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data: 新增 jade/avogadro/ovito/pymol 评测任务数据

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lizhanyuan
2026-03-04 10:43:29 +08:00
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commit b1052c79cf
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47
evaluation_examples/examples/avogadro/using-qtaim-and-wfn_task1.json Normal file
View File

@@ -0,0 +1,47 @@
{
"id": "using-qtaim-and-wfn_task1",
"snapshot": "avogadro",
"instruction": "在 Avogadro 中，使用 QTAIM 插件的 Molecular Graph with Lone Pairs 功能打开 b2h6.wfn 文件。",
"source": "custom",
"config": [
{
"type": "launch",
"parameters": {
"command": [
"C:\\Avogadro2\\bin\\avogadro2.exe"
]
}
},
{
"type": "sleep",
"parameters": {
"seconds": 5
}
}
],
"trajectory": "trajectories/",
"related_apps": [
"avogadro"
],
"evaluator": {
"postconfig": [
{
"type": "sleep",
"parameters": {
"seconds": 3
}
}
],
"func": "vllm_eval"
},
"proxy": false,
"fixed_ip": false,
"possibility_of_env_change": "low",
"metadata": {
"input_files": [
"b2h6.wfn"
],
"steps": "1. 单击顶部菜单栏中的 \"Extensions\" 菜单项\n2. 将鼠标悬停在弹出的下拉菜单中的 \"QTAIM\" 菜单项上以展开子菜单\n3. 单击展开的子菜单中的 \"Molecular Graph with Lone Pairs...\" 菜单项\n4. 在弹出的文件选择窗口的文件列表中，单击选中名为 \"b2h6.wfn\" 的文件项\n5. 单击文件选择窗口右下角的 \"Open\" 按钮",
"steps_original": "1. 点击顶部菜单栏的 Extensions\n2. 在下拉菜单中悬停于 QTAIM 以展开子菜单\n3. 点击选择 Molecular Graph with Lone Pairs...\n4. 在弹出的文件选择窗口中，找到并选中 b2h6.wfn 文件\n5. 点击 Open 按钮加载文件并启动分析"
}
}

45
evaluation_examples/examples/avogadro/using-qtaim-and-wfn_task2.json Normal file
View File

@@ -0,0 +1,45 @@
{
"id": "using-qtaim-and-wfn_task2",
"snapshot": "avogadro",
"instruction": "在 Avogadro 中，通过调整 Display Types 面板开启 QTAIM 视图并关闭球棍模型，以便突出显示键临界点。",
"source": "custom",
"config": [
{
"type": "launch",
"parameters": {
"command": [
"C:\\Avogadro2\\bin\\avogadro2.exe"
]
}
},
{
"type": "sleep",
"parameters": {
"seconds": 5
}
}
],
"trajectory": "trajectories/",
"related_apps": [
"avogadro"
],
"evaluator": {
"postconfig": [
{
"type": "sleep",
"parameters": {
"seconds": 3
}
}
],
"func": "vllm_eval"
},
"proxy": false,
"fixed_ip": false,
"possibility_of_env_change": "low",
"metadata": {
"input_files": [],
"steps": "1. 在软件主界面中，找到标有 \"Display Types\" 的面板区域。\n2. 在 \"Display Types\" 面板的选项列表中，滚动查找并定位到标有 \"QTAIM\" 的选项。\n3. 单击 \"QTAIM\" 选项左侧的复选框，确保其处于被勾选状态。\n4. 在同一个 \"Display Types\" 面板的选项列表中，滚动查找并定位到标有 \"Ball and Stick\" 的选项。\n5. 单击 \"Ball and Stick\" 选项左侧的复选框，将其取消勾选。",
"steps_original": "1. 定位到软件界面中的 Display Types（显示类型）面板\n2. 在列表中找到 QTAIM 选项，并勾选其左侧的复选框\n3. 在同一列表中找到 Ball and Stick 选项\n4. 取消勾选 Ball and Stick 的复选框以隐藏经典模型"
}
}

47
evaluation_examples/examples/avogadro/using-qtaim-and-wfn_task3.json Normal file
View File

@@ -0,0 +1,47 @@
{
"id": "using-qtaim-and-wfn_task3",
"snapshot": "avogadro",
"instruction": "在 Avogadro 中，完整执行 QTAIM 电子密度分析流程：加载 b2h6.wfn 文件并将界面设置为仅显示 QTAIM 元素的模式。",
"source": "custom",
"config": [
{
"type": "launch",
"parameters": {
"command": [
"C:\\Avogadro2\\bin\\avogadro2.exe"
]
}
},
{
"type": "sleep",
"parameters": {
"seconds": 5
}
}
],
"trajectory": "trajectories/",
"related_apps": [
"avogadro"
],
"evaluator": {
"postconfig": [
{
"type": "sleep",
"parameters": {
"seconds": 3
}
}
],
"func": "vllm_eval"
},
"proxy": false,
"fixed_ip": false,
"possibility_of_env_change": "low",
"metadata": {
"input_files": [
"b2h6.wfn"
],
"steps": "1. 单击顶部菜单栏的 \"Extensions\" 菜单项。\n2. 在展开的下拉菜单中，单击（或鼠标悬停） \"QTAIM\" 菜单项以展开子菜单。\n3. 在弹出的级联子菜单中，单击选中 \"Molecular Graph with Lone Pairs...\" 选项。\n4. 在弹出的文件选择对话框的文件列表中，单击选中名为 \"b2h6.wfn\" 的文件。\n5. 单击对话框右下角的 \"Open\" 按钮。\n6. 等待界面弹出包含 \"Electron Density Sources Search\" 文本的进度条对话框，并等待该对话框完成处理并自动消失。\n7. 在界面侧边栏的 \"Display Types\" 列表中，向下查找并定位到 \"QTAIM\" 选项。\n8. 单击 \"QTAIM\" 选项左侧的复选框，将其状态设置为勾选。\n9. 在同一个 \"Display Types\" 列表中，向上查找并定位到 \"Ball and Stick\" 选项。\n10. 单击 \"Ball and Stick\" 选项左侧的复选框，将其状态设置为取消勾选。",
"steps_original": "1. 依次点击菜单栏的 Extensions -> QTAIM -> Molecular Graph with Lone Pairs...\n2. 在文件对话框中选中 b2h6.wfn 文件，并点击 Open 按钮\n3. 等待弹出的 Electron Density Sources Search 进度条完成并消失\n4. 在界面的 Display Types 列表中，勾选 QTAIM 选项以显示 AIM 注释\n5. 在同一列表中，取消勾选 Ball and Stick 选项以获得纯净的 QTAIM 视角"
}
}

47
evaluation_examples/examples/avogadro/viewing-molecular-orbitals_task1.json Normal file
View File

@@ -0,0 +1,47 @@
{
"id": "viewing-molecular-orbitals_task1",
"snapshot": "avogadro",
"instruction": "在 Avogadro 中，打开桌面上的 benzene.fchk 文件，并在自动弹出的 Molecular Orbitals 窗口中点击渲染 LUMO 轨道",
"source": "custom",
"config": [
{
"type": "launch",
"parameters": {
"command": [
"C:\\Avogadro2\\bin\\avogadro2.exe"
]
}
},
{
"type": "sleep",
"parameters": {
"seconds": 5
}
}
],
"trajectory": "trajectories/",
"related_apps": [
"avogadro"
],
"evaluator": {
"postconfig": [
{
"type": "sleep",
"parameters": {
"seconds": 3
}
}
],
"func": "vllm_eval"
},
"proxy": false,
"fixed_ip": false,
"possibility_of_env_change": "low",
"metadata": {
"input_files": [
"benzene.fchk"
],
"steps": "1. 在顶部菜单栏中，单击 \"File\" 菜单\n2. 在展开的下拉菜单中，单击 \"Open...\" 选项\n3. 在弹出的文件选择对话框中，单击左侧导航栏的\"桌面\"（Desktop）目录\n4. 在右侧的文件列表中，单击选中 \"benzene.fchk\" 文件\n5. 单击对话框右下角的\"打开\"（Open）按钮以加载文件\n6. 等待并定位到自动弹出的 \"Molecular Orbitals\" 窗口的轨道数据表格\n7. 在表格中，单击选中 \"Orbital\" 列文本为 \"LUMO\" 的数据行以在主视图中渲染该轨道",
"steps_original": "1. 通过 File → Open 打开桌面上的 benzene.fchk 文件（此时会自动弹出 Molecular Orbitals 窗口）\n2. 在 Molecular Orbitals 窗口的表格中，找到并点击 Orbital 列名为 'LUMO' 的行以渲染该轨道"
}
}

47
evaluation_examples/examples/avogadro/viewing-molecular-orbitals_task2.json Normal file
View File

@@ -0,0 +1,47 @@
{
"id": "viewing-molecular-orbitals_task2",
"snapshot": "avogadro",
"instruction": "在 Avogadro 中，打开桌面上的 benzene.fchk 文件，将 LUMO 轨道的渲染质量设置为 High 并重新渲染",
"source": "custom",
"config": [
{
"type": "launch",
"parameters": {
"command": [
"C:\\Avogadro2\\bin\\avogadro2.exe"
]
}
},
{
"type": "sleep",
"parameters": {
"seconds": 5
}
}
],
"trajectory": "trajectories/",
"related_apps": [
"avogadro"
],
"evaluator": {
"postconfig": [
{
"type": "sleep",
"parameters": {
"seconds": 3
}
}
],
"func": "vllm_eval"
},
"proxy": false,
"fixed_ip": false,
"possibility_of_env_change": "low",
"metadata": {
"input_files": [
"benzene.fchk"
],
"steps": "1. 单击顶部菜单栏的 \"File\" 菜单\n2. 在展开的下拉菜单中，单击选择 \"Open...\" 选项\n3. 在弹出的文件选择对话框中，在左侧导航栏或地址栏中单击定位到桌面 (Desktop)\n4. 在文件列表中，单击选中 \"benzene.fchk\" 文件\n5. 单击对话框右下角的 \"Open\" (或\"打开\") 按钮\n6. 在自动弹出的 \"Molecular Orbitals\" 窗口中，定位到包含 Orbital、Energy (eV) 和 Status 列的表格\n7. 在表格中，单击选中 \"Orbital\" 列显示为 \"LUMO\" 的行\n8. 单击窗口底部 \"Quality:\" 标签右侧的下拉菜单 (当前默认显示为 \"Medium\")\n9. 在弹出的下拉列表中，单击选中 \"High\" 选项\n10. 单击下拉菜单右侧的 \"Render\" 按钮",
"steps_original": "1. 通过 File → Open 打开桌面上的 benzene.fchk 文件\n2. 在自动弹出的 Molecular Orbitals 窗口表格中，点击选中 'LUMO' 轨道\n3. 点击窗口底部的 'Quality' 下拉菜单，将选项从默认的 'Medium' 更改为 'High'\n4. 点击右侧的 'Render' 按钮进行高质量渲染"
}
}

