Style。\n3. 在弹出的对话框中选择 Ball-and-Stick 模式。\n4. 点击 OK 按钮应用设置。\n5. 查看主视图窗口以确认显示模式已改变。"
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}
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}
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}
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}
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@@ -39,6 +39,7 @@
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"possibility_of_env_change": "low",
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"possibility_of_env_change": "low",
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"metadata": {
|
"metadata": {
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"input_files": [],
|
"input_files": [],
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||||||
"steps": "1. 在 VESTA 软件中打开任何结构文件。\n2. 点击垂直工具栏中的 Measure Distance 工具。\n3. 在主视图窗口中选择两个要测量距离的原子。\n4. 在 Measure Distance 工具下确认显示两个原子之间的距离。\n5. 验证输出的距离值是否正确显示。"
|
"steps": "1. 单击顶部菜单栏的 \"File\" 菜单。\n2. 单击下拉菜单中的 \"Open...\" 选项。\n3. 在弹出的文件浏览对话框中,单击选中一个目标结构文件。\n4. 单击对话框底部的 \"Open\" 按钮以加载该文件。\n5. 在主界面左侧的垂直工具栏中,找到并单击 \"Measure distance\" 工具按钮(图标显示为两个由线段连接的蓝色小球,并带有一个测量标记)。\n6. 在主界面的 3D 视图窗口(Graphics Area)中,单击选中要测量的第一个目标原子。\n7. 在主界面的 3D 视图窗口中,单击选中要测量的第二个目标原子。\n8. 观察主界面底部的 \"Text Area\" (Output 面板) 区域。\n9. 在该区域输出的最新文本信息中,读取这两个原子之间的距离值。",
|
||||||
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"steps_original": "1. 在 VESTA 软件中打开任何结构文件。\n2. 点击垂直工具栏中的 Measure Distance 工具。\n3. 在主视图窗口中选择两个要测量距离的原子。\n4. 在 Measure Distance 工具下确认显示两个原子之间的距离。\n5. 验证输出的距离值是否正确显示。"
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}
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}
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}
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}
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@@ -52,6 +52,7 @@
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"input_files": [
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"input_files": [
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||||||
"MgB2.cif"
|
"MgB2.cif"
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||||||
],
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],
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||||||
"steps": "1. 打开 VESTA 软件并加载文件 MgB2.cif。\n2. 点击左侧侧边栏的 Objects → Boundary 按钮,打开 Boundary 对话框。\n3. 在对话框中调整范围 (x[min], x[max], y[min], y[max], z[min], z[max]) 为自定义值,例如 0 到 1。\n4. 点击 OK 或 Apply 按钮。\n5. 查看修改后的晶体绘图边界显示在主视图中。"
|
"steps": "1. 双击桌面上的 VESTA 软件快捷方式图标,启动 VESTA 软件。\n2. 单击顶部菜单栏的 \"File\" 菜单。\n3. 在展开的下拉菜单中,单击选择 \"Open...\" 选项,弹出文件选择对话框。\n4. 在文件选择对话框的列表中,定位并单击选中 \"MgB2.cif\" 文件。\n5. 单击文件选择对话框右下角的 \"打开\"(或 Open)按钮,加载该晶体文件。\n6. 在软件主界面左侧的侧边栏中,单击 \"Objects\" 选项卡使其展开为活动面板。\n7. 在 Objects 选项卡面板中,找到并单击 \"Boundary\" 按钮,打开 \"Boundary\" 对话框。\n8. 在 Boundary 对话框内,找到 \"Ranges of fractional coordinates\" 分组区域。\n9. 将光标定位到 \"x(min)\" 标签右侧的文本输入框,单击选中,清空已有数值,输入 \"0\"。\n10. 将光标定位到 \"x(max)\" 标签右侧的文本输入框,单击选中,清空已有数值,输入 \"1\"。\n11. 将光标定位到 \"y(min)\" 标签右侧的文本输入框,单击选中,清空已有数值,输入 \"0\"。\n12. 将光标定位到 \"y(max)\" 标签右侧的文本输入框,单击选中,清空已有数值,输入 \"1\"。\n13. 将光标定位到 \"z(min)\" 标签右侧的文本输入框,单击选中,清空已有数值,输入 \"0\"。\n14. 将光标定位到 \"z(max)\" 标签右侧的文本输入框,单击选中,清空已有数值,输入 \"1\"。\n15. 单击 Boundary 对话框底部的 \"OK\" 按钮,应用自定义边界范围并关闭对话框。\n16. 将视线移回主界面的图形视图区(Graphics Area),观察并确认晶体绘图边界已根据设定的 0 到 1 范围重新渲染显示。",
