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JSON
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JSON
{
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"id": "building-metal-complexes_task3",
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"snapshot": "avogadro",
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"instruction": "在 Avogadro 2 中，使用 Template Tool 创建 [Ni(en)(NH3)2]2+ 配位化合物，设置为平面四方配位几何。",
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"source": "custom",
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"config": [
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{
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"type": "launch",
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"parameters": {
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"command": [
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"C:\\Avogadro2\\bin\\avogadro2.exe"
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]
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}
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},
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{
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"type": "sleep",
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"parameters": {
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"seconds": 5
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||
}
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}
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],
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"trajectory": "trajectories/",
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"related_apps": [
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"avogadro"
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||
],
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"evaluator": {
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"postconfig": [
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||
{
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"type": "sleep",
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"parameters": {
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"seconds": 3
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||
}
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||
}
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||
],
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"func": "vllm_eval"
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||
},
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"proxy": false,
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"fixed_ip": false,
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"possibility_of_env_change": "low",
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"metadata": {
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"input_files": [],
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"steps": "1. 在顶部工具栏中，单击 'Template Tool' 图标按钮（或在键盘上按 Ctrl+3 快捷键）以激活模板工具面板。\n2. 在弹出的模板工具面板中，单击顶部名为 'Centers' 的选项卡。\n3. 在键盘上依次输入字母键 'N' 和 'i'，或单击元素下拉菜单并选择 'Nickel'，以选中镍元素。\n4. 在形式电荷（形式电荷）数值框旁，连续单击向上箭头（'^'）按钮两次，将中心离子的形式电荷从 0 调整为 '+2'。\n5. 单击坐标（坐标）下拉菜单将其展开，在弹出的选项列表中选择 '4: Square Planar'，以设置平面四方配位几何构型。\n6. 将鼠标移动到 3D 模型视图的空白区域，单击鼠标左键以放置带有四个占位氢原子的镍中心。\n7. 在模板工具面板中，单击顶部名为 'Ligands' 的选项卡切换到配体模式。\n8. 在键盘上依次输入字母键 'e' 和 'n'，以在配体库中选中 'ethylenediamine' (乙二胺) 配体。\n9. 在 3D 视图中，单击选中中心镍原子周围的任意一个氢原子。\n10. 在 3D 视图中，单击与上一步选中的氢原子相邻（顺式位置）的另一个氢原子，完成双齿配体的桥接结合。\n11. 在模板工具面板中，单击 '类型（Type）' 下拉菜单，将配体类型从 'Bidentate'（双齿）切换为 'Monodentate'（单齿），然后单击 'Ligand' 下拉菜单并选择 'ammine'（氨）配体。\n12. 在 3D 视图中，单击剩余的第三个占位氢原子将其替换为氨配体。\n13. 在 3D 视图中，单击最后一个剩余的氢原子，将其替换为第二个氨配体，完成目标化合物构建。",
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"steps_original": "1. 打开 Template Tool。\n2. 切换到 Centers 选项卡。\n3. 输入 'Ni' 或从弹出菜单中选择镍元素。\n4. 连续单击形式电荷数值框旁的向上箭头（'^'）按钮两次，将正电荷设置为 +2。\n5. 单击坐标下拉菜单将其展开，在列表中选择 '4: Square Planar' 平面四方几何形状。\n6. 点击空白区域，放置镍中心，四个氢原子会显示在配位位置。"
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}
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}
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