47
evaluation_examples/examples/avogadro/viewing-vibrations_task1.json Normal file
View File

@@ -0,0 +1,47 @@
{
"id": "viewing-vibrations_task1",
"snapshot": "avogadro",
"instruction": "在 Avogadro 中，打开频率计算文件 freq.out，在振动模式窗口中选择频率为 1264.47 cm⁻¹ 的模式并开始播放动画。",
"source": "custom",
"config": [
{
"type": "launch",
"parameters": {
"command": [
"C:\\Avogadro2\\bin\\avogadro2.exe"
]
}
},
{
"type": "sleep",
"parameters": {
"seconds": 5
}
}
],
"trajectory": "trajectories/",
"related_apps": [
"avogadro"
],
"evaluator": {
"postconfig": [
{
"type": "sleep",
"parameters": {
"seconds": 3
}
}
],
"func": "vllm_eval"
},
"proxy": false,
"fixed_ip": false,
"possibility_of_env_change": "low",
"metadata": {
"input_files": [
"freq.out"
],
"steps": "1. 单击顶部菜单栏的 \"File\" 菜单项\n2. 在展开的下拉菜单中，单击 \"Open...\" 菜单项\n3. 在弹出的文件选择对话框中，单击左侧导航面板中的 \"桌面\"（或 Desktop）选项\n4. 在对话框的文件列表区域中，单击选中名为 \"freq.out\" 的文件\n5. 单击文件选择对话框右下角的 \"打开\"（或 Open）按钮（此时会自动弹出 \"Vibrational Modes\" 窗口）\n6. 定位到新弹出的 \"Vibrational Modes\" 窗口中央的数据表格\n7. 在该数据表格中，单击选中第一列序号为 \"8\" 且 \"Frequency (cm⁻¹)\" 列为 \"1264.47\" 的所在行\n8. 定位到 \"Vibrational Modes\" 窗口的底部区域\n9. 单击标签为 \"Start Animation\" 的按钮",
"steps_original": "1. 在 Avogadro 中，通过 File → Open 菜单打开桌面上的 freq.out 文件（此时会自动弹出 Vibrational Modes 窗口）\n2. 在 Vibrational Modes 窗口的列表中，找到并点击选中序号为 8、Frequency 为 1264.47 cm⁻¹ 的行\n3. 点击窗口右下角的 Start Animation 按钮开始播放分子的振动动画"
}
}

47
evaluation_examples/examples/avogadro/viewing-vibrations_task2.json Normal file
View File

@@ -0,0 +1,47 @@
{
"id": "viewing-vibrations_task2",
"snapshot": "avogadro",
"instruction": "在 Avogadro 中，打开包含拉曼光谱计算结果的文件 raman.out，播放 1188.7 cm⁻¹ 频率的振动动画，调大振动幅度后停止播放。",
"source": "custom",
"config": [
{
"type": "launch",
"parameters": {
"command": [
"C:\\Avogadro2\\bin\\avogadro2.exe"
]
}
},
{
"type": "sleep",
"parameters": {
"seconds": 5
}
}
],
"trajectory": "trajectories/",
"related_apps": [
"avogadro"
],
"evaluator": {
"postconfig": [
{
"type": "sleep",
"parameters": {
"seconds": 3
}
}
],
"func": "vllm_eval"
},
"proxy": false,
"fixed_ip": false,
"possibility_of_env_change": "low",
"metadata": {
"input_files": [
"raman.out"
],
"steps": "1. 点击软件顶部菜单栏的 \"File\" 菜单项\n2. 在展开的下拉菜单中，单击 \"Open...\" 选项\n3. 在弹出的文件选择对话框中，通过侧边栏或路径栏点击进入桌面目录\n4. 在文件列表中，单击选中名为 \"raman.out\" 的文件\n5. 点击对话框右下角的 \"Open\"（或“打开”）按钮\n6. 等待自动弹出 \"Vibrational Modes\" 窗口后，在该窗口的表格列表中，找到第一列为 \"7\"、\"Frequency (cm⁻¹)\" 列为 \"1188.7\" 的数据行\n7. 单击该数据行将其选中\n8. 在窗口底部，单击标签文字为 \"Start Animation\" 的按钮\n9. 将鼠标光标移动到窗口底部 \"Amplitude:\" 标签右侧的滑块控件的手柄上\n10. 按下鼠标左键不放\n11. 向右移动鼠标拖动滑块手柄\n12. 松开鼠标左键\n13. 在窗口底部，单击标签文字为 \"Stop Animation\" 的按钮",
"steps_original": "1. 在 Avogadro 中，通过 File → Open 菜单打开桌面上的 raman.out 文件，等待 Vibrational Modes 窗口自动出现\n2. 在列表中点击选中序号为 7、Frequency 为 1188.7 cm⁻¹ 的行\n3. 点击 Start Animation 按钮启动振动动画\n4. 使用鼠标按住窗口底部的 Amplitude 滑块并向右拖动，以增大振动显示的幅度\n5. 观察动画变化后，点击 Stop Animation 按钮停止播放"
}
}

45
evaluation_examples/examples/jade/jade-guide-example_task1.json Normal file
View File

@@ -0,0 +1,45 @@
{
"id": "jade-guide-example_task1",
"snapshot": "jade",
"instruction": "在 Jade 中，通过 Edit → Preferences 打开程序设置对话框，并切换到 Instrument 标签查看设置。",
"source": "custom",
"config": [
{
"type": "launch",
"parameters": {
"command": [
"C:\\JADE\\jade 6.5\\MDI Jade 6.5\\jade6.5.exe"
]
}
},
{
"type": "sleep",
"parameters": {
"seconds": 5
}
}
],
"trajectory": "trajectories/",
"related_apps": [
"jade"
],
"evaluator": {
"postconfig": [
{
"type": "sleep",
"parameters": {
"seconds": 3
}
}
],
"func": "vllm_eval"
},
"proxy": false,
"fixed_ip": false,
"possibility_of_env_change": "low",
"metadata": {
"input_files": [],
"steps": "1. 在软件顶部的主菜单栏中，单击鼠标左键选择 \"Edit\" 菜单。\n2. 在展开的下拉菜单中，单击鼠标左键选择 \"Preferences\" 菜单项，等待弹出程序设置对话框。\n3. 在弹出的程序设置对话框顶部，单击鼠标左键选中名为 \"Instrument\" 的选项卡（标签页）以查看相关设置。",
"steps_original": "1. 在主菜单中点击 Edit。\n2. 选择 Preferences，打开程序设置对话框。\n3. 点击对话框上方的 Instrument 标签，查看相关设置。"
}
}

47
evaluation_examples/examples/jade/jade-guide-example_task10.json Normal file
View File

@@ -0,0 +1,47 @@
{
"id": "jade-guide-example_task10",
"snapshot": "jade",
"instruction": "在 Jade 中，加载 DEMO001.MDI 后，右键单击主工具栏打印按钮打开打印预览窗口，点击 Setup → Layout，勾选 Generate Profile on d-I Lines 等选项，然后使用垂直放大工具对图谱局部进行放大。",
"source": "custom",
"config": [
{
"type": "launch",
"parameters": {
"command": [
"C:\\JADE\\jade 6.5\\MDI Jade 6.5\\jade6.5.exe"
]
}
},
{
"type": "sleep",
"parameters": {
"seconds": 5
}
}
],
"trajectory": "trajectories/",
"related_apps": [
"jade"
],
"evaluator": {
"postconfig": [
{
"type": "sleep",
"parameters": {
"seconds": 3
}
}
],
"func": "vllm_eval"
},
"proxy": false,
"fixed_ip": false,
"possibility_of_env_change": "low",
"metadata": {
"input_files": [
"DEMO001.MDI"
],
"steps": "1. 单击顶部菜单栏的 \"File\" 菜单项\n2. 在弹出的下拉菜单中，单击选择 \"Patterns...\" 打开数据文件读入窗口\n3. 在文件读入窗口的文件列表中，单击选中 \"DEMO001.MDI\" 文件\n4. 单击窗口下方的 \"Read\" 按钮，加载数据文件\n5. 在界面上方的主工具栏中，找到 \"打印\" 图标按钮\n6. 右键单击该 \"打印\" 图标按钮，打开打印预览窗口\n7. 在打印预览窗口中，单击左侧的 \"命令\" 按钮\n8. 单击窗口中的 \"Setup\" 按钮，打开预览设置对话框\n9. 在预览设置对话框的顶部，单击选择 \"Layout\" 选项卡标签\n10. 在 Layout 页面中，找到 \"Generate Profile on d-I Lines\" 复选框并单击勾选\n11. 找到 \"Show ID Labels on d-I Lines\" 复选框并单击勾选\n12. 找到 \"Place X-Axis Scaling above Ribbons\" 复选框并单击勾选\n13. 单击对话框的关闭或确认按钮，退出打印预览设置对话框\n14. 在打印预览窗口顶部的图谱编辑按钮栏中，左键单击 \"垂直放大\" 命令按钮\n15. 将鼠标移动到图谱区域中需要垂直放大的局部位置\n16. 按住鼠标左键不放\n17. 向上拖拽鼠标进行区域拉伸\n18. 松开鼠标左键，完成局部垂直放大",
"steps_original": "1. 通过 File → Patterns 加载 DEMO001.MDI 文件。\n2. 右键单击主工具栏中的打印按钮，打开打印预览窗口。\n3. 点击窗口左侧的命令按钮。\n4. 点击 Setup 按钮，打开预览设置对话框。\n5. 点击上方的 Layout 标签。\n6. 勾选 Generate Profile on d-I Lines。\n7. 勾选 Show ID Labels on d-I Lines。\n8. 勾选 Place X-Axis Scaling above Ribbons。\n9. 关闭设置对话框。\n10. 选择图谱编辑按钮中的垂直放大命令，左键单击。\n11. 在图谱中选择需要放大的局部区域向上拉伸。"
}
}