|
||||||
|
"steps_original": "1. 打开 VESTA 软件并加载文件 MgB2.cif。\n2. 点击左侧侧边栏的 Objects → Boundary 按钮,打开 Boundary 对话框。\n3. 在对话框中调整范围 (x[min], x[max], y[min], y[max], z[min], z[max]) 为自定义值,例如 0 到 1。\n4. 点击 OK 或 Apply 按钮。\n5. 查看修改后的晶体绘图边界显示在主视图中。"
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}
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}
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}
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}
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@@ -52,6 +52,7 @@
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"input_files": [
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"input_files": [
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||||||
"xTiO2.cif"
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"xTiO2.cif"
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||||||
],
|
],
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||||||
"steps": "1. 打开 VESTA 软件并加载 xTiO2.vesta 文件。\n2. 点击 Edit → Properties。\n3. 在对话框中导航到 Bonds 页面。\n4. 调整 Radius (cylinder) 输入框值,例如更改为 0.3。\n5. 修改颜色设置为 RGB 值 (100, 150, 200)。\n6. 点击 OK 按钮保存更改并关闭对话框。\n7. 确保更改在主视图中可见。"
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"steps": "1. 在桌面上双击 VESTA 软件图标以启动程序。\n2. 在 VESTA 软件界面的顶部菜单栏中,单击 \"File\" 菜单项。\n3. 在弹出的下拉菜单中,单击选中 \"Open...\" 选项打开文件浏览器。\n4. 在文件选择对话框中,导航至目标文件夹并单击选中 \"xTiO2.vesta\" 文件。\n5. 单击文件选择对话框右下角的 \"打开\" 按钮完成文件加载。\n6. 在主界面的顶部菜单栏中,单击选中 \"Edit\" 菜单项。\n7. 在弹出的下拉菜单中,单击选中 \"Properties...\" 选项以打开 Properties 对话框。\n8. 在 Properties 对话框顶部的选项卡列表中,单击选中 \"Bonds\" 标签页。\n9. 在 Bonds 页面中找到中下部的 \"Radius and color\" 区域,将鼠标光标定位到 \"Radius (cylinder):\" 标签右侧的数值输入框。\n10. 双击该输入框全选当前的默认数值(如 0.25),通过键盘输入新数值 \"0.3\"。\n11. 在同区域找到 \"Color:\" 标签右侧的三个连续的 RGB 数值输入框,将光标定位到第一个输入框(对应 R 值)。\n12. 双击全选第一个输入框的内容,通过键盘输入 \"100\"。\n13. 将鼠标光标定位到第二个输入框(对应 G 值)。\n14. 双击全选第二个输入框的内容,通过键盘输入 \"150\"。\n15. 将鼠标光标定位到第三个输入框(对应 B 值)。\n16. 双击全选第三个输入框的内容,通过键盘输入 \"200\"。\n17. 单击 Properties 对话框底部的 \"OK\" 按钮保存设置并关闭该对话框。\n18. 将鼠标移至 VESTA 主界面的 3D 图形视图区域单击一次,确认并查看化学键尺寸与颜色的更新效果。",
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"steps_original": "1. 打开 VESTA 软件并加载 xTiO2.vesta 文件。\n2. 点击 Edit → Properties。\n3. 在对话框中导航到 Bonds 页面。\n4. 调整 Radius (cylinder) 输入框值,例如更改为 0.3。\n5. 修改颜色设置为 RGB 值 (100, 150, 200)。\n6. 点击 OK 按钮保存更改并关闭对话框。\n7. 确保更改在主视图中可见。"
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}
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@@ -52,6 +52,7 @@
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"input_files": [
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"input_files": [
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"Si.cif"
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"Si.cif"
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],
