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3.0 KiB
JSON
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JSON
{
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"id": "building-metal-complexes_task1",
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"snapshot": "avogadro",
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"instruction": "在 Avogadro 2 中，使用 Template Tool 创建 [Co(NH3)6]3+ 配位化合物，设置为八面体配位几何。",
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"source": "custom",
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"config": [
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{
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"type": "launch",
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"parameters": {
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"command": [
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"C:\\Avogadro2\\bin\\avogadro2.exe"
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]
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}
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},
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{
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"type": "sleep",
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"parameters": {
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"seconds": 5
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||
}
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||
}
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],
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"trajectory": "trajectories/",
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"related_apps": [
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"avogadro"
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||
],
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"evaluator": {
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"postconfig": [
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||
{
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"type": "sleep",
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||
"parameters": {
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"seconds": 3
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||
}
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||
}
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||
],
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"func": "vllm_eval"
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||
},
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"proxy": false,
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"fixed_ip": false,
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"possibility_of_env_change": "low",
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"metadata": {
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"input_files": [],
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"steps": "1. 按下键盘快捷键 Ctrl+3（或在顶部工具栏中单击 Template Tool 图标），激活模板工具。\n2. 在左侧（或右侧）的模板工具控制面板中，单击选中 Centers 选项卡。\n3. 在键盘上依次输入字母 C 和 o，以选择 Cobalt (钴) 元素作为金属中心。\n4. 在形式电荷输入框旁，连续单击三次向上箭头（∧）按钮，将中心离子的形式电荷设置为 +3。\n5. 单击坐标下拉框，选择 6: Octahedral（八面体）选项，设定配位几何形状为八面体。\n6. 将鼠标移动到主界面的 3D 视图空白区域，单击鼠标左键，放置带有六个配位氢原子的钴中心结构。\n7. 在模板工具控制面板中，单击选中 Ligands 选项卡。\n8. 单击 Ligand 下拉框，从列表中选择 ammine (NH3) 配体。\n9. 在 3D 视图中，将鼠标悬停并单击钴原子上的第 1 个氢原子，将其替换为氨配体。\n10. 若有氢原子被遮挡，按下 Ctrl+1 切换至导航视角，拖动鼠标旋转分子，使目标氢原子可见，再切换回 Ctrl+3 模板工具后单击钴原子上的第 2 个氢原子，将其替换为氨配体。\n11. 重复上述操作（必要时按 Ctrl+1 旋转视角后切回 Ctrl+3），单击钴原子上的第 3 个氢原子，将其替换为氨配体。\n12. 重复上述操作（必要时按 Ctrl+1 旋转视角后切回 Ctrl+3），单击钴原子上的第 4 个氢原子，将其替换为氨配体。\n13. 重复上述操作（必要时按 Ctrl+1 旋转视角后切回 Ctrl+3），单击钴原子上的第 5 个氢原子，将其替换为氨配体。\n14. 重复上述操作（必要时按 Ctrl+1 旋转视角后切回 Ctrl+3），单击钴原子上的第 6 个氢原子，将其替换为氨配体，完成 [Co(NH3)6]3+ 化合物的构建。",
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"steps_original": "1. 打开 Template Tool（快捷键 Ctrl+3 或点击工具栏图标）。\n2. 切换到 Centers 选项卡。\n3. 输入 'Co' 或从弹出菜单中选择钴元素。\n4. 点击三次 '+' 符号，将正电荷设置为 +3。\n5. 按键 '6' 或选择八面体几何形状。\n6. 点击空白区域，放置钴中心，六个氢原子会显示在配位位置。"
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}
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}
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