47
evaluation_examples/examples/jade/jade-guide-example_task11.json Normal file
View File

@@ -0,0 +1,47 @@
{
"id": "jade-guide-example_task11",
"snapshot": "jade",
"instruction": "在 Jade 中，加载 DEMO001.MDI 后，使用主工具栏的图谱平滑按钮对衍射图谱执行平滑处理。",
"source": "custom",
"config": [
{
"type": "launch",
"parameters": {
"command": [
"C:\\JADE\\jade 6.5\\MDI Jade 6.5\\jade6.5.exe"
]
}
},
{
"type": "sleep",
"parameters": {
"seconds": 5
}
}
],
"trajectory": "trajectories/",
"related_apps": [
"jade"
],
"evaluator": {
"postconfig": [
{
"type": "sleep",
"parameters": {
"seconds": 3
}
}
],
"func": "vllm_eval"
},
"proxy": false,
"fixed_ip": false,
"possibility_of_env_change": "low",
"metadata": {
"input_files": [
"DEMO001.MDI"
],
"steps": "1. 单击顶部菜单栏的 \"File\" 菜单项。\n2. 在弹出的下拉菜单中，单击选中 \"Patterns\" 选项，打开数据文件读入窗口。\n3. 在数据文件读入窗口中，单击选择包含目标文件的磁盘驱动器。\n4. 在文件夹列表中，依次双击展开并选中存储有目标数据的文件夹。\n5. 单击文件类型下拉菜单，在展开的列表中单击选中 \"All\"。\n6. 在文件列表中，单击选中名为 \"DEMO001.MDI\" 的文件。\n7. 单击窗口中的 \"Read\" 按钮，加载该数据文件。\n8. 在主界面的主工具栏中，找到并单击 \"平滑\"（Smooth）按钮。\n9. 观察全谱窗口或工作窗口中的衍射图谱，确认图谱曲线由于平滑处理变得更加光滑。",
"steps_original": "1. 通过 File → Patterns 加载 DEMO001.MDI 文件。\n2. 在主工具栏中找到图谱平滑按钮（Smooth）。\n3. 左键单击平滑按钮，对当前衍射图谱执行平滑处理。\n4. 观察图谱变化，确认平滑效果已应用（图谱曲线变得更光滑）。"
}
}

47
evaluation_examples/examples/jade/jade-guide-example_task12.json Normal file
View File

@@ -0,0 +1,47 @@
{
"id": "jade-guide-example_task12",
"snapshot": "jade",
"instruction": "在 Jade 中，加载 DEMO001.MDI 后，使用编辑工具栏的背景扣除功能对衍射图谱执行背景扣除操作。",
"source": "custom",
"config": [
{
"type": "launch",
"parameters": {
"command": [
"C:\\JADE\\jade 6.5\\MDI Jade 6.5\\jade6.5.exe"
]
}
},
{
"type": "sleep",
"parameters": {
"seconds": 5
}
}
],
"trajectory": "trajectories/",
"related_apps": [
"jade"
],
"evaluator": {
"postconfig": [
{
"type": "sleep",
"parameters": {
"seconds": 3
}
}
],
"func": "vllm_eval"
},
"proxy": false,
"fixed_ip": false,
"possibility_of_env_change": "low",
"metadata": {
"input_files": [
"DEMO001.MDI"
],
"steps": "1. 单击主界面顶部菜单栏中的 \"File\" 菜单。\n2. 在弹出的下拉菜单中，单击选择 \"Patterns...\" 选项，打开数据文件读入窗口。\n3. 在数据文件读入窗口中，单击对应的磁盘下拉菜单或图标，选择目标文件所在的磁盘驱动器。\n4. 在目录树列表中，双击展开文件夹以导航至保存有数据的目标文件夹。\n5. 在文件类型（格式）下拉菜单中，单击并选择 \"All\"，以确保显示所有格式的数据文件。\n6. 在文件列表显示区中，单击选中名为 \"DEMO001.MDI\" 的文件。\n7. 单击窗口中的 \"Read\" 命令按钮，将该衍射数据文件读入全谱窗口中。\n8. 在主界面下方的编辑工具栏中，定位到 \"扣除背景\"（Background，通常标为BG）按钮。\n9. 鼠标左键单击该 \"扣除背景\" 按钮，直接对当前的衍射图谱执行背景扣除命令。\n10. 观察全谱窗口中的衍射图谱，确认下方的背景基线已被扣除并变为平直线。",
"steps_original": "1. 通过 File → Patterns 加载 DEMO001.MDI 文件。\n2. 在编辑工具栏中找到背景扣除按钮（Background）。\n3. 左键单击背景扣除按钮，对当前衍射图谱执行背景扣除操作。\n4. 观察图谱变化，确认背景已被扣除（基线变为平直）。"
}
}

45
evaluation_examples/examples/jade/jade-guide-example_task2.json Normal file
View File

@@ -0,0 +1,45 @@
{
"id": "jade-guide-example_task2",
"snapshot": "jade",
"instruction": "在 Jade 中，设置 NBS Silicon 为XRD背底曲线并查看峰宽。",
"source": "custom",
"config": [
{
"type": "launch",
"parameters": {
"command": [
"C:\\JADE\\jade 6.5\\MDI Jade 6.5\\jade6.5.exe"
]
}
},
{
"type": "sleep",
"parameters": {
"seconds": 5
}
}
],
"trajectory": "trajectories/",
"related_apps": [
"jade"
],
"evaluator": {
"postconfig": [
{
"type": "sleep",
"parameters": {
"seconds": 3
}
}
],
"func": "vllm_eval"
},
"proxy": false,
"fixed_ip": false,
"possibility_of_env_change": "low",
"metadata": {
"input_files": [],
"steps": "1. 单击顶部菜单栏中的 \"Edit\" 菜单。\n2. 在弹出的下拉菜单中，单击选中 \"preferences\" 菜单项，打开程序设置对话框。\n3. 在程序设置对话框中，单击选中 \"Instrument\" 标签页。\n4. 单击对话框最下方的下拉菜单控件以将其展开。\n5. 在展开的下拉列表选项中，单击选中 \"NBS Silicon1\"。\n6. 单击对话框中的 \"VIEW FWHM Curve\" 按钮以查看峰宽曲线。",
"steps_original": "1. 在程序设置对话框中点击 Instrument 标签。\n2. 从下拉菜单中选择 NBS Silicon1 作为 XRD 背底曲线。\n3. 点击 'View FWHM Curve' 查看峰宽曲线。"
}
}

47
evaluation_examples/examples/jade/jade-guide-example_task3.json Normal file
View File

@@ -0,0 +1,47 @@
{
"id": "jade-guide-example_task3",
"snapshot": "jade",
"instruction": "在 Jade 中，通过 File → Patterns 打开衍射数据文件 DEMO001.MDI。",
"source": "custom",
"config": [
{
"type": "launch",
"parameters": {
"command": [
"C:\\JADE\\jade 6.5\\MDI Jade 6.5\\jade6.5.exe"
]
}
},
{
"type": "sleep",
"parameters": {
"seconds": 5
}
}
],
"trajectory": "trajectories/",
"related_apps": [
"jade"
],
"evaluator": {
"postconfig": [
{
"type": "sleep",
"parameters": {
"seconds": 3
}
}
],
"func": "vllm_eval"
},
"proxy": false,
"fixed_ip": false,
"possibility_of_env_change": "low",
"metadata": {
"input_files": [
"DEMO001.MDI"
],
"steps": "1. 单击主界面顶部菜单栏中的 \"File\" 菜单项\n2. 在展开的下拉菜单中，单击 \"Patterns\" 菜单项，弹出数据文件读入窗口\n3. 在文件读入窗口中，单击磁盘选择下拉菜单将其展开\n4. 在弹出的驱动器列表中，单击选中目标文件所在的磁盘\n5. 在文件夹树形列表中，双击展开并选中包含目标文件的文件夹\n6. 单击文件类型下拉菜单将其展开\n7. 在弹出的文件类型列表中，单击选中 \"All\" 数据类型选项\n8. 在文件展示列表中，单击选中名为 \"DEMO001.MDI\" 的数据文件\n9. 单击窗口中的 \"Read\" 命令按钮，以读入该数据文件",
"steps_original": "1. 在主菜单中点击 File。\n2. 选择 Patterns，打开文件选择对话框。\n3. 浏览并选择 DEMO001.MDI 文件，点击 Read。"
}
}

47
evaluation_examples/examples/jade/jade-guide-example_task4.json Normal file
View File