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],
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"steps": "1. 打开 VESTA 软件并加载文件 Si.cif。\n2. 在顶部菜单中选择 View → Lattice Planes。\n3. 在对话框中选择 [110] 方向作为投影。\n4. 点击 OK 按钮应用更改。\n5. 确认主视图窗口中显示的是 [110] 方向的晶体投影。"
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"steps": "1. 双击桌面上的 \"VESTA\" 快捷方式图标打开软件\n2. 在顶部菜单栏中,单击选中 \"File\" 菜单\n3. 在弹出的下拉菜单中,单击选中 \"Open...\" 选项\n4. 在弹出的文件浏览对话框中,导航并单击选中 \"Si.cif\" 文件\n5. 单击文件浏览对话框底部的 \"打开\" 按钮加载文件\n6. 在顶部菜单栏中,单击选中 \"View\" 菜单\n7. 在弹出的下拉菜单中,单击选中 \"Lattice Planes\" 选项,打开投影方向设置对话框\n8. 在弹出的对话框中,单击将光标定位到代表晶面方向的 \"h\" 输入框\n9. 清空 \"h\" 输入框中的已有内容,输入数字 \"1\"\n10. 单击将光标定位到代表晶面方向的 \"k\" 输入框\n11. 清空 \"k\" 输入框中的已有内容,输入数字 \"1\"\n12. 单击将光标定位到代表晶面方向的 \"l\" 输入框\n13. 清空 \"l\" 输入框中的已有内容,输入数字 \"0\"\n14. 单击对话框底部的 \"OK\" 按钮应用更改并关闭对话框\n15. 观察主视图窗口,确认晶体结构已按 [110] 方向进行投影显示",
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"steps_original": "1. 打开 VESTA 软件并加载文件 Si.cif。\n2. 在顶部菜单中选择 View → Lattice Planes。\n3. 在对话框中选择 [110] 方向作为投影。\n4. 点击 OK 按钮应用更改。\n5. 确认主视图窗口中显示的是 [110] 方向的晶体投影。"
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}
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@@ -52,6 +52,7 @@
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"input_files": [
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"input_files": [
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"rutile_TiO2.cif"
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"rutile_TiO2.cif"
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],
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"steps": "1. 打开 VESTA 软件并加载 rutile_TiO2.cif 文件。\n2. 在顶部菜单中选择 File → Export → 2D Image。\n3. 在弹出的对话框中设置输出格式为 PNG,并选择合适的分辨率 (例如 300 dpi)。\n4. 设置保存路径为桌面并命名文件为 projection.png。\n5. 点击 Save 以导出图像。\n6. 验证桌面的 PNG 文件是否正确生成。"
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"steps": "1. 双击桌面上的 \"VESTA\" 快捷方式图标以启动软件\n2. 单击软件顶部菜单栏的 \"File\" 菜单\n3. 在展开的下拉菜单中,单击 \"Open...\" 菜单项\n4. 在弹出的文件选择对话框中,单击顶部的地址路径输入框\n5. 输入 rutile_TiO2.cif 文件所在的文件夹路径并按下回车键\n6. 在对话框的文件列表中,单击选中 \"rutile_TiO2.cif\" 文件\n7. 单击对话框右下角的 \"打开\" 或 \"Open\" 按钮加载晶体模型\n8. 模型加载完成后,单击顶部菜单栏的 \"File\" 菜单\n9. 在展开的下拉菜单中,单击 \"Export Raster Image...\" 或 \"Export 2D Image...\" 菜单项\n10. 在弹出的文件保存对话框中,单击左侧导航栏的 \"Desktop\" (桌面) 图标以设置保存路径\n11. 单击对话框下方的 \"File name:\" (文件名) 输入框\n12. 清空输入框中的已有内容,输入文字 \"projection\"\n13. 单击 \"Save as type:\" (保存类型) 下拉菜单\n14. 在展开的下拉列表中,单击选中 \"PNG (*.png)\" 格式选项\n15. 单击对话框右下角的 \"Save\" (保存) 按钮\n16. 在弹出的图像导出参数设置对话框中,单击选中 \"Resolution (dpi)\" (分辨率) 对应的数值输入框\n17. 清空输入框内的内容,输入数值 \"300\"\n18. 单击该对话框底部的 \"OK\" 按钮执行导出操作\n19. 单击 VESTA 软件主窗口右上角的 \"最小化\" 按钮返回系统桌面\n20. 在系统桌面上找到新生成的 \"projection.png\" 文件,双击打开以验证二维投影视图是否正确",
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"steps_original": "1. 打开 VESTA 软件并加载 rutile_TiO2.cif 文件。\n2. 在顶部菜单中选择 File → Export → 2D Image。\n3. 在弹出的对话框中设置输出格式为 PNG,并选择合适的分辨率 (例如 300 dpi)。\n4. 设置保存路径为桌面并命名文件为 projection.png。\n5. 点击 Save 以导出图像。\n6. 验证桌面的 PNG 文件是否正确生成。"
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@@ -52,6 +52,7 @@