@@ -0,0 +1,47 @@
{
"id": "jade-guide-example_task4",
"snapshot": "jade",
"instruction": "在 Jade 中，先加载 DEMO001.MDI，然后通过 File → Patterns 使用 Add 按钮叠加第二个衍射数据文件到同一窗口。",
"source": "custom",
"config": [
{
"type": "launch",
"parameters": {
"command": [
"C:\\JADE\\jade 6.5\\MDI Jade 6.5\\jade6.5.exe"
]
}
},
{
"type": "sleep",
"parameters": {
"seconds": 5
}
}
],
"trajectory": "trajectories/",
"related_apps": [
"jade"
],
"evaluator": {
"postconfig": [
{
"type": "sleep",
"parameters": {
"seconds": 3
}
}
],
"func": "vllm_eval"
},
"proxy": false,
"fixed_ip": false,
"possibility_of_env_change": "low",
"metadata": {
"input_files": [
"DEMO001.MDI"
],
"steps": "1. 单击主菜单栏中的“File”菜单项。\n2. 在弹出的下拉菜单中，单击“Patterns”菜单项，打开数据文件读入窗口。\n3. 在数据文件读入窗口左上角的驱动器下拉菜单中，单击选择存放数据的磁盘。\n4. 在其下方的文件夹列表框中，双击逐层展开并单击选中包含目标 XRD 数据的文件夹。\n5. 单击文件列表下方的文件类型下拉菜单，从中选择“All”选项以显示所有数据类型。\n6. 在右侧的文件列表框中，单击选中名为“DEMO001.MDI”的文件。\n7. 单击窗口右侧区域的“Read”命令按钮，加载该数据文件。\n8. 再次单击主菜单栏中的“File”菜单项。\n9. 在弹出的下拉菜单中，单击“Patterns”菜单项，重新打开数据文件读入窗口。\n10. （如果路径改变）按照前述步骤在驱动器和文件夹列表框中选择目标路径。\n11. 在文件列表框中，单击选中另一个需要叠加的 DEMO 数据文件。\n12. 单击窗口右侧区域的“Add”命令按钮，将第二个数据文件叠加显示到当前窗口中。",
"steps_original": "1. 在主菜单中点击 File。\n2. 选择 Patterns，打开文件选择对话框。\n3. 选择 DEMO001.MDI 文件，点击 Read 加载。\n4. 再次点击 File → Patterns。\n5. 选择另一个可用的 DEMO 数据文件，点击 Add 按钮将其叠加到当前窗口。"
}
}

45
evaluation_examples/examples/jade/jade-guide-example_task5.json Normal file
View File

@@ -0,0 +1,45 @@
{
"id": "jade-guide-example_task5",
"snapshot": "jade",
"instruction": "在 Jade 中，创建 PDF 数据库索引卡并保存到默认路径。",
"source": "custom",
"config": [
{
"type": "launch",
"parameters": {
"command": [
"C:\\JADE\\jade 6.5\\MDI Jade 6.5\\jade6.5.exe"
]
}
},
{
"type": "sleep",
"parameters": {
"seconds": 5
}
}
],
"trajectory": "trajectories/",
"related_apps": [
"jade"
],
"evaluator": {
"postconfig": [
{
"type": "sleep",
"parameters": {
"seconds": 3
}
}
],
"func": "vllm_eval"
},
"proxy": false,
"fixed_ip": false,
"possibility_of_env_change": "low",
"metadata": {
"input_files": [],
"steps": "1. 单击软件顶部主菜单栏中的 \"Tools\" 菜单。\n2. 在展开的下拉菜单中，单击对应创建索引的菜单项，打开 PDF 索引建立窗口。\n3. 在打开的 PDF 索引建立窗口中，单击选中 \"PDF2.DAT 文件\" 选项（或单击对应按钮选择该文件）作为数据来源。\n4. 观察窗口中“保存索引的位置”路径输入框，确认其保持为系统自动设置的默认路径，无需进行修改。\n5. 单击 PDF 索引建立窗口中的 \"Select All\" 按钮，以全选所需内容。\n6. 单击 PDF 索引建立窗口中的 \"Create\" 按钮开始建立索引。\n7. 等待程序运行（约需 10 分钟），直到索引生成过程完全结束。",
"steps_original": "1. 在主菜单中点击 Tools。\n2. 选择 'PDF2DAT 文件'，打开 PDF 索引创建窗口。\n3. 点击 Select All 命令。\n4. 点击 Create 按钮，等待索引生成完成。"
}
}

47
evaluation_examples/examples/jade/jade-guide-example_task6.json Normal file
View File

@@ -0,0 +1,47 @@
{
"id": "jade-guide-example_task6",
"snapshot": "jade",
"instruction": "在 Jade 中，加载 DEMO001.MDI 后，通过主工具栏的自动寻峰按钮对衍射图谱执行自动寻峰。",
"source": "custom",
"config": [
{
"type": "launch",
"parameters": {
"command": [
"C:\\JADE\\jade 6.5\\MDI Jade 6.5\\jade6.5.exe"
]
}
},
{
"type": "sleep",
"parameters": {
"seconds": 5
}
}
],
"trajectory": "trajectories/",
"related_apps": [
"jade"
],
"evaluator": {
"postconfig": [
{
"type": "sleep",
"parameters": {
"seconds": 3
}
}
],
"func": "vllm_eval"
},
"proxy": false,
"fixed_ip": false,
"possibility_of_env_change": "low",
"metadata": {
"input_files": [
"DEMO001.MDI"
],
"steps": "1. 单击软件顶部菜单栏中的 \"File\" 菜单项。\n2. 在弹出的下拉菜单中，单击选择 \"Patterns\" 菜单项，打开数据文件读入窗口。\n3. 在数据文件读入窗口中，单击磁盘选择控件选中目标磁盘。\n4. 在文件夹列表区域中，双击对应的文件夹节点导航至包含目标数据的文件夹。\n5. 在数据类型筛选区域中，单击选中 \"All\" 选项以显示所有支持的数据类型。\n6. 在文件列表区域中，单击选中名为 \"DEMO001.MDI\" 的数据文件。\n7. 单击窗口中的 \"Read\" 命令按钮以读入该数据文件。\n8. 在主界面的主工具栏中，左键单击 \"自动寻峰\" 按钮。\n9. 观察主工作窗口中的衍射曲线，确认各个衍射峰处已自动添加峰标记符号。",
"steps_original": "1. 通过 File → Patterns 加载 DEMO001.MDI 文件。\n2. 在主工具栏中左键单击自动寻峰按钮。\n3. 查看图谱中标记的衍射峰，确认自动寻峰结果已显示。"
}
}

47
evaluation_examples/examples/jade/jade-guide-example_task7.json Normal file
View File

@@ -0,0 +1,47 @@
{
"id": "jade-guide-example_task7",
"snapshot": "jade",
"instruction": "在 Jade 中，加载 DEMO001.MDI 后，使用编辑工具栏的手动寻峰功能，在一个衍射峰位置左键单击添加峰标记，然后在另一个峰标记处右键单击删除该峰标记。",
"source": "custom",
"config": [
{
"type": "launch",
"parameters": {
"command": [
"C:\\JADE\\jade 6.5\\MDI Jade 6.5\\jade6.5.exe"
]
}
},
{
"type": "sleep",
"parameters": {
"seconds": 5
}
}
],
"trajectory": "trajectories/",
"related_apps": [
"jade"
],
"evaluator": {
"postconfig": [
{
"type": "sleep",
"parameters": {
"seconds": 3
}
}
],
"func": "vllm_eval"
},
"proxy": false,
"fixed_ip": false,
"possibility_of_env_change": "low",
"metadata": {
"input_files": [
"DEMO001.MDI"
],
"steps": "1. 点击顶部菜单栏的 \"File\" 菜单\n2. 在弹出的下拉菜单中，单击选择 \"Patterns\" 选项，打开数据文件读入窗口\n3. 在数据文件读入窗口的文件列表区域，单击选中 \"DEMO001.MDI\" 文件\n4. 单击窗口中的 \"Read\" 按钮，加载读入该数据文件\n5. 在主界面下方的编辑工具栏中，左键单击\"手动寻峰\"命令按钮\n6. 在主界面的图谱显示窗口中，将鼠标光标移动到某一个未标记的衍射峰下方位置\n7. 在该位置左键单击，添加一个新的峰标记\n8. 在图谱显示窗口中，将鼠标光标移动到另一个已有峰标记的垂直中心线位置\n9. 在该中心线处右键单击，删除该处的峰标记",
"steps_original": "1. 通过 File → Patterns 加载 DEMO001.MDI 文件。\n2. 左键点击编辑工具栏中的手动寻峰命令按钮。\n3. 在图谱中某一个衍射峰下方左键单击，添加一个峰标记。\n4. 在另一个已有峰标记的中心线处右键单击，删除该峰标记。"
}
}

47
evaluation_examples/examples/jade/jade-guide-example_task8.json Normal file
View File

@@ -0,0 +1,47 @@
{
"id": "jade-guide-example_task8",
"snapshot": "jade",
"instruction": "在 Jade 中，加载 DEMO001.MDI 并执行自动寻峰后，通过 >> → Report → Peak Search Report 查看寻峰报告。",
"source": "custom",
"config": [
{
"type": "launch",
"parameters": {
"command": [
"C:\\JADE\\jade 6.5\\MDI Jade 6.5\\jade6.5.exe"
]
}
},
{
"type": "sleep",
"parameters": {
"seconds": 5
}
}
],
"trajectory": "trajectories/",
"related_apps": [
"jade"
],
"evaluator": {
"postconfig": [
{
"type": "sleep",
"parameters": {
"seconds": 3
}
}
],
"func": "vllm_eval"
},
"proxy": false,
"fixed_ip": false,
"possibility_of_env_change": "low",
"metadata": {
"input_files": [
"DEMO001.MDI"
],
"steps": "1. 单击主菜单栏中的 'File' 菜单。\n2. 在下拉菜单中选择并单击 'Patterns...' 选项，打开数据读入对话框。\n3. 在数据读入对话框中，单击选择磁盘。\n4. 单击选择 XRD 数据文件夹。\n5. 在数据类型下拉菜单中，选择 'All'。\n6. 在文件列表中单击选中 'DEMO001.MDI' 数据文件。\n7. 单击对话框中的 'Read' 按钮，读入文件。\n8. 在主工具栏中，左键单击 '自动寻峰' 按钮执行自动寻峰。\n9. 单击工具栏中的 '>>' 按钮展开更多选项菜单。\n10. 在展开的选项中单击 'Report' 菜单项。\n11. 在子菜单中选择并单击 'Peak Search Report'，打开寻峰报告对话框进行查看。",
"steps_original": "1. 通过 File → Patterns 加载 DEMO001.MDI 文件。\n2. 左键单击主工具栏自动寻峰按钮执行寻峰。\n3. 点击 >> 按钮展开更多选项。\n4. 点击 Report 按钮。\n5. 选择 Peak Search Report，打开并查看寻峰报告。"
}
}

47
evaluation_examples/examples/jade/jade-guide-example_task9.json Normal file
View File

@@ -0,0 +1,47 @@
{
"id": "jade-guide-example_task9",
"snapshot": "jade",
"instruction": "在 Jade 中，加载 DEMO001.MDI 后，对一个衍射峰区域进行单峰拟合：在全谱窗口中框选峰区域，右键点击自动拟合按钮打开参数对话框，勾选 Individual Profiles，执行 Initialize 和 Refine 操作。",
"source": "custom",
"config": [
{
"type": "launch",
"parameters": {
"command": [
"C:\\JADE\\jade 6.5\\MDI Jade 6.5\\jade6.5.exe"
]
}
},
{
"type": "sleep",
"parameters": {
"seconds": 5
}
}
],
"trajectory": "trajectories/",
"related_apps": [
"jade"
],
"evaluator": {
"postconfig": [
{
"type": "sleep",
"parameters": {
"seconds": 3
}
}
],
"func": "vllm_eval"
},
"proxy": false,
"fixed_ip": false,
"possibility_of_env_change": "low",
"metadata": {
"input_files": [
"DEMO001.MDI"
],
"steps": "1. 单击界面顶部菜单栏中的“File”菜单项。\n2. 在弹出的下拉菜单中，单击选择“Patterns”选项，打开数据文件读入窗口。\n3. 在数据文件读入窗口的磁盘驱动器下拉菜单中，单击选择存放数据的目标磁盘。\n4. 在左侧文件夹列表树中，单击展开并选中包含文件的目标文件夹。\n5. 在数据类型下拉菜单中，单击选择“All”选项以显示所有数据类型。\n6. 在右侧的文件列表中，单击选中名为“DEMO001.MDI”的特定文件。\n7. 单击读入窗口中的“Read”命令按钮，加载该数据文件。\n8. 将鼠标光标移动到主工具栏，左键单击“自动寻峰”按钮执行自动寻峰操作。\n9. 将鼠标光标移动到主界面的全谱窗口区域内。\n10. 在目标衍射峰的一侧按下鼠标左键，拖拽光标画出一个矩形框将该待拟合峰区域完全圈住。\n11. 松开鼠标左键，完成峰区域的选择并将其放大显示在工作窗口中。\n12. 将鼠标光标移动到主工具栏中的“自动拟合”命令按钮上。\n13. 单击鼠标右键，打开拟合参数设置对话框。\n14. 在拟合参数设置对话框中，找到并单击勾选“Individual Profiles”复选框。\n15. 将鼠标光标移动到界面的编辑工具栏中，左键单击“手动拟合”命令按钮。\n16. 将鼠标光标移动到放大的工作窗口中目标衍射峰下方的中心位置，单击鼠标左键，标记对该峰进行拟合。\n17. 返回拟合参数设置对话框，左键单击“Initialize”命令按钮以初始化拟合参数。\n18. 在拟合参数设置对话框中，左键单击“Refine”命令按钮执行一次拟合修正。\n19. 观察主界面右上角显示的拟合误差 R 值，若 R 值大于或等于 5%，则再次左键单击“Refine”按钮，重复此操作直至 R 值小于 5% 为止。",
"steps_original": "1. 通过 File → Patterns 加载 DEMO001.MDI 文件。\n2. 左键单击主工具栏自动寻峰按钮执行寻峰。\n3. 在全谱窗口中拖拽鼠标画一个矩形框，圈住要拟合的峰区域。\n4. 右键点击主工具栏中的自动拟合按钮，打开拟合参数设置对话框。\n5. 在对话框中勾选 Individual Profiles。\n6. 左键点击编辑工具栏中的手动拟合命令按钮。\n7. 在目标峰下方单击执行拟合。\n8. 点击 Initialize 按钮初始化拟合。\n9. 多次点击 Refine 按钮直到右上角拟合误差 R 小于 5%。"
}
}

47
evaluation_examples/examples/ovito/viewports_task1.json Normal file
View File

@@ -0,0 +1,47 @@
{
"id": "viewports_task1",
"snapshot": "ovito",
"instruction": "在 OVITO 中，加载 sample.dump 文件后，使用工具栏的 Maximize viewport 按钮将当前视口最大化。",
"source": "custom",
"config": [
{
"type": "launch",
"parameters": {
"command": [
"C:\\OVITO Basic\\ovito.exe"
]
}
},
{
"type": "sleep",
"parameters": {
"seconds": 5
}
}
],
"trajectory": "trajectories/",
"related_apps": [
"ovito"
],
"evaluator": {
"postconfig": [
{
"type": "sleep",
"parameters": {
"seconds": 3
}
}
],
"func": "vllm_eval"
},
"proxy": false,
"fixed_ip": false,
"possibility_of_env_change": "low",
"metadata": {
"input_files": [
"sample.dump"
],
"steps": "1. 单击顶部菜单栏的 \"File\" 菜单项\n2. 在展开的下拉菜单中，单击 \"Load File...\" 选项\n3. 在弹出的文件选择对话框中，单击左侧导航栏的 \"桌面\" 选项\n4. 在右侧的文件列表中，单击选中 \"sample.dump\" 文件\n5. 单击对话框底部的 \"打开\" 按钮\n6. 单击左上角带有 \"Perspective\" 标签的视口内部任意位置，使其成为活动视口\n7. 单击视口工作区下方工具栏中，图标为向外指的四个箭头的 \"Maximize viewport\" 按钮",
"steps_original": "1. 在 OVITO 中，通过 File -> Load File... 加载桌面上的 \"sample.dump\" 文件\n2. 点击当前活动视口（例如左上角的 Perspective 视口）使其处于选中状态\n3. 点击视口工作区下方工具栏中的 \"Maximize viewport\" 按钮（图标为向外指的四个箭头）\n4. 确认该视口已扩展并填满整个主工作区"
}
}

47
evaluation_examples/examples/ovito/viewports_task10.json Normal file
View File

@@ -0,0 +1,47 @@
{
"id": "viewports_task10",
"snapshot": "ovito",
"instruction": "在 OVITO 中，通过双击模型设置新的相机轨道中心，然后再双击空白处重置它。",
"source": "custom",
"config": [
{
"type": "launch",
"parameters": {
"command": [
"C:\\OVITO Basic\\ovito.exe"
]
}
},
{
"type": "sleep",
"parameters": {
"seconds": 5
}
}
],
"trajectory": "trajectories/",
"related_apps": [
"ovito"
],
"evaluator": {
"postconfig": [
{
"type": "sleep",
"parameters": {
"seconds": 3
}
}
],
"func": "vllm_eval"
},
"proxy": false,
"fixed_ip": false,
"possibility_of_env_change": "low",
"metadata": {
"input_files": [
"sample.dump"
],
"steps": "1. 在主界面的顶部菜单栏中，单击 \"File\" 菜单\n2. 在弹出的下拉菜单中，单击 \"Load File...\" 菜单项\n3. 在弹出的文件选择对话框中，单击将光标定位到文件名输入框，并输入 \"sample.dump\"\n4. 单击文件选择对话框右下角的 \"Open\" 按钮加载模型文件\n5. 将鼠标光标移动到主界面的 3D 视口区域中，对准模型边缘的某一个原子球体对象\n6. 在对准的原子球体对象上，双击鼠标左键\n7. 观察 3D 视口，确认双击位置出现了一个由红绿蓝线段组成的 3D 十字标记\n8. 在 3D 视口区域内任意位置，按住鼠标左键不放\n9. 移动鼠标拖动画面，观察并确认 3D 模型正围绕着该 3D 十字标记进行旋转\n10. 松开鼠标左键，停止拖动\n11. 将鼠标光标移动到 3D 视口区域中没有模型对象的纯黑色空白背景处\n12. 在该纯黑色空白背景处，双击鼠标左键\n13. 观察 3D 视口，确认之前出现的 3D 十字标记已经消失\n14. 在 3D 视口区域内任意位置，再次按住鼠标左键不放\n15. 移动鼠标拖动画面，观察并确认此时场景的旋转中心已经恢复为整个模型的默认几何中心\n16. 松开鼠标左键，结束验证操作",
"steps_original": "1. 在 OVITO 中，加载 \"sample.dump\" 文件\n2. 将鼠标光标对准视口中模型边缘的某一个原子（或对象），然后双击鼠标左键\n3. 确认双击的位置出现了一个 3D 十字标记，代表相机当前的轨道中心\n4. 按住鼠标左键拖动，验证此时场景是围绕着该十字标记旋转的\n5. 将鼠标光标移至视口中没有对象的纯黑背景空白区域，双击鼠标左键\n6. 确认 3D 十字标记消失，相机的轨道中心重置回整个模型的几何中心"
}
}

45
evaluation_examples/examples/ovito/viewports_task11.json Normal file
View File