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"input_files": [
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"input_files": [
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"YBa2Cu3O7.cif"
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"YBa2Cu3O7.cif"
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],
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],
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"steps": "1. 打开 VESTA 软件并加载文件 YBa2Cu3O7.vesta。\n2. 在顶部菜单中选择 Edit → Data → Reciprocal Lattice Parameters。\n3. 查看弹出的对话框中的倒易晶格详细数据。\n4. 点击 OK 关闭对话框。\n5. 验证数据是否已在 Text Area 中正确显示。"
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"steps": "1. 双击桌面上的\"VESTA\"快捷方式图标以打开软件\n2. 在主界面的顶部菜单栏中,单击\"File\"菜单\n3. 在展开的下拉菜单中,单击\"Open...\"选项\n4. 在弹出的文件选择对话框中,浏览文件目录并单击选中名为\"YBa2Cu3O7.vesta\"的文件\n5. 单击对话框底部的\"打开(Open)\"按钮完成文件加载\n6. 在主界面的顶部菜单栏中,单击\"Edit\"菜单\n7. 在展开的下拉菜单中,将鼠标光标悬停在\"Data\"菜单项上以展开级联子菜单\n8. 在展开的子菜单中,单击\"Reciprocal Lattice Parameters\"选项\n9. 观察弹出的数据对话框,检视其中显示的倒易晶格几何参数\n10. 单击该对话框底部的\"OK\"按钮以关闭当前弹窗\n11. 在 VESTA 主界面下方,定位到名为\"Text Area\"(输出面板)的文本区域\n12. 单击并拖动该文本区域的垂直滚动条,检查最新输出的日志中是否包含刚才查看的倒易晶格数据",
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"steps_original": "1. 打开 VESTA 软件并加载文件 YBa2Cu3O7.vesta。\n2. 在顶部菜单中选择 Edit → Data → Reciprocal Lattice Parameters。\n3. 查看弹出的对话框中的倒易晶格详细数据。\n4. 点击 OK 关闭对话框。\n5. 验证数据是否已在 Text Area 中正确显示。"
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@@ -52,6 +52,7 @@
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"input_files": [
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"input_files": [
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"monazite.cif"
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"monazite.cif"
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],
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],
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"steps": "1. 打开 VESTA 软件并加载文件 monazite.vesta。\n2. 在顶部菜单中选择 Utilities → Fourier Synthesis。\n3. 在弹出的对话框中设置分辨率值为 0.05。\n4. 点击 Calculate 按钮开始生成电子密度图。\n5. 验证生成的图形是否出现在主视图中。"
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"steps": "1. 双击桌面上的 VESTA 快捷方式图标启动软件。\n2. 在顶部菜单栏中,单击 \"File\" 菜单。\n3. 在展开的下拉菜单中,单击 \"Open...\" 选项。\n4. 在弹出的文件选择对话框中,浏览并单击选中名为 \"monazite.vesta\" 的文件。\n5. 单击文件选择对话框右下角的 \"打开(Open)\" 按钮以加载该文件。\n6. 在主界面的顶部菜单栏中,单击 \"Utilities\" 菜单。\n7. 在展开的下拉菜单中,单击 \"Fourier Synthesis...\" 选项。\n8. 在弹出的 \"Fourier Synthesis\" 对话框中,单击顶部标签为 \"Resolution (Å):\" 的输入框。\n9. 清空该输入框中的现有内容。\n10. 在该输入框中通过键盘输入数值 \"0.05\"。\n11. 单击对话框右上角的 \"Calculate\" 按钮以执行计算。\n12. 单击对话框正下方的 \"Close\" 按钮以关闭当前对话框。\n13. 观察 VESTA 的 3D 主视图区域,确认电子密度图已成功渲染并显示。",
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"steps_original": "1. 打开 VESTA 软件并加载文件 monazite.vesta。\n2. 在顶部菜单中选择 Utilities → Fourier Synthesis。\n3. 在弹出的对话框中设置分辨率值为 0.05。\n4. 点击 Calculate 按钮开始生成电子密度图。\n5. 验证生成的图形是否出现在主视图中。"
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Reference in New Issue
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