@@ -0,0 +1,45 @@
{
"id": "viewports_task11",
"snapshot": "ovito",
"instruction": "在 OVITO 中，通过视口菜单打开 Viewport Graphics Configuration 对话框调整渲染设置。",
"source": "custom",
"config": [
{
"type": "launch",
"parameters": {
"command": [
"C:\\OVITO Basic\\ovito.exe"
]
}
},
{
"type": "sleep",
"parameters": {
"seconds": 5
}
}
],
"trajectory": "trajectories/",
"related_apps": [
"ovito"
],
"evaluator": {
"postconfig": [
{
"type": "sleep",
"parameters": {
"seconds": 3
}
}
],
"func": "vllm_eval"
},
"proxy": false,
"fixed_ip": false,
"possibility_of_env_change": "low",
"metadata": {
"input_files": [],
"steps": "1. 启动 OVITO 软件\n2. 在软件界面的三维视图区域，左键单击任意一个视口左上角的文本标签（例如 'Perspective'、'Top' 等）以打开视口菜单\n3. 在弹出的下拉菜单中，移动鼠标到列表底部\n4. 左键单击选中下拉菜单最底部的 'Configure Graphics...' 菜单项\n5. 确认屏幕上成功弹出标题为 'Viewport Graphics Configuration' 的对话框",
"steps_original": "1. 打开 OVITO 软件\n2. 点击任意一个视口左上角的文本标题打开视口菜单\n3. 点击菜单最底部的 \"Configure Graphics...\" 选项\n4. 确认屏幕上弹出了 \"Viewport Graphics Configuration\" 对话框，显示有关 OpenGL 实时渲染方法的配置选项"
}
}

47
evaluation_examples/examples/ovito/viewports_task2.json Normal file
View File

@@ -0,0 +1,47 @@
{
"id": "viewports_task2",
"snapshot": "ovito",
"instruction": "在 OVITO 中，加载 sample.dump 文件后，使用 Zoom scene extents 按钮使模型自适应缩放并居中显示。",
"source": "custom",
"config": [
{
"type": "launch",
"parameters": {
"command": [
"C:\\OVITO Basic\\ovito.exe"
]
}
},
{
"type": "sleep",
"parameters": {
"seconds": 5
}
}
],
"trajectory": "trajectories/",
"related_apps": [
"ovito"
],
"evaluator": {
"postconfig": [
{
"type": "sleep",
"parameters": {
"seconds": 3
}
}
],
"func": "vllm_eval"
},
"proxy": false,
"fixed_ip": false,
"possibility_of_env_change": "low",
"metadata": {
"input_files": [
"sample.dump"
],
"steps": "1. 在软件主界面的顶部菜单栏中，单击 \"File\" 菜单项\n2. 在展开的下拉菜单中，单击 \"Load File...\" 选项\n3. 在弹出的文件选择对话框中，单击选中 \"sample.dump\" 文件\n4. 在文件选择对话框的底部，单击 \"Open\" 按钮加载文件\n5. 将鼠标光标定位到主界面的 \"Perspective\" 3D 视口区域内\n6. 在 \"Perspective\" 视口区域内向下滚动鼠标滚轮，将显示的模型缩小\n7. 在视口下方的工具栏（Viewport toolbar）中，找到带有放大镜和虚线方框图标的 \"Zoom scene extents\" 按钮\n8. 单击该 \"Zoom scene extents\" 按钮\n9. 观察 \"Perspective\" 视口，确认模型已自动缩放并居中适应当前视口大小",
"steps_original": "1. 在 OVITO 中，加载 \"sample.dump\" 文件\n2. 使用鼠标滚轮向下滚动，将模型缩小，或按住右键拖动将模型移到视口边缘\n3. 点击视口工作区下方工具栏中的 \"Zoom scene extents\" 按钮（带放大镜和方框的图标）\n4. 确认模型自动缩放并居中适应当前视口的大小"
}
}

47
evaluation_examples/examples/ovito/viewports_task3.json Normal file
View File

@@ -0,0 +1,47 @@
{
"id": "viewports_task3",
"snapshot": "ovito",
"instruction": "在 OVITO 中，通过视口菜单将 Perspective 视图切换为 Top（顶视图）方向。",
"source": "custom",
"config": [
{
"type": "launch",
"parameters": {
"command": [
"C:\\OVITO Basic\\ovito.exe"
]
}
},
{
"type": "sleep",
"parameters": {
"seconds": 5
}
}
],
"trajectory": "trajectories/",
"related_apps": [
"ovito"
],
"evaluator": {
"postconfig": [
{
"type": "sleep",
"parameters": {
"seconds": 3
}
}
],
"func": "vllm_eval"
},
"proxy": false,
"fixed_ip": false,
"possibility_of_env_change": "low",
"metadata": {
"input_files": [
"sample.dump"
],
"steps": "1. 单击软件顶部菜单栏的 \"File\" 菜单项\n2. 在展开的下拉菜单中，单击选择 \"Load File\" 选项以打开文件浏览对话框\n3. 在文件浏览对话框中，选中 \"sample.dump\" 文件并单击 \"Open\" 或 \"打开\" 按钮完成 3D 模型数据加载\n4. 将鼠标光标定位到显示 3D 模型的视口区域，找到位于视口左上角的文本标签控件（当前显示文字为 \"Perspective\"）\n5. 单击该 \"Perspective\" 文本标签，打开视口配置下拉菜单\n6. 在弹出的下拉菜单中，将鼠标光标移动并悬停在 \"View Type\" 菜单项上，以触发并展开右侧的二级子菜单\n7. 在展开的二级子菜单列表中，单击选择 \"Top\" 菜单项\n8. 观察视口左上角，确认文本标签控件的文字已由 \"Perspective\" 变为 \"Top\"\n9. 观察视口主区域，确认相机视角已成功切换为从正上方俯视 3D 模型",
"steps_original": "1. 在 OVITO 中，加载 \"sample.dump\" 文件以显示 3D 模型\n2. 点击视口左上角的文本标题（默认显示为 \"Perspective\"）以打开视口菜单\n3. 在下拉菜单中，将鼠标悬停在 \"View Type\" 选项上以展开子菜单\n4. 在子菜单中点击选择 \"Top\"\n5. 确认视口标题变为 \"Top\"，且相机切换到从正上方俯视模型的视角"
}
}

47
evaluation_examples/examples/ovito/viewports_task4.json Normal file
View File

@@ -0,0 +1,47 @@
{
"id": "viewports_task4",
"snapshot": "ovito",
"instruction": "在 OVITO 中，通过视口菜单将当前视口的投影方式切换为 Ortho（正交投影）。",
"source": "custom",
"config": [
{
"type": "launch",
"parameters": {
"command": [
"C:\\OVITO Basic\\ovito.exe"
]
}
},
{
"type": "sleep",
"parameters": {
"seconds": 5
}
}
],
"trajectory": "trajectories/",
"related_apps": [
"ovito"
],
"evaluator": {
"postconfig": [
{
"type": "sleep",
"parameters": {
"seconds": 3
}
}
],
"func": "vllm_eval"
},
"proxy": false,
"fixed_ip": false,
"possibility_of_env_change": "low",
"metadata": {
"input_files": [
"sample.dump"
],
"steps": "1. 点击主界面顶部菜单栏的 \"File\" 菜单\n2. 在展开的下拉菜单中，单击选中 \"Load File\" 选项\n3. 在弹出的文件浏览对话框中，定位并单击选中 \"sample.dump\" 文件\n4. 单击文件浏览对话框底部的 \"Open\"（或打开）按钮加载文件\n5. 在主界面的 3D 视口区域，将鼠标移动到视口左上角的文本标题标签处（当前显示为 \"Perspective\" 或其他视图名称）\n6. 单击该文本标题标签，弹出视口设置下拉菜单\n7. 在弹出的下拉菜单中，将鼠标光标悬停在 \"View Type\" 菜单项上，以展开其右侧的二级子菜单\n8. 在展开的 \"View Type\" 二级子菜单中，向下移动鼠标并单击选中 \"Ortho\" 选项",
"steps_original": "1. 在 OVITO 中，加载 \"sample.dump\" 文件\n2. 点击视口左上角的文本标题打开视口菜单\n3. 在下拉菜单中，将鼠标悬停在 \"View Type\" 上展开子菜单\n4. 在子菜单中点击选择 \"Ortho\"\n5. 确认视口中模型的透视近大远小变形消失，呈现正交投影效果"
}
}

47
evaluation_examples/examples/ovito/viewports_task5.json Normal file
View File

@@ -0,0 +1,47 @@
{
"id": "viewports_task5",
"snapshot": "ovito",
"instruction": "在 OVITO 中，通过视口菜单开启 Preview Mode（预览模式），显示最终渲染的可见区域。",
"source": "custom",
"config": [
{
"type": "launch",
"parameters": {
"command": [
"C:\\OVITO Basic\\ovito.exe"
]
}
},
{
"type": "sleep",
"parameters": {
"seconds": 5
}
}
],
"trajectory": "trajectories/",
"related_apps": [
"ovito"
],
"evaluator": {
"postconfig": [
{
"type": "sleep",
"parameters": {
"seconds": 3
}
}
],
"func": "vllm_eval"
},
"proxy": false,
"fixed_ip": false,
"possibility_of_env_change": "low",
"metadata": {
"input_files": [
"sample.dump"
],
"steps": "1. 在软件主界面的顶部菜单栏中，单击 \"File\" 菜单项\n2. 在展开的下拉菜单中，单击 \"Load File...\" 选项\n3. 在弹出的文件选择对话框中，在文件列表区域单击选中 \"sample.dump\" 文件\n4. 单击文件选择对话框底部的 \"Open\" 按钮以加载文件\n5. 在 3D 视口区域的左上角，找到当前的视口文本标题控件（例如显示为 \"Perspective\"）\n6. 单击该文本标题控件，展开视口下拉菜单\n7. 在弹出的视口下拉菜单中，单击 \"Preview Mode\" 菜单项，将其切换为勾选状态\n8. 观察视口左上角的文本标题控件，确认文字已更新为包含 \"(preview)\" 字样（例如 \"Perspective (preview)\"）\n9. 观察视口内部显示区域，确认出现指示最终输出图像比例的可视区域边框，且四周呈现半透明遮罩效果",
"steps_original": "1. 在 OVITO 中，加载 \"sample.dump\" 文件\n2. 点击视口左上角的文本标题打开视口菜单\n3. 在下拉菜单中，点击 \"Preview Mode\" 选项使其处于打勾选中状态\n4. 确认视口标题旁出现 \"(preview)\" 字样，并且视口内出现指示最终输出图像比例的可视区域边框（四周可能有半透明遮罩）"
}
}

47
evaluation_examples/examples/ovito/viewports_task6.json Normal file
View File

@@ -0,0 +1,47 @@
{
"id": "viewports_task6",
"snapshot": "ovito",
"instruction": "在 OVITO 中，通过视口菜单取消 Constrain Rotation（约束旋转），以允许相机自由翻转。",
"source": "custom",
"config": [
{
"type": "launch",
"parameters": {
"command": [
"C:\\OVITO Basic\\ovito.exe"
]
}
},
{
"type": "sleep",
"parameters": {
"seconds": 5
}
}
],
"trajectory": "trajectories/",
"related_apps": [
"ovito"
],
"evaluator": {
"postconfig": [
{
"type": "sleep",
"parameters": {
"seconds": 3
}
}
],
"func": "vllm_eval"
},
"proxy": false,
"fixed_ip": false,
"possibility_of_env_change": "low",
"metadata": {
"input_files": [
"sample.dump"
],
"steps": "1. 在主界面顶部菜单栏中，单击 \"File\" 菜单。\n2. 在弹出的下拉菜单中，单击 \"Load File...\" 选项。\n3. 在弹出的文件选择对话框中，找到并单击选中 \"sample.dump\" 文件。\n4. 单击对话框右下角的 \"Open\"（或打开）按钮完成加载。\n5. 将鼠标光标移动到 3D 视口左上角，单击当前的视口标题文本标签（例如 \"Perspective\"）。\n6. 在弹出的视口下拉菜单中，查看 \"Constrain Rotation\" 选项的状态。\n7. 如果 \"Constrain Rotation\" 选项左侧带有勾号 (✓)，单击该选项以取消勾选。\n8. 将鼠标光标移动到视口中间的 3D 模型显示区域。\n9. 按住鼠标左键不放。\n10. 向任意方向拖动鼠标进行旋转，观察左下角的坐标轴，确认 Z 轴不再强制保持竖直，相机可以自由翻转。\n11. 确认效果后，松开鼠标左键。",
"steps_original": "1. 在 OVITO 中，加载 \"sample.dump\" 文件\n2. 点击视口左上角的文本标题打开视口菜单\n3. 检查 \"Constrain Rotation\" 选项，如果前面有勾号，则点击它以取消勾选\n4. 在视口中按住鼠标左键并随意拖动，确认 Z 轴坐标不再强制保持竖直向上，相机可以自由绕各个轴旋转"
}
}

47
evaluation_examples/examples/ovito/viewports_task7.json Normal file
View File

@@ -0,0 +1,47 @@
{
"id": "viewports_task7",
"snapshot": "ovito",
"instruction": "在 OVITO 中，通过视口菜单使用 Create Camera 为当前视口创建一个固定的相机对象。",
"source": "custom",
"config": [
{
"type": "launch",
"parameters": {
"command": [
"C:\\OVITO Basic\\ovito.exe"
]
}
},
{
"type": "sleep",
"parameters": {
"seconds": 5
}
}
],
"trajectory": "trajectories/",
"related_apps": [
"ovito"
],
"evaluator": {
"postconfig": [
{
"type": "sleep",
"parameters": {
"seconds": 3
}
}
],
"func": "vllm_eval"
},
"proxy": false,
"fixed_ip": false,
"possibility_of_env_change": "low",
"metadata": {
"input_files": [
"sample.dump"
],
"steps": "1. 单击主界面顶部菜单栏中的 \"File\" 菜单。\n2. 在弹出的下拉菜单中，单击 \"Load File...\" 选项。\n3. 在打开的文件选择对话框中，单击选中 \"sample.dump\" 文件。\n4. 单击对话框中的 \"打开\"（或 \"Open\"）按钮加载该文件。\n5. 将光标定位到主界面的 3D 视口（Viewport）区域内。\n6. 按住鼠标左键并拖动鼠标，旋转模型至目标观察视角。\n7. 松开鼠标左键，完成旋转操作。\n8. 滚动鼠标滚轮，放大或缩小模型以调整合适的视野范围。\n9. 将光标移动到当前视口左上角的文本标签控件（例如显示为 \"Perspective\" 的文字处）。\n10. 单击该文本标签控件，打开视口上下文菜单（Viewport menu）。\n11. 在弹出的主菜单列表中，将光标移动并悬停在 \"View Type\" 菜单项上，以展开其侧边子菜单。\n12. 在展开的侧边子菜单中，单击最底部的 \"Create Camera\" 选项。\n13. 查看界面右侧的数据管道（Data Pipeline）或控制面板，确认对象列表中已成功新增一个 \"Camera\" 节点。",
"steps_original": "1. 在 OVITO 中，加载 \"sample.dump\" 文件\n2. 使用鼠标左键拖动和滚轮缩放，将模型调整到一个特定的观察视角\n3. 点击当前视口左上角的文本标题打开视口菜单\n4. 在下拉菜单中点击 \"Create Camera\" 选项\n5. 确认在右侧的控制面板或数据管道中生成了一个新的 Camera 对象"
}
}

47
evaluation_examples/examples/ovito/viewports_task8.json Normal file
View File

@@ -0,0 +1,47 @@
{
"id": "viewports_task8",
"snapshot": "ovito",
"instruction": "在 OVITO 中，通过视口菜单打开 Adjust View 对话框，用于精确配置相机参数。",
"source": "custom",
"config": [
{
"type": "launch",
"parameters": {
"command": [
"C:\\OVITO Basic\\ovito.exe"
]
}
},
{
"type": "sleep",
"parameters": {
"seconds": 5
}
}
],
"trajectory": "trajectories/",
"related_apps": [
"ovito"
],
"evaluator": {
"postconfig": [
{
"type": "sleep",
"parameters": {
"seconds": 3
}
}
],
"func": "vllm_eval"
},
"proxy": false,
"fixed_ip": false,
"possibility_of_env_change": "low",
"metadata": {
"input_files": [
"sample.dump"
],
"steps": "1. 单击主界面顶部菜单栏的 \"File\" 菜单项\n2. 在弹出的 File 下拉菜单中，单击 \"Load File...\" 选项\n3. 在弹出的文件浏览对话框的文件列表中，单击选中 \"sample.dump\" 文件\n4. 单击文件浏览对话框右下角的 \"Open\" 按钮加载模型文件\n5. 在主界面的 3D 视口（Viewport）区域，将光标移动到视口左上角的文本标题控件（例如显示为 \"Perspective\" 的文字标签）\n6. 单击该文本标题控件，展开视口上下文下拉菜单\n7. 在弹出的下拉菜单中，向下移动鼠标并单击选中 \"Adjust View...\" 菜单项\n8. 确认屏幕上成功弹出了标题为 \"Adjust View\" 的对话框，并且对话框中显示了用于精确配置相机位置和方向的数值输入框",
"steps_original": "1. 在 OVITO 中，加载 \"sample.dump\" 文件\n2. 点击视口左上角的文本标题打开视口菜单\n3. 在下拉菜单中点击 \"Adjust View...\" 选项\n4. 确认屏幕上弹出了名为 \"Adjust View\" 的对话框，其中包含相机位置和方向的精确数值输入框"
}
}

45
evaluation_examples/examples/ovito/viewports_task9.json Normal file
View File

@@ -0,0 +1,45 @@
{
"id": "viewports_task9",
"snapshot": "ovito",
"instruction": "在 OVITO 中，通过视口的 Window Layout 菜单更改多视口的窗口布局排列方式。",
"source": "custom",
"config": [
{
"type": "launch",
"parameters": {
"command": [
"C:\\OVITO Basic\\ovito.exe"
]
}
},
{
"type": "sleep",
"parameters": {
"seconds": 5
}
}
],
"trajectory": "trajectories/",
"related_apps": [
"ovito"
],
"evaluator": {
"postconfig": [
{
"type": "sleep",
"parameters": {
"seconds": 3
}
}
],
"func": "vllm_eval"
},
"proxy": false,
"fixed_ip": false,
"possibility_of_env_change": "low",
"metadata": {
"input_files": [],
"steps": "1. 在操作系统中，双击 OVITO 软件快捷方式启动程序，并等待主界面加载完成（默认显示 2x2 的四个视口网格）\n2. 在主工作区中，将鼠标指针移动到任意一个视口的左上角区域\n3. 定位到该视口左上角的文本标签控件（例如显示为 \"Perspective\"、\"Top\" 或 \"Front\" 的文字）\n4. 左键单击该文本标签控件，以向下弹出视口上下文菜单\n5. 在弹出的下拉菜单列表中，向下移动鼠标指针，定位到名为 \"Window Layout\" 的菜单项\n6. 将鼠标指针悬停在 \"Window Layout\" 菜单项上，等待其右侧弹出包含不同布局方式的子菜单\n7. 在展开的布局子菜单中，将鼠标指针移动到一个非默认的布局选项上（例如表示单视口或上下左右双分视口的图标/文本）\n8. 左键单击选中的布局选项，以应用该布局设置\n9. 观察软件主工作区，确认视口网格的数量和排列方式已从默认的 2x2 变为刚才选定的布局方式",
"steps_original": "1. 打开 OVITO 软件，默认主工作区显示 2x2 的四个视口网格\n2. 点击任意一个视口左上角的文本标题打开视口菜单\n3. 将鼠标悬停在 \"Window Layout\" 选项上以展开布局子菜单\n4. 从子菜单中选择一个非默认的布局方式（例如选择上下对分的双视口图标或单视口图标）\n5. 确认主工作区的视口数量和排列布局已根据选择发生改变"
}
}

47
evaluation_examples/examples/pymol/Mutagenesis_task1.json Normal file
View File

@@ -0,0 +1,47 @@
{
"id": "Mutagenesis_task1",
"snapshot": "pymol",
"instruction": "在 PyMOL 中，打开 sample.pdb 文件，使用 Mutagenesis 向导将指定的残基突变为目标残基，并应用所需的旋转异构体构象。",
"source": "custom",
"config": [
{
"type": "launch",
"parameters": {
"command": [
"C:\\PYMOL\\PyMOLWin.exe"
]
}
},
{
"type": "sleep",
"parameters": {
"seconds": 5
}
}
],
"trajectory": "trajectories/",
"related_apps": [
"pymol"
],
"evaluator": {
"postconfig": [
{
"type": "sleep",
"parameters": {
"seconds": 3
}
}
],
"func": "vllm_eval"
},
"proxy": false,
"fixed_ip": false,
"possibility_of_env_change": "low",
"metadata": {
"input_files": [
"sample.pdb"
],
"steps": "1. 单击顶部菜单栏的 \"File\" 菜单\n2. 在展开的下拉菜单中，单击 \"Open...\" 选项\n3. 在弹出的文件选择对话框中，单击选中 \"sample.pdb\" 文件\n4. 单击文件选择对话框右下角的 \"Open\" 按钮以加载该文件\n5. 单击顶部菜单栏的 \"Wizard\" 菜单\n6. 在展开的下拉菜单中，单击 \"Mutagenesis\" 选项\n7. 在中心的 3D 视图窗口中，单击鼠标左键选中一个需要突变的残基\n8. 在界面右侧出现的向导控制面板中，单击标有 \"No Mutation\" 的按钮\n9. 在弹出的残基类型列表中，单击选中想要突变生成的目标残基类型\n10. 在界面右下角的帧控制区域，单击向左或向右的播放箭头按钮以切换并预览不同的旋转异构体（rotamer）\n11. 在界面右侧的向导控制面板中，单击 \"Apply\" 按钮以应用选中的突变构象\n12. 在界面右侧的向导控制面板中，单击 \"Done\" 按钮以退出突变向导",
"steps_original": "1. 通过 File → Open 打开本地的 sample.pdb 文件\n2. 点击顶部菜单栏的 Wizard → Mutagenesis 启动突变向导\n3. 在 3D 视图窗口中，鼠标点击选中一个需要突变的残基\n4. 在右侧的向导控制面板中，点击显示为 \"No Mutation\" 的按钮，并从弹出的列表中选择想要突变生成的新残基类型\n5. 使用界面右下角的帧控制按钮（back-and-forth movie controls）前后切换，预览并选择一个合适的旋转异构体（rotamer）\n6. 在右侧向导控制面板中点击 Apply 应用该突变\n7. 点击面板上的 Done 退出突变向导"
}
}

47
evaluation_examples/examples/pymol/Visualizing_a_computed_structure_-_a_commented_example_task1.json Normal file
View File

@@ -0,0 +1,47 @@
{
"id": "Visualizing_a_computed_structure_-_a_commented_example_task1",
"snapshot": "pymol",
"instruction": "在 PyMOL 中，通过菜单打开 theFile.xyz 文件，然后将其另存为 PDB 格式的文件。",
"source": "custom",
"config": [
{
"type": "launch",
"parameters": {
"command": [
"C:\\PYMOL\\PyMOLWin.exe"
]
}
},
{
"type": "sleep",
"parameters": {
"seconds": 5
}
}
],
"trajectory": "trajectories/",
"related_apps": [
"pymol"
],
"evaluator": {
"postconfig": [
{
"type": "sleep",
"parameters": {
"seconds": 3
}
}
],
"func": "vllm_eval"
},
"proxy": false,
"fixed_ip": false,
"possibility_of_env_change": "low",
"metadata": {
"input_files": [
"theFile.xyz"
],
"steps": "1. 双击桌面或开始菜单中的 PyMOL 应用程序图标以启动软件\n2. 单击 PyMOL 主窗口顶部菜单栏中的 \"File\" 菜单\n3. 在展开的下拉菜单中，单击选择 \"Open...\" 菜单项\n4. 在弹出的文件浏览对话框中，在文件列表区域找到并单击选中 \"theFile.xyz\" 文件\n5. 单击对话框右下角的 \"打开\" (或 \"Open\") 按钮以加载该文件\n6. 待文件加载完毕后，再次单击顶部菜单栏中的 \"File\" 菜单\n7. 在展开的下拉菜单中，单击选择 \"Export Molecule...\" 菜单项\n8. 在弹出的 \"Export Molecule\" 选项对话框中，无需修改参数，直接单击对话框右下方的 \"Save...\" 按钮\n9. 在弹出的文件保存对话框中，单击 \"保存类型\" (或 \"Save as type\") 对应的下拉菜单\n10. 在展开的格式列表中，单击选中包含 PDB 格式的选项（例如 \"Protein Data Bank (*.pdb)\"）\n11. 单击 \"文件名\" (或 \"File name\") 输入框将光标定位至此处\n12. 在输入框中输入你想要保存的文件名（例如 \"theFile\"）\n13. 单击对话框右下角的 \"保存\" (或 \"Save\") 按钮完成文件格式转换与保存",
"steps_original": "1. 启动 PyMOL 软件\n2. 点击顶部菜单栏的 File -> Open...\n3. 在文件浏览对话框中选择并打开 theFile.xyz 文件\n4. 点击顶部菜单栏的 File -> Export Molecule... (或 Save Molecule...)\n5. 在弹出的选项框中保持默认，点击 Save...\n6. 在文件保存对话框中，将文件类型选择为 PDB 格式，输入文件名并点击保存"
}
}

47
evaluation_examples/examples/pymol/Visualizing_a_computed_structure_-_a_commented_example_task2.json Normal file
View File

@@ -0,0 +1,47 @@
{
"id": "Visualizing_a_computed_structure_-_a_commented_example_task2",
"snapshot": "pymol",
"instruction": "在 PyMOL 的命令行中，使用 '@' 命令运行名为 script.pml 的外部脚本文件以更新分子可视化。",
"source": "custom",
"config": [
{
"type": "launch",
"parameters": {
"command": [
"C:\\PYMOL\\PyMOLWin.exe"
]
}
},
{
"type": "sleep",
"parameters": {
"seconds": 5
}
}
],
"trajectory": "trajectories/",
"related_apps": [
"pymol"
],
"evaluator": {
"postconfig": [
{
"type": "sleep",
"parameters": {
"seconds": 3
}
}
],
"func": "vllm_eval"
},
"proxy": false,
"fixed_ip": false,
"possibility_of_env_change": "low",
"metadata": {
"input_files": [
"script.pml"
],
"steps": "1. 在 PyMOL 主界面的命令输入框（通常位于界面上方或下方，带有 \"PyMOL>\" 提示符）上单击鼠标左键，将光标聚焦于此输入框\n2. 在命令输入框中，输入文本：@PATH_Of_The_Script/script.pml（实际操作时需将 PATH_Of_The_Script 替换为脚本所在目录的真实路径）\n3. 按下键盘上的 \"Enter\" (回车) 键以执行该命令\n4. 观察 PyMOL 主视图窗口，确认分子结构已根据脚本指令重新渲染（如教程图片所示）",
"steps_original": "1. 启动 PyMOL 软件\n2. 找到 PyMOL 主窗口上方的命令输入行 (通常以 PyMOL> 开头)\n3. 在命令行中输入 '@script.pml'（或加上该脚本的具体路径，如 '@PATH_Of_The_Script/script.pml'）\n4. 按下回车键执行该脚本\n5. 观察主视图窗口，确认分子结构已根据脚本指令重新渲染"
}
}

45
evaluation_examples/examples/pymol/Visualizing_a_computed_structure_-_a_commented_example_task3.json Normal file
View File

@@ -0,0 +1,45 @@
{
"id": "Visualizing_a_computed_structure_-_a_commented_example_task3",
"snapshot": "pymol",
"instruction": "在 PyMOL 的命令行中，使用 png 命令将当前的分子三维渲染图保存为名为 'filename.png' 的图像文件。",
"source": "custom",
"config": [
{
"type": "launch",
"parameters": {
"command": [
"C:\\PYMOL\\PyMOLWin.exe"
]
}
},
{
"type": "sleep",
"parameters": {
"seconds": 5
}
}
],
"trajectory": "trajectories/",
"related_apps": [
"pymol"
],
"evaluator": {
"postconfig": [
{
"type": "sleep",
"parameters": {
"seconds": 3
}
}
],
"func": "vllm_eval"
},
"proxy": false,
"fixed_ip": false,
"possibility_of_env_change": "low",
"metadata": {
"input_files": [],
"steps": "1. 在 PyMOL 主界面中，找到用于输入命令的文本输入框。\n2. 单击该文本输入框，使其获得光标焦点。\n3. 在文本输入框中，输入文本：png filename.png\n4. 按下键盘上的 Enter (回车) 键以执行该命令。",
"steps_original": "1. 确保 PyMOL 三维视图窗口中已经显示了渲染好的分子结构\n2. 找到 PyMOL 主窗口上方的命令输入行\n3. 在命令行中输入命令：'png filename.png'\n4. 按下回车键执行\n5. 检查工作目录，确认名为 filename.png 的图像文件已成功生成"
}
}